18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0753 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_0753  O-antigen polymerase  100 
 
 		 476 aa  923    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.409596  hitchhiker  0.000594246 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4472  hypothetical protein  39.64 
 
 		 509 aa  278  1e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1569  O-antigen polymerase  38.39 
 
 		 489 aa  229  8e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.497135 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1927  O-antigen polymerase  36.72 
 
 		 679 aa  221  3e-56  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6554  O-antigen polymerase  37.04 
 
 		 506 aa  216  7e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.408434 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8491  O-antigen polymerase  34.32 
 
 		 469 aa  201  1.9999999999999998e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.867737 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0648  hypothetical protein  32.47 
 
 		 462 aa  174  3.9999999999999995e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.600049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1739  O-antigen polymerase  32.18 
 
 		 465 aa  168  2e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2697  O-antigen polymerase  33.25 
 
 		 419 aa  162  1e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4126  O-antigen polymerase  36.44 
 
 		 440 aa  159  1e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3905  O-antigen polymerase  31.81 
 
 		 456 aa  125  1e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0066  O-antigen polymerase  27.71 
 
 		 438 aa  101  3e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.059458  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1072  hypothetical protein  26.02 
 
 		 457 aa  73.2  0.000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.285493  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2933  O-antigen polymerase  24.33 
 
 		 458 aa  53.9  0.000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000205816  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0297  hypothetical protein  25.78 
 
 		 428 aa  51.2  0.00004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.515931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5250  O-antigen polymerase  32.33 
 
 		 336 aa  50.1  0.00008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0677  O-antigen polymerase  27.62 
 
 		 436 aa  48.5  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.857845  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5249  O-antigen polymerase  27.67 
 
 		 671 aa  44.7  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.566036  normal  0.80633 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>