More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3738 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3738  luciferase-like  100 
 
 		 294 aa  593  1e-168  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.945207 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0998  luciferase family protein  73.79 
 
 		 290 aa  447  1.0000000000000001e-124  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4065  Luciferase-like monooxygenase  62.15 
 
 		 290 aa  366  1e-100  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.247001 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4599  Luciferase-like monooxygenase  59.66 
 
 		 288 aa  350  1e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00704418 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5013  Luciferase-like monooxygenase  61.46 
 
 		 288 aa  350  2e-95  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2788  Luciferase-like monooxygenase  56.7 
 
 		 296 aa  303  3.0000000000000004e-81  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4265  putative F420-dependent oxidoreductase  60.08 
 
 		 288 aa  293  2e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0876  luciferase-like protein  52.81 
 
 		 300 aa  268  5.9999999999999995e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0893  luciferase family protein  52.81 
 
 		 300 aa  268  5.9999999999999995e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5372  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  54.44 
 
 		 287 aa  268  8e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0364521 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2683  luciferase family protein  57.89 
 
 		 298 aa  266  2.9999999999999995e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0596909  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0882  luciferase family protein  52.43 
 
 		 300 aa  265  7e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.986005 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12590  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  52.99 
 
 		 292 aa  251  7e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.623605 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1419  Luciferase-like monooxygenase  49.15 
 
 		 293 aa  241  1e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11883  oxidoreductase  44.07 
 
 		 307 aa  191  8e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.352058 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2274  Luciferase-like monooxygenase  37.5 
 
 		 326 aa  191  2e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.800632  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0211  luciferase-like protein  41.6 
 
 		 321 aa  187  2e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1330  Luciferase-like monooxygenase  36.73 
 
 		 323 aa  187  3e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2430  putative F420-dependent oxidoreductase  49.03 
 
 		 257 aa  186  3e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.590177  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2800  luciferase-like protein  44 
 
 		 309 aa  185  8e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2844  luciferase family protein  44 
 
 		 309 aa  185  8e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2827  luciferase family protein  44 
 
 		 309 aa  185  8e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.543499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0331  Luciferase-like monooxygenase  46.22 
 
 		 328 aa  182  6e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3077  luciferase family protein  44 
 
 		 309 aa  182  7e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1303  luciferase family protein  37.5 
 
 		 335 aa  180  2.9999999999999997e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.520917  normal  0.367866 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0981  Luciferase-like monooxygenase  42.79 
 
 		 332 aa  179  5.999999999999999e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3347  luciferase family protein  45.33 
 
 		 309 aa  171  2e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.637104  normal  0.31131 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8280  Luciferase-like monooxygenase  39.74 
 
 		 281 aa  168  1e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0455932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7422  Luciferase-like monooxygenase  40.48 
 
 		 316 aa  167  2e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.33827  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2280  luciferase-like monooxygenase  34.85 
 
 		 305 aa  165  8e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.101166  normal  0.0450195 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0803  putative F420-dependent oxidoreductase  36.89 
 
 		 328 aa  162  8.000000000000001e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0629  luciferase family protein  32.25 
 
 		 319 aa  160  2e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0662642 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1696  luciferase family protein  35.59 
 
 		 330 aa  159  6e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.862088  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2603  putative F420-dependent oxidoreductase  36.26 
 
 		 328 aa  159  6e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.52821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29280  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  37.01 
 
 		 328 aa  159  8e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.963848  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4740  Luciferase-like monooxygenase  36.51 
 
 		 330 aa  157  3e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1207  putative F420-dependent oxidoreductase  38.46 
 
 		 327 aa  155  1e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.814029  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5695  luciferase family protein  39.82 
 
 		 286 aa  154  2e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.146497 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4872  luciferase family protein  35.56 
 
 		 338 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.541717  normal  0.0985833 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6754  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  33.12 
 
 		 310 aa  154  2.9999999999999998e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.232037 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1977  Luciferase-like monooxygenase  41.12 
 
 		 282 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5442  luciferase family protein  37.5 
 
 		 285 aa  152  8e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.942961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4489  luciferase-like protein  35.11 
 
 		 338 aa  151  1e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5063  luciferase-like protein  37.5 
 
 		 285 aa  151  1e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4576  luciferase family protein  35.11 
 
 		 338 aa  151  1e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.149021 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5151  luciferase family protein  37.5 
 
 		 285 aa  151  1e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2313  luciferase family protein  34.39 
 
 		 316 aa  150  2e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0072758  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5062  luciferase family protein  36.22 
 
 		 330 aa  149  4e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1720  Luciferase-like monooxygenase  33.23 
 
 		 308 aa  149  5e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0815557  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3320  luciferase family protein  39.07 
 
 		 338 aa  149  6e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.180327  normal  0.483465 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10450  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  34.18 
 
