More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0651 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_0651  50S ribosomal protein L19  100 
 
 		 115 aa  222  1e-57  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1800  50S ribosomal protein L19  80.87 
 
 		 115 aa  191  3e-48  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0132543  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1234  50S ribosomal protein L19  72.16 
 
 		 115 aa  149  2e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000814658  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1221  50S ribosomal protein L19  72.16 
 
 		 115 aa  149  2e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000033527  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1031  ribosomal protein L19  65.79 
 
 		 124 aa  144  3e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.980143  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1201  50S ribosomal protein L19  66.07 
 
 		 115 aa  140  4e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000297862  normal  0.163388 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1366  ribosomal protein L19  66.67 
 
 		 114 aa  139  9.999999999999999e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0325  ribosomal protein L19  59.32 
 
 		 119 aa  139  9.999999999999999e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.182051  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2050  50S ribosomal protein L19  64.86 
 
 		 115 aa  139  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000005578  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1986  ribosomal protein L19  62.83 
 
 		 118 aa  139  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3755  50S ribosomal protein L19  61.95 
 
 		 113 aa  139  1.9999999999999998e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000580352  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0661  50S ribosomal protein L19  62.28 
 
 		 115 aa  139  1.9999999999999998e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00126623  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1093  ribosomal protein L19  63.72 
 
 		 116 aa  138  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000484447  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0190  50S ribosomal protein L19  61.74 
 
 		 133 aa  138  1.9999999999999998e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2492  50S ribosomal protein L19  64.6 
 
 		 114 aa  137  4.999999999999999e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000053876  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2455  50S ribosomal protein L19  64.6 
 
 		 119 aa  137  7e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0707667  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0971  50S ribosomal protein L19  63.72 
 
 		 113 aa  136  7.999999999999999e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000149666  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3887  50S ribosomal protein L19  64.6 
 
 		 114 aa  135  1e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000863076  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1305  50S ribosomal protein L19  64.6 
 
 		 114 aa  135  1e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000891936  unclonable  6.6564e-26 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1300  50S ribosomal protein L19  60 
 
 		 116 aa  136  1e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000348159  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1325  50S ribosomal protein L19  60 
 
 		 116 aa  136  1e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000150512  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3882  50S ribosomal protein L19  64.6 
 
 		 114 aa  135  1e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000143455  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3691  50S ribosomal protein L19  64.6 
 
 		 114 aa  135  1e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000105797  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3581  50S ribosomal protein L19  64.6 
 
 		 114 aa  135  1e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.43871e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3599  50S ribosomal protein L19  64.6 
 
 		 114 aa  135  1e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000284782  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3853  50S ribosomal protein L19  64.6 
 
 		 114 aa  135  1e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.655990000000001e-63 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3978  50S ribosomal protein L19  64.6 
 
 		 114 aa  135  1e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000147607  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3938  50S ribosomal protein L19  64.6 
 
 		 114 aa  135  1e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000138289  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0807  50S ribosomal protein L19  61.82 
 
 		 116 aa  135  2e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  unclonable  0.000000000000011018  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1274  ribosomal protein L19  56.03 
 
 		 118 aa  135  2e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3663  50S ribosomal protein L19  63.72 
 
 		 114 aa  134  3.0000000000000003e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000597471  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0098  50S ribosomal protein L19  59.65 
 
 		 117 aa  134  3.0000000000000003e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000154416  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2866  50S ribosomal protein L19  58.41 
 
 		 118 aa  133  7.000000000000001e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000321036  hitchhiker  0.000000487764 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0120  50S ribosomal protein L19  59.83 
 
 		 124 aa  133  8e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.332554 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0666  50S ribosomal protein L19  59.13 
 
 		 114 aa  133  9e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0972  50S ribosomal protein L19  63.96 
 
 		 128 aa  133  9e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000207565  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0544  50S ribosomal protein L19  61.95 
 
 		 115 aa  132  9.999999999999999e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0000438423  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1188  50S ribosomal protein L19  60.91 
 
 		 163 aa  132  9.999999999999999e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.186255  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10370  LSU ribosomal protein L19P  62.5 
 
 		 114 aa  133  9.999999999999999e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000106379  unclonable  0.000000000798252 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0945  50S ribosomal protein L19  59.29 
 
 		 114 aa  132  9.999999999999999e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000423852  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1144  50S ribosomal protein L19  61.06 
 
 		 115 aa  132  9.999999999999999e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000366814  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4426  50S ribosomal protein L19  60 
 
 		 131 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0668122  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0549  50S ribosomal protein L19  59.13 
 
 		 115 aa  131  1.9999999999999998e-30  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  8.959370000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1632  50S ribosomal protein L19  59.13 
 
 		 115 aa  131  1.9999999999999998e-30  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000000160789  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1516  ribosomal protein L19  61.4 
 
 		 119 aa  130  3.9999999999999996e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.51247  normal  0.0391873 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0648  50S ribosomal protein L19  58.41 
 
 		 118 aa  130  5e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1491  50S ribosomal protein L19  57.89 
 
 		 116 aa  130  5e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000000425706  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0228  ribosomal protein L19  56.52 
 
