41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2902 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2902  hypothetical protein  100 
 
 		 327 aa  649    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0353217  normal  0.31292 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2311  hypothetical protein  86.75 
 
 		 347 aa  418  1e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.1559  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4073  protein of unknown function DUF124  44.55 
 
 		 220 aa  159  8e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0236  hypothetical protein  45.7 
 
 		 219 aa  155  7e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.761624  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4445  hypothetical protein  44.4 
 
 		 301 aa  155  1e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3945  hypothetical protein  45.23 
 
 		 273 aa  152  7e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4019  hypothetical protein  45.23 
 
 		 273 aa  152  7e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3959  hypothetical protein  45.23 
 
 		 273 aa  152  8e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0146927 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2247  hypothetical protein  41.67 
 
 		 304 aa  149  9e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.151804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2504  hypothetical protein  42.01 
 
 		 243 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00378387  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3708  protein of unknown function DUF124  40.54 
 
 		 449 aa  145  1e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.737309  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4681  protein of unknown function DUF124  40.26 
 
 		 232 aa  144  1e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0576397  normal  0.487392 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4269  protein of unknown function DUF124  41.92 
 
 		 256 aa  141  1.9999999999999998e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0370045  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2449  protein of unknown function DUF124  39.91 
 
 		 222 aa  136  5e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.606578 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0789  protein of unknown function DUF124  39.19 
 
 		 223 aa  135  9.999999999999999e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07530  hypothetical protein  37.33 
 
 		 225 aa  134  3e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.681488  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3200  hypothetical protein  40.48 
 
 		 236 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2309  hypothetical protein  36.86 
 
 		 532 aa  130  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.739249  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24890  hypothetical protein  38.91 
 
 		 239 aa  130  2.0000000000000002e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2904  hypothetical protein  36.33 
 
 		 453 aa  131  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.48904  normal  0.788962 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3674  protein of unknown function DUF124  40.43 
 
 		 222 aa  125  9e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2903  hypothetical protein  34.09 
 
 		 225 aa  123  4e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.1717  normal  0.712803 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2310  hypothetical protein  36.36 
 
 		 225 aa  121  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.360576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1629  hypothetical protein  34.89 
 
 		 251 aa  120  3e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.630619 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0308  hypothetical protein  34.6 
 
 		 231 aa  120  3e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1748  protein of unknown function DUF124  36.92 
 
 		 218 aa  105  1e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1635  protein of unknown function DUF124  33.49 
 
 		 218 aa  95.9  8e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.175019 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3123  protein of unknown function DUF124  31.7 
 
 		 221 aa  95.5  1e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35190  hypothetical protein  34.31 
 
 		 202 aa  94.4  2e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2819  hypothetical protein  32.54 
 
 		 230 aa  89.4  7e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2433  hypothetical protein  32.38 
 
 		 229 aa  88.6  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.227247  normal  0.45285 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2236  protein of unknown function DUF124  31.65 
 
 		 216 aa  87.8  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000939724  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1840  protein of unknown function DUF124  31.25 
 
 		 209 aa  74.7  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2235  protein of unknown function DUF124  29.52 
 
 		 227 aa  72.8  0.000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00213908  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4759  protein of unknown function DUF124  27.54 
 
 		 206 aa  72  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.581241  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35200  hypothetical protein  29.33 
 
 		 224 aa  63.2  0.000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1839  protein of unknown function DUF124  28.64 
 
 		 222 aa  52.8  0.000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4758  protein of unknown function DUF124  25.42 
 
 		 234 aa  52.4  0.000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.386135  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4757  protein of unknown function DUF124  31.28 
 
 		 253 aa  52.4  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2237  protein of unknown function DUF124  26.77 
 
 		 249 aa  48.5  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000136487  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3630  protein of unknown function DUF124  23.65 
 
 		 428 aa  43.9  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>