66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1894 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_1894  hypothetical protein  100 
 
 
367 aa  701    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.143005  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6445  hypothetical protein  37.19 
 
 
412 aa  167  2.9999999999999998e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0946516  normal  0.0409741 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1330  hypothetical protein  39.88 
 
 
353 aa  163  5.0000000000000005e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.789559  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4328  hypothetical protein  38.37 
 
 
353 aa  146  7.0000000000000006e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0822537 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0878  hypothetical protein  24.08 
 
 
357 aa  135  9.999999999999999e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2734  hypothetical protein  33.74 
 
 
378 aa  135  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00345786 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5001  hypothetical protein  27.86 
 
 
352 aa  125  9e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0712295  normal  0.0100104 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6013  hypothetical protein  36.69 
 
 
342 aa  124  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.994195  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3022  hypothetical protein  30.45 
 
 
395 aa  117  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.628375  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3338  hypothetical protein  32.95 
 
 
395 aa  114  3e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.33185  normal  0.571531 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1325  hypothetical protein  31.66 
 
 
383 aa  105  1e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.397251  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5273  hypothetical protein  25.07 
 
 
357 aa  99.8  7e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2788  hypothetical protein  28.45 
 
 
369 aa  99.8  7e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3547  hypothetical protein  32.84 
 
 
412 aa  98.6  1e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.412698 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4094  hypothetical protein  31.45 
 
 
389 aa  98.2  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.9215  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4070  hypothetical protein  31.14 
 
 
365 aa  92.4  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0178352  normal  0.419833 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0441  hypothetical protein  29.18 
 
 
373 aa  89.7  7e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.22704 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02110  hypothetical protein  34.29 
 
 
384 aa  88.2  2e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.447654  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4303  hypothetical protein  32.88 
 
 
374 aa  85.9  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3523  hypothetical protein  32.43 
 
 
375 aa  85.1  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2728  hypothetical protein  28.94 
 
 
367 aa  85.1  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.683635  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2452  hypothetical protein  30.99 
 
 
384 aa  85.1  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000678716  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4150  hypothetical protein  32.79 
 
 
374 aa  84.7  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3001  hypothetical protein  29.19 
 
 
355 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0393285  normal  0.0371418 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0975  hypothetical protein  30.13 
 
 
377 aa  80.9  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5461  hypothetical protein  29.97 
 
 
367 aa  80.5  0.00000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.898004  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1617  hypothetical protein  29.53 
 
 
391 aa  79.7  0.00000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.862313  normal  0.915931 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0405  hypothetical protein  28.45 
 
 
394 aa  79  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.499307  normal  0.272447 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5370  hypothetical protein  32.11 
 
 
371 aa  78.6  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.861425 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3435  protein of unknown function DUF1006  28.44 
 
 
382 aa  78.2  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2986  hypothetical protein  29.19 
 
 
355 aa  78.6  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.223704  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3030  hypothetical protein  29.19 
 
 
355 aa  78.6  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4736  hypothetical protein  29.4 
 
 
366 aa  78.6  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.968842 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5246  hypothetical protein  31.98 
 
 
366 aa  78.6  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.422141 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0019  hypothetical protein  29.89 
 
 
389 aa  78.2  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0164  hypothetical protein  29.67 
 
 
355 aa  77.4  0.0000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5047  hypothetical protein  30.6 
 
 
374 aa  75.9  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7095  hypothetical protein  31.17 
 
 
362 aa  74.3  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2792  hypothetical protein  28.99 
 
 
362 aa  73.9  0.000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0226993  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1410  hypothetical protein  34.93 
 
 
352 aa  73.2  0.000000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.246412  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3370  hypothetical protein  29.17 
 
 
368 aa  72.4  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.357323 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3488  hypothetical protein  31.28 
 
 
355 aa  71.6  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3510  hypothetical protein  30.89 
 
 
404 aa  70.9  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0541422  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1142  hypothetical protein  20.05 
 
 
372 aa  68.2  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.561604  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4281  hypothetical protein  31.27 
 
 
374 aa  68.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.355185  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2094  hypothetical protein  29.01 
 
 
370 aa  67  0.0000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0155004  normal  0.0950605 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3454  hypothetical protein  30.2 
 
 
396 aa  66.2  0.0000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.863709  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4984  hypothetical protein  29.54 
 
 
373 aa  65.9  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.405454  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2067  hypothetical protein  28.94 
 
 
379 aa  65.1  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0357547 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7635  hypothetical protein  30.21 
 
 
363 aa  63.9  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.678328 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3996  hypothetical protein  28.5 
 
 
397 aa  63.9  0.000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.880784  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0821  hypothetical protein  25.61 
 
 
391 aa  62  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.452627  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6205  hypothetical protein  26.43 
 
 
372 aa  61.2  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.454836  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7108  hypothetical protein  28.27 
 
 
387 aa  61.6  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.273158  normal  0.753701 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1484  hypothetical protein  30.55 
 
 
378 aa  60.5  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0801709  normal  0.239723 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0139  hypothetical protein  29.6 
 
 
393 aa  60.1  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3211  hypothetical protein  31.02 
 
 
368 aa  59.3  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.474284  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0283  hypothetical protein  17.92 
 
 
367 aa  58.9  0.0000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3538  hypothetical protein  27.67 
 
 
398 aa  57.4  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4941  hypothetical protein  28.35 
 
 
392 aa  56.2  0.0000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1792  hypothetical protein  28.65 
 
 
377 aa  55.8  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5228  hypothetical protein  26.3 
 
 
383 aa  53.9  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.160159  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5325  hypothetical protein  34.3 
 
 
365 aa  51.2  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4016  hypothetical protein  34.34 
 
 
385 aa  49.7  0.00008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.102828  normal  0.620979 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4021  hypothetical protein  30.43 
 
 
393 aa  43.9  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000017114  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0286  hypothetical protein  28.48 
 
 
375 aa  43.5  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.513722 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>