More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2406 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2406  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 897 aa  1770    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0350264 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1178  AMP-dependent synthetase and ligase  43.18 
 
 		 950 aa  622  1e-177  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0144635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1665  AMP-dependent synthetase and ligase  40.28 
 
 		 937 aa  575  1.0000000000000001e-162  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.175798  normal  0.265588 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3137  AMP-dependent synthetase and ligase  38.02 
 
 		 866 aa  437  1e-121  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00387942  normal  0.129618 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2675  AMP-dependent synthetase and ligase  32.84 
 
 		 1297 aa  344  4e-93  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.36707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0433  AMP-dependent synthetase and ligase  38.87 
 
 		 634 aa  342  2e-92  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.811397  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0365  thioesterase  51.4 
 
 		 361 aa  326  1e-87  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.387154 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2089  amino acid adenylation domain-containing protein  32.48 
 
 		 1363 aa  292  2e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1865  amino acid adenylation  36.02 
 
 		 1344 aa  287  5.999999999999999e-76  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3973  amino acid adenylation domain-containing protein  30.22 
 
 		 6661 aa  286  1.0000000000000001e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1617  amino acid adenylation domain-containing protein  30.94 
 
 		 1336 aa  281  4e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4101  amino acid adenylation  27.32 
 
 		 1345 aa  278  3e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.357734  normal  0.611275 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2179  amino acid adenylation domain-containing protein  29.68 
 
 		 2386 aa  276  1.0000000000000001e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4985  amino acid adenylation domain protein  27.98 
 
 		 1336 aa  275  3e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.247998 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3693  amino acid adenylation domain protein  31.9 
 
 		 2274 aa  274  6e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3342  peptide synthetase  32.83 
 
 		 1334 aa  271  4e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18420  amino acid adenylation enzyme/thioester reductase family protein  30.64 
 
 		 2365 aa  270  1e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1748  amino acid adenylation domain protein  30.02 
 
 		 7712 aa  268  2.9999999999999995e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.970061 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1888  amino acid adenylation domain protein  32.97 
 
 		 1315 aa  267  7e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0349547  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2472  nonribosomal peptide synthetase DhbF  29.06 
 
 		 2385 aa  267  8e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1861  amino acid adenylation domain-containing protein  33.24 
 
 		 2883 aa  266  1e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3855  amino acid adenylation  28.33 
 
 		 888 aa  266  2e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4562  amino acid adenylation domain-containing protein  30.85 
 
 		 7785 aa  265  3e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2337  nonribosomal peptide synthetase DhbF  29.08 
 
 		 2385 aa  265  3e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2988  nonribosomal peptide synthetase DhbF  29.02 
 
 		 2385 aa  264  4.999999999999999e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2402  nonribosomal peptide synthetase DhbF  28.6 
 
 		 2385 aa  264  6e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.777196  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2968  amino acid adenylation domain-containing protein  29.23 
 
 		 1331 aa  263  1e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.161753 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2131  nonribosomal peptide synthetase  28.7 
 
 		 2385 aa  262  2e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2131  hypothetical protein  27.06 
 
 		 1439 aa  262  3e-68  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3722  amino acid adenylation  29.5 
 
 		 6676 aa  261  3e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05859  peptide synthetase protein  33.38 
 
 		 5953 aa  261  4e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1883  non-ribosomal peptide synthetase  32.17 
 
 		 1314 aa  259  1e-67  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.20791  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2390  nonribosomal peptide synthetase DhbF  28.57 
 
 		 2385 aa  259  1e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2147  nonribosomal peptide synthetase  28.57 
 
 		 2385 aa  260  1e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.633458  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2208  nonribosomal peptide synthetase DhbF  28.79 
 
 		 2385 aa  259  2e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2372  nonribosomal peptide synthetase DhbF  28.79 
 
 		 2385 aa  259  2e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4083  amino acid adenylation domain-containing protein  31.57 
 
 		 3942 aa  255  3e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.223479 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1882  amino acid adenylation domain-containing protein  28.67 
 
 		 5596 aa  254  7e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1758  amino acid adenylation domain-containing protein  27.78 
 
 		 2386 aa  251  4e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6556  siderophore 2,3-dihydroxybenzoate (DHB) synthesis protein  31.12 
 
 		 1305 aa  250  9e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.416947  hitchhiker  0.00000457979 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1935  amino acid adenylation domain-containing protein  26.37 
 
 		 3291 aa  249  2e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1367  amino acid adenylation domain protein  32.4 
 
 		 6403 aa  248  3e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3542  amino acid adenylation domain-containing protein  31.54 
 
 		 2845 aa  248  4e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21020  putative non-ribosomal peptide synthetase  30.33 
 
 		 2352 aa  246  9.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3602  cyclic nucleotide-binding protein  31.41 
 
 		 8211 aa  244  3.9999999999999997e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2859  peptide synthase  30.47 
 
 		 4991 aa  243  1e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2459  amino acid adenylation  33.24 
 
 		 4489 aa  243  1e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.765153 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4699  non-ribosomal peptide synthetase, terminal component  28.6 
 
 		 4531 aa  242  2e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5617  amino acid adenylation domain-containing protein  29.07 
 
 		 4968 aa  243  2e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0546  amino acid adenylation domain-containing protein  25.86 
 
