33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0931 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0931  hypothetical protein  100 
 
 		 620 aa  1226    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5610  methyltransferase type 12  60.48 
 
 		 613 aa  645    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.194335  hitchhiker  0.000698076 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5277  methyltransferase type 12  40.67 
 
 		 625 aa  398  1e-109  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.162959 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1217  Methyltransferase type 12  36.97 
 
 		 607 aa  317  3e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.861271  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3474  Methyltransferase type 12  41.27 
 
 		 371 aa  232  2e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.253351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1188  methyltransferase type 12  40.33 
 
 		 303 aa  190  5.999999999999999e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.222476  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1190  hypothetical protein  40.68 
 
 		 330 aa  152  1e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3803  Methyltransferase type 12  23.95 
 
 		 300 aa  65.9  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.157905  normal  0.599602 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2154  methyltransferase type 11  21.05 
 
 		 291 aa  65.1  0.000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2682  Methyltransferase type 12  28.81 
 
 		 358 aa  61.6  0.00000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.454648  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2304  Methyltransferase type 11  22.63 
 
 		 317 aa  61.6  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000442527  normal  0.300878 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0355  methyltransferase type 12  27.78 
 
 		 342 aa  61.6  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.896215 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0142  methyltransferase type 12  28.09 
 
 		 309 aa  61.2  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1232  glycosyl transferase family protein  32.43 
 
 		 1037 aa  61.2  0.00000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4412  methyltransferase type 11  23.16 
 
 		 303 aa  56.2  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.033739  normal  0.97195 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1348  methyltransferase type 11  23.75 
 
 		 286 aa  54.7  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.71095  hitchhiker  0.00964289 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4080  methyltransferase type 12  24.27 
 
 		 274 aa  53.9  0.000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.317944 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5520  Methyltransferase type 12  22.63 
 
 		 306 aa  52.8  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.281271 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3910  hypothetical protein  27.59 
 
 		 305 aa  52.4  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.230808  normal  0.860748 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2291  Methyltransferase type 11  30.17 
 
 		 251 aa  52.4  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.453235 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2893  methyltransferase type 11  32.69 
 
 		 317 aa  50.4  0.00009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1129  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 		 785 aa  47.8  0.0006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0080  Methyltransferase type 11  23.67 
 
 		 353 aa  47.8  0.0007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0077  hypothetical protein  23.67 
 
 		 353 aa  47.8  0.0007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2627  methyltransferase type 11  25.11 
 
 		 306 aa  47  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0752  methyltransferase type 11  27.95 
 
 		 214 aa  46.2  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2892  methyltransferase type 12  27.04 
 
 		 311 aa  45.4  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0420  hypothetical protein  26.2 
 
 		 312 aa  45.4  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2510  hypothetical protein  31.12 
 
 		 308 aa  45.1  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1111  Methyltransferase type 12  25.53 
 
 		 310 aa  45.1  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.100428  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  26.54 
 
 		 1094 aa  44.7  0.006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0836  Methyltransferase type 12  31.58 
 
 		 310 aa  43.9  0.009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3232  hypothetical protein  25.45 
 
 		 323 aa  43.5  0.01  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.470904  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>