81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1503 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_1503  hypothetical protein  100 
 
 		 503 aa  990    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00227596 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0473  hypothetical protein  58.61 
 
 		 473 aa  522  1e-147  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.172011  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6605  hypothetical protein  56.93 
 
 		 470 aa  481  1e-134  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1503  Protein of unknown function DUF2252  57.35 
 
 		 464 aa  440  9.999999999999999e-123  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.935426  normal  0.301708 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2955  hypothetical protein  48.7 
 
 		 510 aa  436  1e-121  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000276818  hitchhiker  0.00175827 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7522  hypothetical protein  52.28 
 
 		 466 aa  416  9.999999999999999e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.523269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0158  hypothetical protein  44.61 
 
 		 477 aa  413  1e-114  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.94727  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4747  hypothetical protein  49.9 
 
 		 487 aa  412  1e-114  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1408  hypothetical protein  47.9 
 
 		 464 aa  402  1e-111  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1437  hypothetical protein  47.9 
 
 		 464 aa  402  1e-111  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.768827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0473  Protein of unknown function DUF2252  48.71 
 
 		 462 aa  401  9.999999999999999e-111  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1504  hypothetical protein  46.02 
 
 		 462 aa  393  1e-108  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.215631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1145  hypothetical protein  43.89 
 
 		 465 aa  382  1e-105  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0653  hypothetical protein  45.75 
 
 		 471 aa  378  1e-103  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3161  hypothetical protein  42.34 
 
 		 437 aa  370  1e-101  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2987  hypothetical protein  44.68 
 
 		 471 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.000011145  hitchhiker  0.00753945 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2396  hypothetical protein  46.52 
 
 		 471 aa  371  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.944145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0568  hypothetical protein  41.72 
 
 		 468 aa  358  8e-98  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6353  hypothetical protein  46.83 
 
 		 484 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.385812 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1207  hypothetical protein  45.51 
 
 		 474 aa  348  9e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.587699  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1593  hypothetical protein  38.92 
 
 		 476 aa  344  2.9999999999999997e-93  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2140  hypothetical protein  46.61 
 
 		 470 aa  341  2e-92  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0864  hypothetical protein  44.4 
 
 		 498 aa  330  3e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.134206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2465  hypothetical protein  43.98 
 
 		 470 aa  330  4e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5403  hypothetical protein  44.37 
 
 		 470 aa  324  3e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2520  hypothetical protein  45.32 
 
 		 493 aa  323  3e-87  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0184081 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5980  hypothetical protein  41.97 
 
 		 470 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.335989  normal  0.514898 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2326  hypothetical protein  41.98 
 
 		 474 aa  308  1.0000000000000001e-82  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00587073  hitchhiker  0.0000416917 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2365  Protein of unknown function DUF2252  41.23 
 
 		 458 aa  308  2.0000000000000002e-82  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.398569  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2396  hypothetical protein  43.19 
 
 		 495 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.167793 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4704  hypothetical protein  42 
 
 		 473 aa  305  8.000000000000001e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0115102 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4442  hypothetical protein  41.76 
 
 		 479 aa  302  7.000000000000001e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2216  hypothetical protein  40.99 
 
 		 470 aa  302  1e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.952755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1130  hypothetical protein  41.58 
 
 		 494 aa  295  2e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1242  hypothetical protein  41.36 
 
 		 494 aa  294  3e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.36599  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1587  hypothetical protein  42.57 
 
 		 461 aa  288  2e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1537  hypothetical protein  30.66 
 
 		 465 aa  208  1e-52  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1648  hypothetical protein  29.84 
 
 		 437 aa  127  5e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.324068  normal  0.118221 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5970  hypothetical protein  27.42 
 
 		 436 aa  124  3e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.323905  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0828  hypothetical protein  25.9 
 
 		 451 aa  120  4.9999999999999996e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.182341  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2341  hypothetical protein  27.27 
 
 		 444 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000268257  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1368  hypothetical protein  27.29 
 
 		 438 aa  110  6e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1350  hypothetical protein  27.29 
 
 		 442 aa  110  8.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.060115  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1384  hypothetical protein  27.06 
 
 		 438 aa  110  9.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.978626  normal  0.608008 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2087  hypothetical protein  25.58 
 
 		 432 aa  109  9.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.642554  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02588  conserved hypothetical protein  25.84 
 
 		 448 aa  105  2e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0352078 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4820  Protein of unknown function DUF2252  27.23 
 
 		 447 aa  103  7e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.923578  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0931  Protein of unknown function DUF2252  26.24 
 
 		 462 aa  100  6e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1916  hypothetical protein  22.84 
 
 		 480 aa  100  7e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.382206 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3367  hypothetical protein  26.09 
 
 		 391 aa  95.1  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000329011  normal  0.770543 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4080  hypothetical protein  27.58 
 
 		 404 aa  94  5e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2606  hypothetical protein  27.25 
 
 		 448 aa  92  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.045879  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2085  hypothetical protein  26.77 
 
 		 407 aa  89.7  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1180  hypothetical protein  25.5 
 
 		 469 aa  89.7  1e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.115091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0769  hypothetical protein  26.79 
 
 		 503 aa  87.4  6e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.598571  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3805  hypothetical protein  49.46 
 
 		 138 aa  83.6  0.000000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.702256  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5889  hypothetical protein  26.4 
 
 		 404 aa  83.2  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3585  hypothetical protein  23.84 
 
 		 492 aa  78.2  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2529  hypothetical protein  23.84 
 
 		 492 aa  78.2  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.301158  normal  0.321166 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3960  hypothetical protein  27.5 
 
 		 399 aa  77  0.0000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.146173  normal  0.0157887 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4516  hypothetical protein  22.07 
 
 		 486 aa  76.3  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1459  hypothetical protein  27.54 
 
 		 413 aa  73.9  0.000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3637  hypothetical protein  27.41 
 
 		 407 aa  70.9  0.00000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4869  Protein of unknown function DUF2252  35.79 
 
 		 485 aa  68.6  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.534903  normal  0.15703 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01772  hypothetical protein  24.62 
 
 		 442 aa  68.2  0.0000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.454303  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1341  hypothetical protein  29.1 
 
 		 415 aa  65.9  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.101093 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2136  hypothetical protein  21.94 
 
 		 438 aa  65.1  0.000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.698891 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1406  hypothetical protein  28.57 
 
 		 408 aa  64.7  0.000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.926489  normal  0.0309709 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1863  hypothetical protein  30.43 
 
 		 406 aa  63.5  0.000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.165766 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4763  hypothetical protein  26.99 
 
 		 413 aa  60.8  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.896269  normal  0.204861 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6450  hypothetical protein  42.17 
 
 		 176 aa  58.2  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.201741 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4552  hypothetical protein  27.37 
 
 		 411 aa  57.4  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0632047 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4087  hypothetical protein  28.27 
 
 		 420 aa  54.7  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3998  hypothetical protein  27.91 
 
 		 413 aa  53.1  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.348755 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2373  hypothetical protein  33.85 
 
 		 348 aa  52.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.424194  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5840  hypothetical protein  26.77 
 
 		 413 aa  48.1  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.5584 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5266  hypothetical protein  33.64 
 
 		 369 aa  47  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.164397  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2635  hypothetical protein  27.04 
 
 		 392 aa  44.7  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.355805  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0074  hypothetical protein  40 
 
 		 406 aa  44.3  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.667411 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2044  hypothetical protein  26.65 
 
 		 410 aa  43.9  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.122216  normal  0.245811 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4574  hypothetical protein  31.25 
 
 		 358 aa  43.9  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.134631 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>