More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3828 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3828  hypothetical protein  100 
 
 		 380 aa  754    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.877651  normal  0.0295113 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0888  hypothetical protein  86.13 
 
 		 399 aa  624  1e-178  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.100388  normal  0.293855 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0508  chromosome partitioning ATPase protein  65.78 
 
 		 390 aa  498  1e-140  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1188  protein of unknown function DUF59  66.13 
 
 		 383 aa  499  1e-140  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.518876  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3887  ATPase-like, ParA/MinD  65.52 
 
 		 379 aa  495  1e-139  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.803314  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8411  hypothetical protein  64.71 
 
 		 380 aa  492  9.999999999999999e-139  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.145247  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0799  protein of unknown function DUF59  69.11 
 
 		 381 aa  494  9.999999999999999e-139  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.348567  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7792  protein of unknown function DUF59  66.58 
 
 		 384 aa  488  1e-137  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.431827 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1127  ATPase-like, ParA/MinD  68.45 
 
 		 383 aa  484  1e-136  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.317014  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06470  chromosome partitioning ATPase  66.4 
 
 		 381 aa  483  1e-135  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1073  ATPase-like, ParA/MinD  69.21 
 
 		 378 aa  478  1e-134  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3011  hypothetical protein  67.02 
 
 		 378 aa  479  1e-134  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.52694 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1861  ATPase-like, ParA/MinD  66.22 
 
 		 381 aa  473  1e-132  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.270426  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1824  hypothetical protein  65.24 
 
 		 389 aa  465  9.999999999999999e-131  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.824017  normal  0.196606 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2792  hypothetical protein  61.56 
 
 		 375 aa  459  9.999999999999999e-129  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.449626  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19390  chromosome partitioning ATPase  63.47 
 
 		 377 aa  452  1.0000000000000001e-126  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.197294  normal  0.0185539 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4004  hypothetical protein  66.4 
 
 		 381 aa  447  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.578678  normal  0.52969 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11254  hypothetical protein  64.96 
 
 		 390 aa  446  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.397293  hitchhiker  0.00931027 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3990  hypothetical protein  66.4 
 
 		 381 aa  447  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.133622  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4064  hypothetical protein  66.4 
 
 		 381 aa  447  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.291475  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2486  ATPase-like, ParA/MinD  64.55 
 
 		 387 aa  440  9.999999999999999e-123  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.168186 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0763  protein of unknown function DUF59  65.31 
 
 		 374 aa  438  9.999999999999999e-123  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2512  protein of unknown function DUF59  62.4 
 
 		 381 aa  433  1e-120  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000076011 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0662  hypothetical protein  66.84 
 
 		 382 aa  433  1e-120  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0311982 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4492  hypothetical protein  63.88 
 
 		 375 aa  434  1e-120  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0587932 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2205  hypothetical protein  63.07 
 
 		 375 aa  431  1e-119  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.540557 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2916  protein of unknown function DUF59  62.57 
 
 		 389 aa  419  1e-116  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0546543  normal  0.0263607 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0708  hypothetical protein  62.53 
 
 		 384 aa  413  1e-114  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27850  chromosome partitioning ATPase  61.39 
 
 		 387 aa  408  1e-113  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.748348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1155  protein of unknown function DUF59  62.53 
 
 		 381 aa  406  1.0000000000000001e-112  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.42998  normal  0.0292515 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0715  hypothetical protein  64.88 
 
 		 411 aa  407  1.0000000000000001e-112  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.311906 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1445  hypothetical protein  60.1 
 
 		 387 aa  403  1e-111  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0364525  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0699  protein of unknown function DUF59  60.48 
 
 		 387 aa  399  9.999999999999999e-111  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0606743  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2160  protein of unknown function DUF59  61.23 
 
 		 381 aa  392  1e-108  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.243982  hitchhiker  0.00164472 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15350  chromosome partitioning ATPase  57.02 
 
 		 382 aa  362  4e-99  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11270  chromosome partitioning ATPase  54.64 
 
 		 381 aa  352  7e-96  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.3679  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2935  hypothetical protein  48.78 
 
 		 377 aa  330  3e-89  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0067  chromosome partitioning ATPase  45.53 
 
 		 371 aa  308  9e-83  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0782  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding domain family protein  47.66 
 
 		 375 aa  305  1.0000000000000001e-81  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5819  ATPase-like, ParA/MinD  48.74 
 
 		 391 aa  283  4.0000000000000003e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.294299  normal  0.0147747 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1287  hypothetical protein  47.8 
 
 		 391 aa  282  6.000000000000001e-75  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.404261  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2676  ATPase-like, ParA/MinD  47.9 
 
 		 365 aa  278  2e-73  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0710053  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0075  hypothetical protein  45.83 
 
 		 370 aa  276  3e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3055  protein of unknown function DUF59  38.74 
 
 		 353 aa  259  6e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.325814 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0347  protein of unknown function DUF59  41.69 
 
 		 369 aa  255  7e-67  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0686442  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3578  mrp protein  38.89 
 
 		 349 aa  252  1e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0968  protein of unknown function DUF59  37.57 
 
