30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2725 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_2725  hypothetical protein  100 
 
 
109 aa  210  4.9999999999999996e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2945  Luciferase-like monooxygenase  62.07 
 
 
348 aa  80.5  0.000000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000294064  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1478  luciferase family protein  57.14 
 
 
346 aa  69.3  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4941  luciferase family protein  53.97 
 
 
345 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0837343  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1388  luciferase-like monooxygenase  47.62 
 
 
344 aa  59.7  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.145304 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1137  luciferase-like protein  47.62 
 
 
349 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1154  luciferase family protein  47.62 
 
 
349 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0898385  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1164  luciferase family protein  47.62 
 
 
349 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.224617  normal  0.408593 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4576  putative oxidoreductase  51.72 
 
 
355 aa  58.9  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.248726  normal  0.45285 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2391  luciferase-like  49.21 
 
 
351 aa  58.5  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.452621  normal  0.0183444 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4515  putative F420-dependent oxidoreductase  47.62 
 
 
346 aa  58.2  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3612  luciferase family protein  45.61 
 
 
342 aa  57  0.00000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3523  Luciferase-like monooxygenase  48.28 
 
 
349 aa  56.6  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.551464  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1995  putative F420-dependent oxidoreductase  46.77 
 
 
346 aa  56.6  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.335211  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2848  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  46.55 
 
 
346 aa  54.3  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.59341  normal  0.0111399 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1057  putative F420-dependent oxidoreductase  43.1 
 
 
354 aa  49.7  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2317  luciferase family protein  40.32 
 
 
350 aa  48.9  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00863612 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20020  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  46.81 
 
 
351 aa  48.1  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00294478 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2163  luciferase family protein  38.71 
 
 
350 aa  48.1  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1542  luciferase family protein  42 
 
 
349 aa  47.4  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.240997  normal  0.654342 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1519  luciferase-like protein  42 
 
 
349 aa  47.4  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3206  putative F420-dependent oxidoreductase  36.51 
 
 
346 aa  46.6  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3409  luciferase family protein  44.9 
 
 
346 aa  45.4  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0981332 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1533  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  48.94 
 
 
323 aa  43.9  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0482478  normal  0.0346737 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3116  putative F420-dependent oxidoreductase  41.82 
 
 
344 aa  43.9  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.270575  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0980  putative oxidoreductase  41.46 
 
 
345 aa  42.7  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4793  Luciferase-like monooxygenase  36.73 
 
 
349 aa  42.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6491  luciferase family protein  46.15 
 
 
336 aa  42  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.988125  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0860  Luciferase-like monooxygenase  53.33 
 
 
342 aa  41.2  0.004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2504  putative F420-dependent oxidoreductase  31.75 
 
 
344 aa  40  0.01  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>