21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5359 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_5359  cyclic nucleotide-binding protein  100 
 
 		 321 aa  632  1e-180  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5189  ERCC4 domain-containing protein  71.12 
 
 		 325 aa  452  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12549  hypothetical protein  61.37 
 
 		 463 aa  394  1e-108  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0306994 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2880  ERCC4 domain protein  51.83 
 
 		 322 aa  312  5.999999999999999e-84  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00644974  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3806  ERCC4 domain-containing protein  55.16 
 
 		 330 aa  310  2e-83  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1537  hypothetical protein  28.29 
 
 		 354 aa  114  2.0000000000000002e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.578117  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1923  hypothetical protein  38.67 
 
 		 160 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00139334  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3788  ERCC4 domain-containing protein  38.67 
 
 		 160 aa  81.6  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.556547 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0905  hypothetical protein  35.14 
 
 		 158 aa  73.9  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0333285  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2504  hypothetical protein  34.18 
 
 		 178 aa  65.9  0.0000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3998  hypothetical protein  34.31 
 
 		 159 aa  64.7  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00055728  normal  0.691917 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2422  hypothetical protein  34.31 
 
 		 159 aa  64.7  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0381334  normal  1 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4379  ERCC4  29.49 
 
 		 190 aa  54.3  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0363  ERCC4 domain-containing protein  30.94 
 
 		 212 aa  50.8  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0376  ERCC4 domain-containing protein  30.94 
 
 		 212 aa  50.8  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.264016 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0086  hypothetical protein  33.87 
 
 		 177 aa  47  0.0005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.176439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0706  Hef nuclease  25.64 
 
 		 776 aa  45.1  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.619505  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0374  ERCC4 domain-containing protein  31.47 
 
 		 212 aa  43.9  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000467735 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1278  Hef nuclease  25.45 
 
 		 751 aa  43.5  0.004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.000986407  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3417  hypothetical protein  51.52 
 
 		 111 aa  43.5  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0183  Hef nuclease  26.36 
 
 		 749 aa  42.7  0.008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.818144  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>