More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_1272 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009718  Fnod_1272  ABC transporter related  100 
 
 
224 aa  449  1e-125  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1750  ABC transporter related  46.85 
 
 
226 aa  189  4e-47  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.465278  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0702  ABC transporter related  42.41 
 
 
266 aa  176  3e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0111496  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1504  ABC transporter related  44.5 
 
 
268 aa  171  1e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0726  ABC transporter related  41.82 
 
 
262 aa  171  1e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.904446  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1011  ABC transporter related  44.64 
 
 
287 aa  161  9e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000809706  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1687  ABC transporter related  42.41 
 
 
288 aa  158  6e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2682  cobalt transporter ATP-binding subunit  40.61 
 
 
285 aa  157  2e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.150341  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01480  ABC transporter related  39.91 
 
 
283 aa  153  2e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000123426  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2936  cobalt transporter ATP-binding subunit  37.73 
 
 
281 aa  153  2e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1152  ABC transporter related protein  33.78 
 
 
279 aa  153  2e-36  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00740539  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02430  ABC transporter related  39.91 
 
 
283 aa  153  2e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.296301  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2289  cobalt transporter ATP-binding subunit  34.51 
 
 
286 aa  150  2e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.922871  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2248  cobalt transporter ATP-binding subunit  34.51 
 
 
286 aa  150  2e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.231433  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0624  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  36.73 
 
 
274 aa  150  2e-35  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.458442  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0898  cobalt transporter ATP-binding subunit  37.05 
 
 
286 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000182138  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0226  ABC transporter related  37.17 
 
 
290 aa  146  2.0000000000000003e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00993646  normal  0.660997 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3636  ABC transporter related  36.44 
 
 
286 aa  145  5e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000375654  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1802  cobalt transporter ATP-binding subunit  34.22 
 
 
286 aa  144  1e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.135758  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0140  cobalt transporter ATP-binding subunit  36 
 
 
293 aa  142  4e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0875323  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0791  ABC transporter related  37.86 
 
 
280 aa  141  6e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0233186  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0140  cobalt transporter ATP-binding subunit  36 
 
 
293 aa  141  8e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0135  cobalt transporter ATP-binding subunit  36 
 
 
293 aa  141  8e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.168047  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0140  cobalt transporter ATP-binding subunit  36 
 
 
293 aa  141  8e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000645208  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0153  cobalt transporter ATP-binding subunit  36 
 
 
293 aa  141  8e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1113499999999999e-42 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0171  cobalt transporter ATP-binding subunit  36 
 
 
293 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000671668  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0829  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  36.56 
 
 
292 aa  140  9.999999999999999e-33  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.773526  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0161  cobalt transporter ATP-binding subunit  35.56 
 
 
293 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00175996  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1418  ABC transporter related  37.89 
 
 
287 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0135  cobalt transporter ATP-binding subunit  35.56 
 
 
293 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00645923  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1454  ABC transporter related  37.07 
 
 
288 aa  139  3e-32  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000218483  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0289  cobalt transporter ATP-binding subunit  36.36 
 
 
288 aa  138  6e-32  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0412656  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1041  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  38.24 
 
 
270 aa  138  6e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.286064 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0137  cobalt transporter ATP-binding subunit  35.19 
 
 
290 aa  137  8.999999999999999e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5165  cobalt transporter ATP-binding subunit  34.53 
 
 
293 aa  137  1e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000192836  hitchhiker  0.000000000000102962 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1087  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  35.27 
 
 
288 aa  137  1e-31  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0666  ABC transporter ATP-binding protein  37.38 
 
 
215 aa  135  4e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.775453  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1984  cobalt transporter ATP-binding subunit  34.38 
 
 
280 aa  135  4e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.210104  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2150  cobalt transporter ATP-binding subunit  34.53 
 
 
280 aa  135  6.0000000000000005e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0134  cobalt transporter ATP-binding subunit  34.53 
 
 
293 aa  134  8e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000430525  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0226  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  32.89 
 
 
285 aa  134  9e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0246  ABC transporter related  35.59 
 
 
283 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.708185  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07191  ABC transporter ATP-binding protein  36.79 
 
 
215 aa  133  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.30257  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0133  cobalt transporter ATP-binding subunit  36 
 
 
293 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0141  cobalt transporter ATP-binding subunit  34.88 
 
 
291 aa  133  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000352159  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0319  cobalt transporter ATP-binding subunit  32.14 
 
 
288 aa  133  1.9999999999999998e-30  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  3.2074000000000003e-19 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07391  ABC transporter ATP-binding protein  38.16 
 
 
215 aa  134  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07211  ABC transporter ATP-binding protein  36.79 
 