 		 2151 aa  241  5.999999999999999e-62  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01401  enterobactin synthase subunit F  30.21 
 
 		 1317 aa  239  1e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3715  amino acid adenylation domain protein  29.98 
 
 		 4520 aa  238  5.0000000000000005e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2381  amino acid adenylation domain protein  27.85 
 
 		 4196 aa  238  5.0000000000000005e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4219  non-ribosomal siderophore peptide synthetase  29.49 
 
 		 3470 aa  237  9e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2667  peptide synthetase-domain-containing protein  35.96 
 
 		 630 aa  236  1.0000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.229072  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2616  amino acid adenylation  30.91 
 
 		 13537 aa  236  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2873  bacitracin synthetase 1  28.55 
 
 		 4960 aa  236  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1680  amino acid adenylation domain-containing protein  30.04 
 
 		 1405 aa  235  3e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.616011  normal  1 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9641  peptide synthetase  31.94 
 
 		 3761 aa  234  5e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1415  peptide synthetase-domain-containing protein  35.78 
 
 		 612 aa  234  5e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1638  peptide synthetase-domain-containing protein  35.78 
 
 		 612 aa  234  5e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.107394  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2140  peptide synthetase-domain-containing protein  35.78 
 
 		 633 aa  234  5e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.279646  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3173  peptide synthetase-domain-containing protein  35.78 
 
 		 612 aa  234  5e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.330273  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2525  amino acid adenylation domain-containing protein  35.78 
 
 		 633 aa  234  5e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2579  amino acid adenylation domain-containing protein  35.78 
 
 		 612 aa  234  6e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0745582  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1322  amino acid adenylation domain protein  30.48 
 
 		 2877 aa  233  9e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6812  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase module  31.4 
 
 		 2370 aa  232  2e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2213  amino acid adenylation  30.72 
 
 		 4882 aa  232  3e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2463  bacitracin synthetase 1  28.23 
 
 		 4960 aa  231  4e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1434  amino acid adenylation domain protein  29.03 
 
 		 877 aa  230  1e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1593  non-ribosomal peptide synthase  32.45 
 
 		 1346 aa  229  2e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1643  putative peptide synthetase  32.69 
 
 		 3328 aa  228  3e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1741  amino acid adenylation domain protein  31.8 
 
 		 2403 aa  228  3e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0995  amino acid adenylation domain-containing protein  26.8 
 
 		 1284 aa  228  3e-58  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.966277  hitchhiker  0.000000137922 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1213  peptide synthetase-like protein  32.05 
 
 		 1320 aa  228  3e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.313866  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1941  putative peptide synthetase  32.69 
 
 		 3352 aa  228  3e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0693  hypothetical protein  32.69 
 
 		 6072 aa  228  4e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2212  non-ribosomal peptide synthase  32.69 
 
 		 6081 aa  228  5.0000000000000005e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2294  syringomycin synthetase  32.69 
 
 		 6006 aa  228  5.0000000000000005e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0187  syringopeptin synthetase C  32.04 
 
 		 1345 aa  227  7e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2962  amino acid adenylation domain-containing protein  32.29 
 
 		 1356 aa  226  1e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.639198  hitchhiker  0.00173398 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4110  putative non-ribosomal peptide synthase  32.3 
 
 		 1498 aa  222  1.9999999999999999e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.734915  normal  0.2622 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6472  amino acid adenylation domain-containing protein  30.82 
 
 		 8914 aa  222  1.9999999999999999e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3098  amino acid adenylation domain-containing protein  29.78 
 
 		 3524 aa  222  3e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2208  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  32.6 
 
 		 1829 aa  221  3.9999999999999997e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.190766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1675  CtaG  33.24 
 
 		 1353 aa  221  3.9999999999999997e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9643  peptide synthetase  31.83 
 
 		 2561 aa  221  5e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2608  amino acid adenylation  32.94 
 
 		 9498 aa  221  7e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1953  peptide synthetase-domain-containing protein  34.94 
 
 		 612 aa  219  2e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0370  amino acid adenylation domain protein  35.93 
 
 		 4090 aa  218  2.9999999999999998e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1849  amino acid adenylation  28.05 
 
 		 1383 aa  218  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3725  polyketide synthase modules and related proteins-like  27.86 
 
 		 3111 aa  218  2.9999999999999998e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.816556 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3742  amino acid adenylation domain protein  32.07 
 
 		 1358 aa  218  5e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.798811  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2150  pyoverdine sidechain peptide synthetase IV, D-Asp-L-Ser component  28.63 
 
 		 2875 aa  217  8e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3701  non-ribosomal peptide synthase  30.11 
 
 		 3962 aa  217  8e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0642  amino acid adenylation domain protein  31.14 
 
 		 1282 aa  216  9.999999999999999e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.163069  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3733  amino acid adenylation domain protein  29.97 
 
 		 2855 aa  215  2.9999999999999995e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3419  amino acid adenylation domain protein  27.67 
 
 		 3453 aa  215  3.9999999999999995e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3730  amino acid adenylation domain-containing protein  34.08 
 
 		 2651 aa  215  3.9999999999999995e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.390082 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4519  non-ribosomal peptide synthetase, terminal component  26.14 
 
 		 3432 aa  214  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>