25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_4088 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_4088  putative replication initiation protein  100 
 
 		 476 aa  936    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4126  putative replication initiation protein  84.45 
 
 		 481 aa  776    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4162  putative replication initiation protein  88.36 
 
 		 492 aa  764    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0471943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2106  putative replication initiation protein  85.87 
 
 		 478 aa  763    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.612009  normal  0.44749 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3399  putative replication initiation protein  63.6 
 
 		 476 aa  558  1e-157  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00332315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8662  hypothetical protein  47.95 
 
 		 466 aa  376  1e-103  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0080  hypothetical protein  45.27 
 
 		 461 aa  357  3.9999999999999996e-97  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0998986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4534  hypothetical protein  44.19 
 
 		 474 aa  343  2.9999999999999997e-93  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4273  putative plasmid replication initiator protein  45.99 
 
 		 506 aa  331  2e-89  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.730737  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7035  hypothetical protein  41.33 
 
 		 499 aa  318  1e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.747593 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0602  hypothetical protein  39.41 
 
 		 469 aa  283  5.000000000000001e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.437149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23890  hypothetical protein  39.56 
 
 		 450 aa  275  1.0000000000000001e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0719573  normal  0.157442 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0122  replication initiation protein  40.67 
 
 		 478 aa  263  4e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.93008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1580  putative plasmid replication initiator protein  37.15 
 
 		 521 aa  261  1e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0150406 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1292  hypothetical protein  37.23 
 
 		 447 aa  247  4e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1116  hypothetical protein  37.5 
 
 		 436 aa  233  6e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1563  replication initiation protein  36.5 
 
 		 449 aa  227  4e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0041515 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0635  hypothetical protein  38.89 
 
 		 522 aa  226  5.0000000000000005e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3035  putative plasmid replication initiator protein  35.48 
 
 		 474 aa  204  3e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3178  putative plasmid replication initiator protein  33.19 
 
 		 499 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.80009  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3228  putative plasmid replication initiator protein  33.19 
 
 		 499 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  decreased coverage  0.00604715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3166  putative plasmid replication initiator protein  33.19 
 
 		 499 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.40822  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5992  plasmid replication initiator protein  40 
 
 		 197 aa  101  3e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.679906  hitchhiker  0.0000578035 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5591  plasmid replication initiator protein  40 
 
 		 197 aa  101  3e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0693  hypothetical protein  23.8 
 
 		 550 aa  43.5  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.270288 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>