 
215 aa  130  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1303  ABC transporter related  32.88 
 
 
481 aa  130  1.0000000000000001e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0918882  normal  0.057241 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0507  ABC transporter related  31.8 
 
 
234 aa  129  3e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3208  cobalt transport protein ATP-binding subunit  37.07 
 
 
398 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0584  membrane associated ATPase  32.13 
 
 
278 aa  127  9.000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2428  ABC transporter related  34.8 
 
 
283 aa  127  9.000000000000001e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.105598  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2125  ABC transporter related  30 
 
 
272 aa  128  9.000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0679248  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1010  ABC transporter related  36.04 
 
 
272 aa  127  1.0000000000000001e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000205509  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0824  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  34.51 
 
 
770 aa  127  1.0000000000000001e-28  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2301  putative ABC transporter  32.61 
 
 
289 aa  127  2.0000000000000002e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00300112  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1086  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  35.1 
 
 
277 aa  126  2.0000000000000002e-28  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1701  ABC transporter related  34.55 
 
 
292 aa  126  3e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1059  ABC transporter, ATP-binding protein  35.85 
 
 
276 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2049  ABC transporter related  32.2 
 
 
251 aa  125  5e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2066  ABC transporter related  32.2 
 
 
247 aa  125  5e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0721765  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2112  ABC transporter related  32.2 
 
 
247 aa  125  5e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.703459  normal  0.0210861 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl153  cobalt transporter ATP-binding subunit  35.56 
 
 
315 aa  125  6e-28  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0259  hypothetical protein  35.82 
 
 
469 aa  125  6e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.308359 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12570  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  33.33 
 
 
344 aa  125  6e-28  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1694  ABC transporter related  32.5 
 
 
497 aa  125  6e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.118958  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1269  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  34.76 
 
 
281 aa  124  9e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0793  cobalt transporter ATP-binding subunit  35.87 
 
 
278 aa  124  1e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0667  cobalt transporter ATP-binding subunit  35.87 
 
 
289 aa  123  2e-27  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1930  ABC transporter related protein  31.25 
 
 
258 aa  123  2e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24070  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  33.98 
 
 
305 aa  123  2e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.850026  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0577  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  35.12 
 
 
395 aa  124  2e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4055  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  31.88 
 
 
250 aa  123  2e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.50741  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1478  cobalt transporter ATP-binding subunit  33.19 
 
 
277 aa  122  6e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0713  ABC transporter related  33.5 
 
 
282 aa  122  6e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0613  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  33.33 
 
 
627 aa  120  9.999999999999999e-27  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0317  ABC transporter related  29.86 
 
 
283 aa  120  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000872921  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2035  ABC transporter related  35.35 
 
 
252 aa  121  9.999999999999999e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0560  ATPase  35.2 
 
 
234 aa  120  1.9999999999999998e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.536031  normal  0.285253 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1705  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  33.5 
 
 
411 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0998  ABC transporter related  33.17 
 
 
325 aa  120  1.9999999999999998e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.241901  normal  0.595675 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2330  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  32.52 
 
 
403 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1281  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  31.67 
 
 
249 aa  119  3e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.234909  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2736  ABC transporter related protein  33.33 
 
 
234 aa  119  3e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1606  cell division ATP-binding protein FtsE  33.78 
 
 
228 aa  119  3e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.444006  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0884  ABC transporter related protein  33.82 
 
 
255 aa  119  3e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1541  ABC transporter related  31.76 
 
 
548 aa  119  3e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.795149  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf376  cobalt transporter ATP-binding subunit  34.56 
 
 
267 aa  119  3.9999999999999996e-26  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.0109258  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0189  ABC transporter related  36.14 
 
 
242 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000239046  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0707  ABC transporter related  32.84 
 
 
568 aa  119  3.9999999999999996e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0149651 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1963  ABC transporter, ATPase subunit  34.52 
 
 
268 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3661  ABC transporter related  31.98 
 
 
226 aa  119  3.9999999999999996e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0026  hypothetical protein  34.33 
 
 
647 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0093  cobalt transporter ATP-binding subunit  36.06 
 
 
278 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0728  cobalt transporter ATP-binding subunit  36.1 
 
 
281 aa  118  6e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.216376  normal  0.366989 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1948  cobalt ABC transporter ATPase  32.43 
 
 
289 aa  118  7e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.701043  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0092  ABC transporter related  33.66 
 
 
282 aa  118  7.999999999999999e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07791  ABC transporter ATP-binding protein  38.12 
 
 
210 aa  118  9e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.734728  hitchhiker  0.00527786 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0394  ABC transporter related  34.98 
 
 
223 aa  118  9e-26  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.163347  normal  0.690039 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>