More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1059 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_3673  heat shock protein 70  81.21 
 
 
556 aa  915    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.192305  normal  0.510271 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1059  2-alkenal reductase  100 
 
 
580 aa  1155    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00230509  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1192  2-alkenal reductase  50.53 
 
 
628 aa  488  1e-136  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0183455  normal  0.153916 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4755  Heat shock protein 70  46.4 
 
 
558 aa  457  1e-127  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1873  Heat shock protein 70  46.07 
 
 
527 aa  433  1e-120  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0915077  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6998  2-alkenal reductase  41.43 
 
 
546 aa  360  4e-98  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1395  Heat shock protein 70  39.79 
 
 
538 aa  335  1e-90  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.176666  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1403  Heat shock protein 70  44.27 
 
 
538 aa  284  3.0000000000000004e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0310  molecular chaperone DnaK  35.33 
 
 
644 aa  270  5.9999999999999995e-71  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2013  chaperone protein DnaK  35.45 
 
 
636 aa  269  8e-71  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3585  Heat shock protein 70  34.97 
 
 
525 aa  269  1e-70  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.219704  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0682  molecular chaperone DnaK  35 
 
 
644 aa  266  5.999999999999999e-70  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  hitchhiker  0.00979445  normal  0.319162 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2846  molecular chaperone DnaK  35.18 
 
 
636 aa  265  2e-69  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.769317  normal  0.885007 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0571  chaperone protein DnaK  35.26 
 
 
651 aa  262  1e-68  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1142  dnak protein, truncation  34.12 
 
 
505 aa  261  2e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12800  chaperone protein DnaK  34.57 
 
 
617 aa  255  2.0000000000000002e-66  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0339068  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2079  molecular chaperone DnaK  35.39 
 
 
612 aa  254  3e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1322  molecular chaperone DnaK  35.8 
 
 
608 aa  254  4.0000000000000004e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4270  chaperone protein DnaK  34.68 
 
 
613 aa  247  4e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.567821  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0349  chaperone protein DnaK  36.2 
 
 
619 aa  247  4e-64  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.760609 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0033  molecular chaperone DnaK  34.08 
 
 
636 aa  247  4.9999999999999997e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0634  molecular chaperone DnaK  35.63 
 
 
622 aa  247  4.9999999999999997e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0268741 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1996  chaperone protein DnaK  35.37 
 
 
616 aa  246  8e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.278133  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2829  molecular chaperone DnaK  33.12 
 
 
639 aa  246  8e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000221772  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0449  molecular chaperone DnaK  34.91 
 
 
622 aa  246  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1128  molecular chaperone DnaK  34.55 
 
 
596 aa  245  9.999999999999999e-64  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3221  chaperone protein DnaK  34.51 
 
 
613 aa  246  9.999999999999999e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000155222  hitchhiker  0.000112809 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0462  molecular chaperone DnaK  34.91 
 
 
622 aa  246  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0589911  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0473  molecular chaperone DnaK  34.91 
 
 
622 aa  246  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.518143  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0107  molecular chaperone DnaK  33.12 
 
 
634 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0126383  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4807  chaperone protein DnaK  35.09 
 
 
627 aa  245  1.9999999999999999e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1207  chaperone protein DnaK  33.91 
 
 
620 aa  244  1.9999999999999999e-63  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.558053  normal  0.0128499 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1183  chaperone protein DnaK  33.79 
 
 
621 aa  244  3e-63  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0207738 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1649  molecular chaperone DnaK  34.42 
 
 
600 aa  244  3e-63  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.00000228474  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0366  chaperone protein DnaK  34.4 
 
 
617 aa  244  3e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0211  molecular chaperone DnaK  33.6 
 
 
635 aa  244  3.9999999999999997e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000228003  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2005  molecular chaperone DnaK  35.74 
 
 
619 aa  244  3.9999999999999997e-63  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3505  molecular chaperone DnaK  34.52 
 
 
640 aa  243  5e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00228392  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2290  molecular chaperone DnaK  35.74 
 
 
619 aa  243  7e-63  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0196  molecular chaperone DnaK  35.56 
 
 
613 aa  242  1e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0798  chaperone protein DnaK  34.13 
 
 
642 aa  241  2e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.430044 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3532  molecular chaperone DnaK  33.44 
 
 
638 aa  241  2e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00119444  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0486  chaperone protein DnaK  35.22 
 
 
613 aa  242  2e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.403398  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2437  molecular chaperone DnaK  34.57 
 
 
609 aa  241  2e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0177515  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2835  molecular chaperone DnaK  33.28 
 
 
639 aa  242  2e-62  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3040  molecular chaperone DnaK  34.31 
 
 
611 aa  241  2e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00371725  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0607  chaperone protein DnaK  35.34 
 
 
605 aa  241  2e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42970  molecular chaperone DnaK  33.55 
 
 
642 aa  241  2.9999999999999997e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1013  molecular chaperone DnaK  35.04 
 
 
607 aa  241  2.9999999999999997e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00014  molecular chaperone DnaK  33.5 
 
