More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2462 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_2462  serine/threonine protein kinase  100 
 
 
775 aa  1538    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00574748  normal  0.765931 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2811  serine/threonine protein kinase  57.86 
 
 
730 aa  733    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4944  serine/threonine protein kinase  44.74 
 
 
763 aa  449  1.0000000000000001e-124  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.208032  normal  0.80492 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2424  serine/threonine protein kinase  42.49 
 
 
785 aa  412  1e-113  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0271655  normal  0.0697839 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37200  protein kinase family protein  38.68 
 
 
832 aa  400  9.999999999999999e-111  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.428685  normal  0.174453 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4555  serine/threonine protein kinase  35.09 
 
 
776 aa  386  1e-106  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.550523 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3064  serine/threonine protein kinase  38.32 
 
 
785 aa  358  1.9999999999999998e-97  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.790992  hitchhiker  0.000000827002 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2161  serine/threonine protein kinase  37.54 
 
 
765 aa  355  2e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0181  serine/threonine protein kinase  36.44 
 
 
774 aa  352  2e-95  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3509  serine/threonine protein kinase  39.04 
 
 
1011 aa  348  3e-94  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4405  serine/threonine protein kinase  38.73 
 
 
781 aa  337  5e-91  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.42637  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3755  serine/threonine protein kinase  35.29 
 
 
773 aa  312  2e-83  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.512149  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4396  Serine/threonine protein kinase-related protein  32.93 
 
 
867 aa  306  1.0000000000000001e-81  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.958962  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0530  serine/threonine protein kinase  32.22 
 
 
759 aa  303  1e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0540  serine/threonine protein kinase  33.57 
 
 
759 aa  301  4e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.623105  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0552  serine/threonine protein kinase  33.57 
 
 
759 aa  301  4e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.274809  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0202  protein kinase  33.15 
 
 
766 aa  297  6e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.103955  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10415  serine/threonine-protein kinase pknG  33.56 
 
 
750 aa  293  1e-77  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000100112  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0703  protein kinase  33 
 
 
755 aa  286  9e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00413677 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0399  serine/threonine protein kinase  36.23 
 
 
707 aa  279  1e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2531  serine/threonine protein kinase  37.61 
 
 
758 aa  170  1e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0370  serine/threonine protein kinase  34.83 
 
 
444 aa  144  4e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.519534  hitchhiker  0.00254461 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0927  serine/threonine protein kinase  32.75 
 
 
553 aa  107  6e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00180  protein kinase family protein with PASTA domain  32.33 
 
 
951 aa  106  2e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.000304613  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4391  Serine/threonine protein kinase  33.21 
 
 
546 aa  103  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000198345 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0441  serine/threonine protein kinase  33.45 
 
 
444 aa  102  3e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0406946  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0754  serine/threonine protein kinase  30 
 
 
437 aa  100  7e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.564143 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0667  serine/threonine protein kinase  31.56 
 
 
636 aa  100  8e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0717  serine/threonine protein kinase  30.67 
 
 
861 aa  100  8e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000196708  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5188  serine/threonine protein kinase  30.28 
 
 
625 aa  99.4  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0899  serine/threonine protein kinase  30 
 
 
499 aa  98.6  4e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000818625  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2098  protein kinase  31.14 
 
 
620 aa  98.2  5e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1709  serine/threonine protein kinase  31.36 
 
 
453 aa  97.4  8e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.366851  normal  0.0986439 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0497  serine/threonine protein kinase  31.35 
 
 
531 aa  97.4  8e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0319  serine/threonine protein kinase  28.57 
 
 
651 aa  96.7  1e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2336  protein kinase  28.57 
 
 
684 aa  97.1  1e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1309  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.66 
 
 
517 aa  96.3  2e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3345  serine/threonine protein kinase  28.14 
 
 
629 aa  96.3  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.377142  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2082  serine/threonine protein kinase  27.65 
 
 
625 aa  95.9  2e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0990  serine/threonine protein kinase  28.19 
 
 
486 aa  95.9  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000407261  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3883  serine/threonine protein kinase  31.95 
 
 
344 aa  95.9  3e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.48482  normal  0.588424 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1392  serine/threonine kinase protein  27.36 
 
 
623 aa  95.9  3e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0801  serine/threonine protein kinase  33.75 
 
 
471 aa  95.5  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0491  serine/threonine protein kinase  29.17 
 
 
1070 aa  94.4  8e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.424967 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1528  serine/threonine protein kinase  29.05 
 
 
601 aa  94.4  8e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4235  serine/threonine protein kinase  28.72 
 
 
381 aa  94.4  8e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3340  serine/threonine protein kinase  26.89 
 
 
490 aa  93.6  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2621  serine/threonine protein kinase  30.87 
 
 
419 aa  93.2  1e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.576747  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1991  protein kinase  26.51 
 
 
692 aa  93.6  1e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1169  protein kinase  27.15 
 
