31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0734 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_0734  YceI family protein  100 
 
 		 241 aa  484  1e-136  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00686408 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28440  hypothetical protein  40.09 
 
 		 229 aa  152  5e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.533417 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3521  YceI family protein  43.09 
 
 		 221 aa  144  1e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.761218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0400  hypothetical protein  42.69 
 
 		 246 aa  138  8.999999999999999e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00289936  normal  0.0247339 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2124  YceI family protein  40.24 
 
 		 246 aa  136  3.0000000000000003e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.97033 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3289  YceI family protein  43.93 
 
 		 236 aa  132  5e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0535  YceI family protein  27.57 
 
 		 223 aa  68.6  0.00000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2969  YceI family protein  28.66 
 
 		 195 aa  62.8  0.000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0918  YceI family protein  27.98 
 
 		 275 aa  60.5  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4883  YceI family protein  29.06 
 
 		 185 aa  57.4  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.831843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3479  YceI family protein  26.19 
 
 		 269 aa  54.3  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.482205 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2933  YceI family protein  29.84 
 
 		 182 aa  53.1  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.258273 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3103  hypothetical protein  26.17 
 
 		 192 aa  49.7  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3449  YceI  25.81 
 
 		 196 aa  48.1  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0504  YceI family protein  24.85 
 
 		 267 aa  47.8  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0863373  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0861  YceI family protein  29.03 
 
 		 177 aa  46.6  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.47771  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3690  YceI family protein  26.47 
 
 		 190 aa  46.2  0.0004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.442684  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7356  YceI family protein  27.95 
 
 		 166 aa  46.2  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.249412 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1199  YceI family protein  25 
 
 		 183 aa  46.2  0.0005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.144393  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0067  YceI family protein  30.83 
 
 		 171 aa  45.4  0.0007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1207  YceI family protein  24.03 
 
 		 197 aa  44.7  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00184458  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0065  hypothetical protein  25.74 
 
 		 190 aa  45.1  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3066  YceI family protein  23.38 
 
 		 197 aa  43.1  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0262369 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5253  YceI family protein  28.95 
 
 		 202 aa  43.5  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.717855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0569  YceI family protein  27.5 
 
 		 185 aa  43.1  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.113259 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2169  YceI family protein  30 
 
 		 181 aa  42.7  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0221884 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0167  hypothetical protein  22.31 
 
 		 181 aa  42.4  0.007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4261  YceI family protein  25 
 
 		 182 aa  42  0.008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.651401  normal  0.0270494 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4106  YceI family protein  25 
 
 		 182 aa  42  0.008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4031  YceI  25 
 
 		 182 aa  42  0.008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.269923  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05924  hypothetical protein  24.22 
 
 		 189 aa  42  0.01  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>