45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2912 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2912  Rossmann fold nucleotide-binding protein-like  100 
 
 		 165 aa  318  3e-86  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.492417 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1307  hypothetical protein  50.55 
 
 		 148 aa  91.7  4e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.120838  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0796  hypothetical protein  40 
 
 		 155 aa  87.8  6e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1584  hypothetical protein  44.79 
 
 		 162 aa  87.8  6e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0315966  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0569  Rossmann fold nucleotide-binding protein-like protein  37.5 
 
 		 162 aa  85.1  4e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00359855  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0594  hypothetical protein  38.6 
 
 		 159 aa  84.7  5e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.797474  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0411  hypothetical protein  44.9 
 
 		 157 aa  82.8  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.556194 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1049  hypothetical protein  45.74 
 
 		 158 aa  81.6  0.000000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.176364 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0404  hypothetical protein  49.46 
 
 		 160 aa  81.3  0.000000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0153  hypothetical protein  45.45 
 
 		 156 aa  81.3  0.000000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0307047 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_534  hypothetical protein  36.84 
 
 		 162 aa  80.5  0.00000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1308  hypothetical protein  41.58 
 
 		 152 aa  79.3  0.00000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.296823  normal  0.0132705 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0814  hypothetical protein  41.07 
 
 		 146 aa  75.9  0.0000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.47066 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4352  lysine decarboxylase family protein  40.57 
 
 		 168 aa  76.6  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.383746  normal  0.682676 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3844  hypothetical protein  41.84 
 
 		 156 aa  73.2  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.991912  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3727  hypothetical protein  40.46 
 
 		 154 aa  72.8  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4351  hypothetical protein  55.79 
 
 		 156 aa  72.4  0.000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1965  hypothetical protein  41.67 
 
 		 148 aa  72  0.000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.31453  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2033  hypothetical protein  43.33 
 
 		 154 aa  71.6  0.000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2411  hypothetical protein  39.36 
 
 		 176 aa  70.9  0.000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.19576 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1975  hypothetical protein  40.5 
 
 		 149 aa  70.9  0.000000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2479  hypothetical protein  40 
 
 		 158 aa  69.7  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1012  hypothetical protein  32.88 
 
 		 157 aa  64.3  0.0000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.535443  normal  0.791776 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0450  hypothetical protein  54.55 
 
 		 181 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0356  hypothetical protein  54.55 
 
 		 181 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.329787  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2080  hypothetical protein  54.55 
 
 		 170 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1107  hypothetical protein  54.55 
 
 		 170 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0816  hypothetical protein  54.55 
 
 		 170 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1818  hypothetical protein  54.55 
 
 		 151 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.132048  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1788  hypothetical protein  54.55 
 
 		 170 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0512  hypothetical protein  45.71 
 
 		 154 aa  62  0.000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.602791  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0351  Rossmann fold nucleotide-binding protein-like protein  44.95 
 
 		 165 aa  59.3  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0109042 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1458  Rossmann fold nucleotide-binding protein  33.06 
 
 		 165 aa  58.5  0.00000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2145  Rossmann fold nucleotide-binding protein  42.05 
 
 		 161 aa  58.2  0.00000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4787  hypothetical protein  50.82 
 
 		 184 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5377  hypothetical protein  50.82 
 
 		 184 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5484  hypothetical protein  50.82 
 
 		 184 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3460  MCP1; molybdenum cofactor carrier protein  38.46 
 
 		 163 aa  55.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2644  P450 cytochrome, putative  38.46 
 
 		 163 aa  55.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0934  hypothetical protein  33.33 
 
 		 184 aa  52.8  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4521  P450 cytochrome, putative  31.75 
 
 		 165 aa  51.2  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.136581 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1753  hypothetical protein  39.08 
 
 		 171 aa  49.7  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1549  P450 cytochrome, putative  36.96 
 
 		 161 aa  49.7  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.30378  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2925  hypothetical protein  35.8 
 
 		 182 aa  49.7  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.221472  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0547  acyl-CoA synthetase  36.76 
 
 		 199 aa  47  0.0001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.157303 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>