 
634 aa  93.6  1e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000304799  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4072  serine/threonine protein kinase  27.63 
 
 
639 aa  92.8  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.228125  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4035  serine/threonine protein kinase  27.63 
 
 
639 aa  92.8  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1225  serine/threonine protein kinase with FHA domain protein  27.57 
 
 
403 aa  93.2  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.553503 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4042  Serine/threonine protein kinase-related protein  29.63 
 
 
528 aa  93.2  2e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0621  serine/threonine kinase protein  26.8 
 
 
407 aa  92.8  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.109473  hitchhiker  0.00845056 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3423  serine/threonine protein kinase  30.26 
 
 
509 aa  92.8  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.931236  normal  0.508878 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1957  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  29.11 
 
 
668 aa  92.8  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1709  serine/threonine protein kinase  26.17 
 
 
691 aa  92.4  3e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0991  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.18 
 
 
551 aa  92.4  3e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2393  serine/threonine protein kinase  29.12 
 
 
457 aa  92.4  3e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.380399  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1588  protein kinase  26.84 
 
 
604 aa  92.4  3e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3788  serine/threonine protein kinase  27.45 
 
 
505 aa  91.7  5e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.987521  normal  0.0424994 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3893  protein kinase  27.45 
 
 
502 aa  91.7  5e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6676  Serine/threonine protein kinase-like protein  30.03 
 
 
678 aa  91.3  7e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.520926  normal  0.364825 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2290  serine/threonine protein kinase  31.58 
 
 
560 aa  90.9  8e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.770072 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3876  serine/threonine protein kinase  34.18 
 
 
565 aa  90.9  8e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.191754 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0097  serine/threonine protein kinase  32.19 
 
 
675 aa  90.9  8e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.255203  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3600  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  32.93 
 
 
1072 aa  90.5  9e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1602  protein kinase:GAF  30.39 
 
 
790 aa  90.9  9e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.711215  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5797  serine/threonine protein kinase  28.88 
 
 
707 aa  90.9  9e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1067  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  28.57 
 
 
653 aa  90.1  1e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4391  serine/threonine protein kinase  36.94 
 
 
915 aa  90.1  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1423  serine/threonine protein kinase  30.82 
 
 
776 aa  90.1  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.806677 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0943  serine/threonine protein kinase  31.47 
 
 
468 aa  89.4  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00674899  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1511  serine/threonine kinase protein  27.15 
 
 
641 aa  89.4  2e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1383  serine/threonine protein kinase  29.54 
 
 
690 aa  89.4  2e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.149944  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4041  serine/threonine protein kinase  27.59 
 
 
774 aa  89.7  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.224391  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2767  protein kinase  27.61 
 
 
457 aa  89.4  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4458  serine/threonine protein kinase  29.36 
 
 
573 aa  89  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.776532  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5305  serine/threonine protein kinase  30.67 
 
 
645 aa  89  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.704424  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3543  serine/threonine protein kinase  29.51 
 
 
537 aa  88.6  4e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0435506  normal  0.170453 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4118  serine/threonine protein kinase  27.27 
 
 
888 aa  88.6  4e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.116559  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0015  serine/threonine protein kinase  28.08 
 
 
624 aa  88.2  5e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.230646  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0423  serine/threonine protein kinase  28.21 
 
 
668 aa  88.2  5e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0112256  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0789  serine/threonine kinase protein  27.78 
 
 
614 aa  88.2  5e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.350319  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0023  serine/threonine protein kinase  28.08 
 
 
624 aa  88.2  5e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0133871 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0015  serine/threonine protein kinase  28.08 
 
 
624 aa  88.2  5e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.243084 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0789  protein kinase  30.39 
 
 
621 aa  88.2  5e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2528  serine/threonine protein kinase  33.01 
 
 
266 aa  88.2  5e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00115723  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0044  serine/threonine protein kinase  30.82 
 
 
863 aa  87.8  6e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0701705  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0794  serine/threonine protein kinase  30.39 
 
 
623 aa  88.2  6e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.779291  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5007  serine/threonine protein kinase  30.18 
 
 
430 aa  88.2  6e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0107598  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0809  protein kinase  30.39 
 
 
623 aa  88.2  6e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.386876  normal  0.0684467 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5095  serine/threonine protein kinase  30.18 
 
 
430 aa  88.2  6e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0903358  normal  0.72851 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5388  serine/threonine protein kinase  30.18 
 
 
431 aa  88.2  6e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0418961  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1535  Serine/threonine protein kinase-related protein  29.02 
 
 
515 aa  87.8  7e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.337625  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1683  serine/threonine protein kinase  31.71 
 
 
776 aa  87.8  7e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3730  serine/threonine protein kinase  26.1 
 
 
687 aa  87.4  8e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00433941 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1433  protein kinase  33.04 
 
 
963 aa  87.8  8e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.698997  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1172  protein kinase  29.73 
 
 
451 aa  87.4  8e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.190918  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>