 
638 aa  241  4e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3583  chaperone protein DnaK  33.5 
 
 
638 aa  241  4e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.766663  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4727  molecular chaperone DnaK  33.61 
 
 
641 aa  240  4e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00374336 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0012  molecular chaperone DnaK  33.5 
 
 
638 aa  241  4e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0014  molecular chaperone DnaK  33.5 
 
 
638 aa  241  4e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.720404  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4299  chaperone protein DnaK  34.18 
 
 
614 aa  240  4e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000344798  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0015  molecular chaperone DnaK  33.5 
 
 
638 aa  240  4e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3642  molecular chaperone DnaK  33.5 
 
 
638 aa  241  4e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.297376  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0017  molecular chaperone DnaK  33.5 
 
 
638 aa  241  4e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00276008  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00014  hypothetical protein  33.5 
 
 
638 aa  241  4e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2893  molecular chaperone DnaK  33.6 
 
 
635 aa  241  4e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000189329  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0014  molecular chaperone DnaK  33.5 
 
 
638 aa  241  4e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3574  molecular chaperone DnaK  34.18 
 
 
640 aa  240  4e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4593  molecular chaperone DnaK  33.61 
 
 
611 aa  240  5e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.419127 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18810  chaperone protein DnaK  36.92 
 
 
619 aa  240  5.999999999999999e-62  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.000228841  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1404  molecular chaperone DnaK  33.87 
 
 
636 aa  240  5.999999999999999e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00594741  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3624  molecular chaperone DnaK  33.33 
 
 
637 aa  239  8e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0260  molecular chaperone DnaK  34.39 
 
 
622 aa  239  9e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0242137  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0017  chaperone protein DnaK  33.58 
 
 
607 aa  239  1e-61  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0836411  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0238  chaperone protein DnaK  34.12 
 
 
617 aa  239  1e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2311  chaperone protein DnaK  33.92 
 
 
620 aa  238  2e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000072076  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3709  chaperone protein DnaK  35.15 
 
 
628 aa  238  2e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.609009 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38580  molecular chaperone DnaK  35.15 
 
 
619 aa  238  2e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1312  molecular chaperone DnaK  33.7 
 
 
620 aa  238  2e-61  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.975938  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4363  chaperone protein DnaK  35.82 
 
 
621 aa  238  2e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.62994  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0481  molecular chaperone DnaK  32.89 
 
 
632 aa  238  2e-61  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.995968 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0113  molecular chaperone DnaK  34.57 
 
 
613 aa  238  3e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4395  molecular chaperone DnaK  34.81 
 
 
611 aa  237  4e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00031537  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4728  molecular chaperone DnaK  33.44 
 
 
641 aa  237  4e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1061  chaperone protein DnaK  34.04 
 
 
609 aa  237  5.0000000000000005e-61  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00544599  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4447  molecular chaperone DnaK  34.81 
 
 
611 aa  237  5.0000000000000005e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000527769  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3919  chaperone protein DnaK  33.95 
 
 
638 aa  237  5.0000000000000005e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0531667 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2302  molecular chaperone DnaK  33.56 
 
 
638 aa  237  5.0000000000000005e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0679983  normal  0.117002 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0622  chaperone protein DnaK  32.81 
 
 
600 aa  236  6e-61  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0182249  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0112  molecular chaperone DnaK  34.57 
 
 
611 aa  236  8e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000334679 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10355  molecular chaperone DnaK  34.39 
 
 
625 aa  236  8e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1173  molecular chaperone DnaK  33.56 
 
 
636 aa  236  9e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1857  chaperone protein DnaK  33.39 
 
 
634 aa  236  1.0000000000000001e-60  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.48681  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1798  molecular chaperone DnaK  34.54 
 
 
616 aa  236  1.0000000000000001e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2835  molecular chaperone DnaK  33.56 
 
 
636 aa  236  1.0000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.195786  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0705  molecular chaperone DnaK  33.61 
 
 
642 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.991542  hitchhiker  0.00373159 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3808  molecular chaperone DnaK  35.26 
 
 
622 aa  235  2.0000000000000002e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0201  chaperone protein DnaK  35.55 
 
 
621 aa  234  3e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.00131999  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3574  chaperone protein DnaK  33.33 
 
 
639 aa  234  3e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.662017  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0247  chaperone protein DnaK  33.22 
 
 
621 aa  234  3e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.533017  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1328  molecular chaperone DnaK  33.5 
 
 
631 aa  234  3e-60  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0013  molecular chaperone DnaK  32.83 
 
 
638 aa  234  4.0000000000000004e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0012  molecular chaperone DnaK  32.83 
 
 
638 aa  234  4.0000000000000004e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.276722  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0128  chaperone DnaK  33.51 
 
 
610 aa  234  4.0000000000000004e-60  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.438221  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0013  molecular chaperone DnaK  32.83 
 
 
638 aa  234  4.0000000000000004e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.169277  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0013  molecular chaperone DnaK  32.83 
 
 
638 aa  234  4.0000000000000004e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.693638  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>