 		 311 aa  147  1.0000000000000001e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0149885  normal  0.0262364 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0268  luciferase family protein  31.92 
 
 		 313 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1117  luciferase family protein  39.29 
 
 		 287 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.30712 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3880  luciferase family protein  38.63 
 
 		 316 aa  145  6e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1594  putative F420-dependent oxidoreductase  34.87 
 
 		 309 aa  143  4e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.180002  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4271  luciferase family protein  39.29 
 
 		 316 aa  143  4e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0653657  normal  0.0110143 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1675  luciferase family protein  34.34 
 
 		 311 aa  142  5e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.381566 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0526  Luciferase-like monooxygenase  38.82 
 
 		 484 aa  142  6e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0202  Luciferase-like monooxygenase  30.84 
 
 		 314 aa  142  8e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1926  hypothetical protein  31.86 
 
 		 313 aa  140  3e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.218378  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0669  Luciferase-like monooxygenase  37.1 
 
 		 342 aa  139  3.9999999999999997e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.113099  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0451  luciferase-like protein  30.62 
 
 		 309 aa  139  6e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00720803  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0462  luciferase family protein  30.62 
 
 		 312 aa  139  6e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.628952 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0625  Luciferase-like monooxygenase  35.17 
 
 		 332 aa  138  7.999999999999999e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00154415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0438  luciferase family protein  30.62 
 
 		 309 aa  138  8.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.465558  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0109  Luciferase-like monooxygenase  31.51 
 
 		 307 aa  137  2e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2346  luciferase family protein  30.7 
 
 		 316 aa  136  3.0000000000000003e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0184001 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2107  Luciferase-like monooxygenase  35.55 
 
 		 330 aa  136  4e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.950748  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5951  Luciferase-like monooxygenase  36.44 
 
 		 308 aa  136  4e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.900332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1269  Luciferase-like monooxygenase  36.14 
 
 		 290 aa  136  5e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.213447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1857  Luciferase-like monooxygenase  34.42 
 
 		 287 aa  135  6.0000000000000005e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3873  putative F420-dependent oxidoreductase  39.23 
 
 		 343 aa  134  1.9999999999999998e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0154742  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3697  putative F420-dependent oxidoreductase  30.77 
 
 		 308 aa  131  1.0000000000000001e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.588015  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04560  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  34.51 
 
 		 306 aa  131  1.0000000000000001e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.36075  normal  0.0961498 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7341  Luciferase-like monooxygenase  35.95 
 
 		 309 aa  131  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00268267 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3910  putative F420-dependent oxidoreductase  35.56 
 
 		 314 aa  129  5.0000000000000004e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3286  luciferase family protein  35.11 
 
 		 307 aa  128  1.0000000000000001e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0452434 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4098  luciferase family protein  31.83 
 
 		 310 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.207864  normal  0.49324 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2247  luciferase family protein  30.57 
 
 		 310 aa  126  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2491  luciferase family protein  29.43 
 
 		 310 aa  126  5e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.2611  normal  0.915237 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2867  putative F420-dependent oxidoreductase  29.75 
 
 		 311 aa  125  6e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3231  putative F420-dependent oxidoreductase  36.4 
 
 		 324 aa  125  6e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0395  Luciferase-like monooxygenase  31.27 
 
 		 306 aa  125  6e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.104379  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1342  Luciferase-like monooxygenase  31.99 
 
 		 311 aa  124  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.256746  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0709  Luciferase-like monooxygenase  31.6 
 
 		 307 aa  124  3e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0592  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  35.66 
 
 		 265 aa  122  6e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2295  sugar transporter superfamily protein  32.38 
 
 		 251 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.467555  normal  0.780737 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2233  hypothetical protein  30.72 
 
 		 310 aa  119  4.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00182437  decreased coverage  0.00000088983 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0454  Luciferase-like monooxygenase  34.12 
 
 		 322 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4671  Luciferase-like monooxygenase  35 
 
 		 287 aa  118  9.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.444126  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0190  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  35.17 
 
 		 264 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1517  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  34.91 
 
 		 255 aa  117  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00351914  normal  0.0459793 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27940  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  32.96 
 
 		 262 aa  115  6e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.632404  normal  0.0133043 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10807  hypothetical protein  29.52 
 
 		 347 aa  115  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000229169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2014  luciferase family protein  30.46 
 
 		 313 aa  115  7.999999999999999e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.599873  normal  0.371395 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2031  luciferase-like protein  30.66 
 
 		 313 aa  115  8.999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2077  luciferase family protein  30.66 
 
 		 313 aa  115  8.999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.841403 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4972  Luciferase-like monooxygenase  30.45 
 
 		 317 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2098  luciferase family protein  30.93 
 
 		 309 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.463112 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3155  putative F420-dependent oxidoreductase  32.18 
 
 		 321 aa  109  4.0000000000000004e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00585618 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>