31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0858 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_0858  hypothetical protein  100 
 
 		 394 aa  749    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.581256  normal  0.122318 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3869  hypothetical protein  54.64 
 
 		 385 aa  293  3e-78  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0435346  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3077  hypothetical protein  42.11 
 
 		 404 aa  194  3e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1452  protein of unknown function DUF1624  38.95 
 
 		 411 aa  186  5e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000779401 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1481  hypothetical protein  42.28 
 
 		 378 aa  180  2.9999999999999997e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.526682  normal  0.162192 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1450  hypothetical protein  36.84 
 
 		 411 aa  160  3e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.763514  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3252  hypothetical protein  35.07 
 
 		 432 aa  144  3e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1542  hypothetical protein  34.26 
 
 		 445 aa  139  1e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.170969  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20080  predicted membrane protein  37.7 
 
 		 450 aa  137  3.0000000000000003e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0149559 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2244  hypothetical protein  35.96 
 
 		 450 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0644  hypothetical protein  35.06 
 
 		 412 aa  123  7e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.353612  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2368  hypothetical protein  33.78 
 
 		 402 aa  120  4.9999999999999996e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3181  hypothetical protein  34.86 
 
 		 371 aa  119  6e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1560  hypothetical protein  31.89 
 
 		 382 aa  108  1e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.214975  normal  0.807756 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2675  hypothetical protein  29.66 
 
 		 434 aa  108  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.397563 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2673  hypothetical protein  30.43 
 
 		 434 aa  105  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.277255 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07140  predicted membrane protein  37.71 
 
 		 423 aa  99.8  8e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.125251  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09280  hypothetical protein  36.36 
 
 		 313 aa  96.3  8e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36310  hypothetical protein  32.42 
 
 		 427 aa  93.2  8e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.740551  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0991  hypothetical protein  31.07 
 
 		 362 aa  90.9  4e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06780  hypothetical protein  33.01 
 
 		 412 aa  82.8  0.00000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4532  transport protein  28.94 
 
 		 354 aa  81.3  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1197  hypothetical protein  29.64 
 
 		 386 aa  74.3  0.000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.673489  normal  0.324523 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0333  hypothetical protein  28.2 
 
 		 538 aa  73.6  0.000000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.115307 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18000  hypothetical protein  32.27 
 
 		 405 aa  72  0.00000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.514365  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3325  hypothetical protein  31.19 
 
 		 402 aa  68.9  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0514676  normal  0.538152 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1720  transport protein  28.42 
 
 		 344 aa  68.2  0.0000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2015  hypothetical protein  22.25 
 
 		 361 aa  65.5  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0652327  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2187  hypothetical protein  23.54 
 
 		 361 aa  51.6  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490446  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0017  hypothetical protein  27.73 
 
 		 374 aa  50.4  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3178  hypothetical protein  29.41 
 
 		 363 aa  46.6  0.0008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>