More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3673 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3673  heat shock protein 70  100 
 
 		 556 aa  1107    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.192305  normal  0.510271 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1059  2-alkenal reductase  80.86 
 
 		 580 aa  909    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00230509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1192  2-alkenal reductase  53.05 
 
 		 628 aa  493  9.999999999999999e-139  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0183455  normal  0.153916 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4755  Heat shock protein 70  47.77 
 
 		 558 aa  460  9.999999999999999e-129  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1873  Heat shock protein 70  48.54 
 
 		 527 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0915077  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6998  2-alkenal reductase  43.45 
 
 		 546 aa  375  1e-102  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1395  Heat shock protein 70  43.02 
 
 		 538 aa  348  1e-94  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.176666  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1403  Heat shock protein 70  46.99 
 
 		 538 aa  283  6.000000000000001e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0310  molecular chaperone DnaK  36.43 
 
 		 644 aa  280  4e-74  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2846  molecular chaperone DnaK  35.71 
 
 		 636 aa  277  4e-73  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.769317  normal  0.885007 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3585  Heat shock protein 70  36.62 
 
 		 525 aa  275  1.0000000000000001e-72  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.219704  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2013  chaperone protein DnaK  36.2 
 
 		 636 aa  275  2.0000000000000002e-72  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0682  molecular chaperone DnaK  36.7 
 
 		 644 aa  274  2.0000000000000002e-72  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  hitchhiker  0.00979445  normal  0.319162 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1142  dnak protein, truncation  35.61 
 
 		 505 aa  273  5.000000000000001e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0571  chaperone protein DnaK  36.31 
 
 		 651 aa  268  2e-70  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0634  molecular chaperone DnaK  36.65 
 
 		 622 aa  259  6e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0268741 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1128  molecular chaperone DnaK  35.74 
 
 		 596 aa  259  9e-68  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4270  chaperone protein DnaK  35.85 
 
 		 613 aa  259  1e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.567821  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12800  chaperone protein DnaK  35.35 
 
 		 617 aa  258  2e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0339068  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0462  molecular chaperone DnaK  36.46 
 
 		 622 aa  258  3e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0589911  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0473  molecular chaperone DnaK  36.46 
 
 		 622 aa  258  3e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.518143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0449  molecular chaperone DnaK  36.46 
 
 		 622 aa  258  3e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2079  molecular chaperone DnaK  35.5 
 
 		 612 aa  256  8e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0260  molecular chaperone DnaK  36.1 
 
 		 622 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0242137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4363  chaperone protein DnaK  35.84 
 
 		 621 aa  255  2.0000000000000002e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.62994  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1322  molecular chaperone DnaK  35.91 
 
 		 608 aa  255  2.0000000000000002e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1996  chaperone protein DnaK  35.73 
 
 		 616 aa  253  5.000000000000001e-66  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.278133  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0486  chaperone protein DnaK  36.28 
 
 		 613 aa  253  6e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.403398  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2005  molecular chaperone DnaK  36.74 
 
 		 619 aa  253  6e-66  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3221  chaperone protein DnaK  35.08 
 
 		 613 aa  253  6e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000155222  hitchhiker  0.000112809 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0366  chaperone protein DnaK  35.98 
 
 		 617 aa  253  7e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1649  molecular chaperone DnaK  35.36 
 
 		 600 aa  253  8.000000000000001e-66  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.00000228474  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0349  chaperone protein DnaK  36.38 
 
 		 619 aa  252  1e-65  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.760609 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4299  chaperone protein DnaK  35.69 
 
 		 614 aa  252  1e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000344798  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2290  molecular chaperone DnaK  36.74 
 
 		 619 aa  252  1e-65  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2333  Heat shock protein 70  34.4 
 
 		 571 aa  251  2e-65  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0102909  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10355  molecular chaperone DnaK  35.73 
 
 		 625 aa  251  3e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1312  molecular chaperone DnaK  34.47 
 
 		 620 aa  251  3e-65  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.975938  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0607  chaperone protein DnaK  35.88 
 
 		 605 aa  250  4e-65  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2437  molecular chaperone DnaK  35.39 
 
 		 609 aa  250  4e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0177515  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0585  molecular chaperone DnaK  35.71 
 
 		 612 aa  250  5e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0622  chaperone protein DnaK  35.08 
 
 		 600 aa  249  9e-65  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0182249  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1013  molecular chaperone DnaK  35.57 
 
 		 607 aa  249  1e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0017  chaperone protein DnaK  34.54 
 
 		 607 aa  248  2e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0836411  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2829  molecular chaperone DnaK  33.86 
 
 		 639 aa  248  2e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000221772  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1183  chaperone protein DnaK  34.06 
 
 		 621 aa  248  3e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0207738 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0238  chaperone protein DnaK  34.96 
 
 		 617 aa  247  4e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0558  molecular chaperone DnaK  36.01 
 
 		 596 aa  247  4.9999999999999997e-64  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000712029  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4807  chaperone protein DnaK  36.28 
 
 		 627 aa  247  4.9999999999999997e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0544  molecular chaperone DnaK  36.01 
 