 		 371 aa  251  2e-65  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1590  chromosome partitioning ATPase  37.22 
 
 		 347 aa  250  3e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3588  mrp protein  38.61 
 
 		 349 aa  250  3e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1646  mrp protein  39.72 
 
 		 349 aa  249  4e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3571  mrp protein  39.17 
 
 		 349 aa  249  6e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.983945 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2597  protein of unknown function DUF59  38.11 
 
 		 356 aa  248  1e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0491781 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3357  mrp protein  38.89 
 
 		 349 aa  248  2e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.330315  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3321  ATP-binding mrp protein  38.89 
 
 		 349 aa  248  2e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3271  ATP-binding mrp protein  39.17 
 
 		 349 aa  247  2e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3671  mrp protein  39.04 
 
 		 349 aa  247  2e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3620  mrp protein  38.89 
 
 		 349 aa  248  2e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1760  hypothetical protein  40.27 
 
 		 367 aa  247  2e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.224371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4109  protein of unknown function DUF59  39.11 
 
 		 353 aa  245  9.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00117274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0326  hypothetical protein  40.65 
 
 		 359 aa  244  9.999999999999999e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4070  protein of unknown function DUF59  38.57 
 
 		 353 aa  244  3e-63  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2492  protein of unknown function DUF59  44 
 
 		 364 aa  240  2.9999999999999997e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0134384  normal  0.291391 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0399  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  39.06 
 
 		 395 aa  239  4e-62  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1234  hypothetical protein  36.16 
 
 		 370 aa  239  5.999999999999999e-62  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1105  MRP protein-like  38.06 
 
 		 361 aa  239  8e-62  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.914762 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1165  hypothetical protein  38.25 
 
 		 356 aa  238  1e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000258705 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2109  hypothetical protein  39.13 
 
 		 367 aa  238  2e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0874248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22681  hypothetical protein  39.66 
 
 		 358 aa  231  1e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.371256 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4583  hypothetical protein  38.94 
 
 		 356 aa  229  6e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1575  ATPase-like, ParA/MinD  38.11 
 
 		 358 aa  229  8e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3344  ATPase-like, ParA/MinD  37.92 
 
 		 358 aa  228  1e-58  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.312419  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2287  chromosome partitioning ATPase protein  39.18 
 
 		 358 aa  226  3e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000432977 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2661  Mrp protein  39.18 
 
 		 358 aa  226  3e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2189  cobyrinic acid ac-diamide synthase  39.1 
 
 		 362 aa  225  8e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00291769  normal  0.27131 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2325  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.64 
 
 		 367 aa  225  9e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1814  protein of unknown function DUF59  36.07 
 
 		 363 aa  223  3e-57  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0920101  normal  0.492126 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1786  nucleotide-binding protein-like protein  45.28 
 
 		 361 aa  223  6e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.506851  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1017  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  39.17 
 
 		 362 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0291426  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0395  Mrp/NBP35 family protein  38.34 
 
 		 354 aa  221  9.999999999999999e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.616395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2130  hypothetical protein  41.19 
 
 		 361 aa  220  3e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0873537  normal  0.132517 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1110  ATPase-like, ParA/MinD  38.03 
 
 		 367 aa  220  3e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.559665 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2226  protein of unknown function DUF59  35.86 
 
 		 365 aa  220  3.9999999999999997e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.934574  normal  0.117815 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3481  putative ATP-binding protein  38.61 
 
 		 362 aa  218  1e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00831009  normal  0.84949 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4025  hypothetical protein  36.75 
 
 		 379 aa  218  1e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.859751  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2197  ATPase-like, ParA/MinD  37.82 
 
 		 368 aa  217  2e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.427821  normal  0.0242284 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1138  hypothetical protein  40.88 
 
 		 368 aa  218  2e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4074  hypothetical protein  36.29 
 
 		 336 aa  217  2.9999999999999998e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.578065 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2528  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.36 
 
 		 348 aa  216  4e-55  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0638219  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0420  protein of unknown function DUF59  35.63 
 
 		 360 aa  216  5e-55  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0587708  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2440  cobyrinic acid ac-diamide synthase  41.18 
 
 		 363 aa  216  5e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000091125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0859  cobyrinic acid ac-diamide synthase  40.16 
 
 		 363 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000753537  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18320  chromosome partitioning ATPase protein  46.99 
 
 		 285 aa  216  5.9999999999999996e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000336344  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2622  ATPase-like ParA/MinD  36.96 
 
 		 356 aa  215  8e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.783345  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2587  protein of unknown function DUF59  36.54 
 
 		 351 aa  216  8e-55  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.600696  normal  0.426631 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2544  ATPase-like, ParA/MinD  38.42 
 
 		 349 aa  215  9e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0442  hypothetical protein  36.26 
 
 		 384 aa  214  9.999999999999999e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.44272  normal  0.0224463 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1824  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  41.18 
 
 		 363 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.16472  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2435  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  41.18 
 
 		 363 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00757456  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2188  protein of unknown function DUF59  37.85 
 
 		 363 aa  215  9.999999999999999e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.321021 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1360  hypothetical protein  36.96 
 
 		 365 aa  215  9.999999999999999e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>