 		 596 aa  247  4.9999999999999997e-64  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000156043  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18810  chaperone protein DnaK  36.26 
 
 		 619 aa  246  6.999999999999999e-64  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.000228841  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38580  molecular chaperone DnaK  36.03 
 
 		 619 aa  246  8e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3040  molecular chaperone DnaK  35.29 
 
 		 611 aa  244  3e-63  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00371725  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1207  chaperone protein DnaK  33.21 
 
 		 620 aa  244  3e-63  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.558053  normal  0.0128499 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1638  molecular chaperone DnaK  34.29 
 
 		 610 aa  244  3e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1672  molecular chaperone DnaK  34.29 
 
 		 610 aa  244  3e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0554333  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0798  chaperone protein DnaK  34.88 
 
 		 642 aa  243  3.9999999999999997e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.430044 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0196  molecular chaperone DnaK  35.85 
 
 		 613 aa  243  7e-63  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0211  molecular chaperone DnaK  34.84 
 
 		 635 aa  243  7.999999999999999e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000228003  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0822  molecular chaperone DnaK  34.06 
 
 		 623 aa  243  9e-63  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.762106 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4395  molecular chaperone DnaK  35.78 
 
 		 611 aa  242  1e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00031537  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1061  chaperone protein DnaK  34.81 
 
 		 609 aa  242  1e-62  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00544599  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3709  chaperone protein DnaK  35.47 
 
 		 628 aa  242  1e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.609009 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0113  molecular chaperone DnaK  35.11 
 
 		 613 aa  242  1e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2311  chaperone protein DnaK  34.94 
 
 		 620 aa  242  1e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000072076  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4447  molecular chaperone DnaK  35.78 
 
 		 611 aa  242  1e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000527769  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2349  chaperone protein DnaK  35.37 
 
 		 613 aa  241  2e-62  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.234664 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0033  molecular chaperone DnaK  34.03 
 
 		 636 aa  241  2e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0201  chaperone protein DnaK  35.7 
 
 		 621 aa  240  4e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.00131999  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0128  chaperone DnaK  34.2 
 
 		 610 aa  240  4e-62  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.438221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0112  molecular chaperone DnaK  35.11 
 
 		 611 aa  240  5e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000334679 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0107  molecular chaperone DnaK  33.86 
 
 		 634 aa  240  5.999999999999999e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0126383  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0402  molecular chaperone DnaK  34.03 
 
 		 643 aa  240  5.999999999999999e-62  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.362768  normal  0.130805 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3808  molecular chaperone DnaK  35.53 
 
 		 622 aa  239  6.999999999999999e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1148  molecular chaperone DnaK  35.29 
 
 		 609 aa  239  8e-62  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1404  molecular chaperone DnaK  34.23 
 
 		 636 aa  239  9e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00594741  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5218  chaperone protein DnaK  34.81 
 
 		 616 aa  238  1e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4165  molecular chaperone DnaK  35.55 
 
 		 611 aa  239  1e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0072304  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0803  molecular chaperone DnaK  35.42 
 
 		 611 aa  239  1e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000557012  hitchhiker  1.18258e-19 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0481  molecular chaperone DnaK  32.98 
 
 		 632 aa  239  1e-61  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.995968 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1857  chaperone protein DnaK  33.22 
 
 		 634 aa  239  1e-61  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.48681  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2496  molecular chaperone DnaK  34.93 
 
 		 615 aa  239  1e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00612679  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4213  molecular chaperone DnaK  35.42 
 
 		 611 aa  238  2e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000284516  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4051  molecular chaperone DnaK  35.42 
 
 		 611 aa  238  2e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000559283  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4061  molecular chaperone DnaK  35.42 
 
 		 611 aa  238  2e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000542106  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6949  molecular chaperone DnaK  34.87 
 
 		 619 aa  238  2e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4433  molecular chaperone DnaK  35.42 
 
 		 611 aa  238  2e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000173012  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1551  chaperone protein DnaK  34.23 
 
 		 607 aa  238  2e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.15099  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0081  molecular chaperone DnaK  35.34 
 
 		 624 aa  238  2e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4539  molecular chaperone DnaK  35.42 
 
 		 611 aa  238  2e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000969384  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4336  molecular chaperone DnaK  35.42 
 
 		 611 aa  238  2e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.67993e-38 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05490  chaperone protein DnaK  35.22 
 
 		 631 aa  238  2e-61  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3389  molecular chaperone DnaK  33.45 
 
 		 641 aa  238  2e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1209  molecular chaperone DnaK  34.41 
 
 		 596 aa  237  3e-61  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000215559  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl415  molecular chaperone DnaK  34.85 
 
 		 592 aa  237  3e-61  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.847356  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1578  chaperone DnaK  34.77 
 
 		 610 aa  238  3e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0247  chaperone protein DnaK  33.52 
 
 		 621 aa  237  5.0000000000000005e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.533017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1347  molecular chaperone DnaK  34 
 
 		 615 aa  236  6e-61  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.730753  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3532  molecular chaperone DnaK  33.45 
 
 		 638 aa  236  7e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00119444  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3505  molecular chaperone DnaK  33.68 
 
 		 640 aa  236  8e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00228392  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>