 		 119 aa  130  6e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.309115  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0302  ribosomal protein L19  59.82 
 
 		 116 aa  130  6e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000399217  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1413  ribosomal protein L19  59.48 
 
 		 119 aa  130  6.999999999999999e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000153602  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0455  50S ribosomal protein L19  60.75 
 
 		 119 aa  130  9e-30  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03477  50S ribosomal protein L19  59.65 
 
 		 117 aa  130  9e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002539  LSU ribosomal protein L19p  59.65 
 
 		 117 aa  130  9e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000131397  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3758  50S ribosomal protein L19  60.18 
 
 		 118 aa  129  1.0000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000121347  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3396  50S ribosomal protein L19  58.26 
 
 		 131 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.2335 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0765  50S ribosomal protein L19  63.81 
 
 		 114 aa  129  2.0000000000000002e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000038778  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0650  50S ribosomal protein L19  59.65 
 
 		 115 aa  128  2.0000000000000002e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0345381  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3398  50S ribosomal protein L19  56.64 
 
 		 116 aa  128  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.976851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1149  50S ribosomal protein L19  57.26 
 
 		 128 aa  129  2.0000000000000002e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000797714  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1422  ribosomal protein L19  56.78 
 
 		 130 aa  129  2.0000000000000002e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.420592  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3419  ribosomal protein L19  55.65 
 
 		 116 aa  128  3e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.30141  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3279  50S ribosomal protein L19  63.39 
 
 		 126 aa  128  3e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.305651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1962  50S ribosomal protein L19  59.29 
 
 		 115 aa  128  3e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0652  50S ribosomal protein L19  59.65 
 
 		 117 aa  128  3e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.520317  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0242  50S ribosomal protein L19  57.63 
 
 		 129 aa  127  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3488  50S ribosomal protein L19  57.52 
 
 		 118 aa  127  6e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5511499999999998e-20 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2016  50S ribosomal protein L19  60 
 
 		 130 aa  127  6e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00113436  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3426  50S ribosomal protein L19  57.52 
 
 		 118 aa  127  6e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.205181  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2319  50S ribosomal protein L19  60 
 
 		 142 aa  127  6e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.556938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2510  ribosomal protein L19  55.93 
 
 		 140 aa  127  6e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2107  50S ribosomal protein L19  57.66 
 
 		 148 aa  127  6e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00250382  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0349  50S ribosomal protein L19  57.63 
 
 		 131 aa  127  7.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.181621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0506  50S ribosomal protein L19  57.63 
 
 		 131 aa  127  7.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1630  ribosomal protein L19  57.89 
 
 		 113 aa  126  8.000000000000001e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3755  50S ribosomal protein L19  57.27 
 
 		 183 aa  127  8.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.649636  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0638  50S ribosomal protein L19  59.09 
 
 		 145 aa  126  8.000000000000001e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.056681 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1557  50S ribosomal protein L19  57.41 
 
 		 121 aa  126  9.000000000000001e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.940156  normal  0.0562207 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0892  50S ribosomal protein L19  58.77 
 
 		 117 aa  126  9.000000000000001e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00545492  normal  0.499418 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2257  50S ribosomal protein L19  58.41 
 
 		 115 aa  125  1.0000000000000001e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00054587  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0225  50S ribosomal protein L19  58.47 
 
 		 131 aa  125  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0069305 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4078  50S ribosomal protein L19  57.27 
 
 		 184 aa  125  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0561  50S ribosomal protein L19  54.55 
 
 		 118 aa  126  1.0000000000000001e-28  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.418065  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4170  50S ribosomal protein L19  59.29 
 
 		 113 aa  125  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4210  50S ribosomal protein L19  55.45 
 
 		 180 aa  125  2.0000000000000002e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.425838  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1022  50S ribosomal protein L19  56.64 
 
 		 116 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.132061  normal  0.522739 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2219  50S ribosomal protein L19  56.64 
 
 		 115 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.43443e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09790  LSU ribosomal protein L19P  56.14 
 
 		 119 aa  125  2.0000000000000002e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.54883  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3132  ribosomal protein L19  55.26 
 
 		 116 aa  125  2.0000000000000002e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000124659  normal  0.100655 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4003  ribosomal protein L19  55.75 
 
 		 118 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0680  50S ribosomal protein L19  52.21 
 
 		 118 aa  125  2.0000000000000002e-28  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0989  ribosomal protein L19  57.02 
 
 		 118 aa  125  2.0000000000000002e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000000485147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0802  50S ribosomal protein L19  53.04 
 
 		 162 aa  125  2.0000000000000002e-28  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0217  50S ribosomal protein L19  55.56 
 
 		 131 aa  125  2.0000000000000002e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.196922 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3255  50S ribosomal protein L19  53.91 
 
 		 116 aa  125  2.0000000000000002e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3364  50S ribosomal protein L19  55.26 
 
 		 119 aa  125  2.0000000000000002e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.734932  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0849  ribosomal protein L19  58.41 
 
 		 117 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1295  50S ribosomal protein L19  55.17 
 
 		 121 aa  125  2.0000000000000002e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.486389  normal  0.816145 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0364  50S ribosomal protein L19  59.09 
 
 		 127 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.152901  normal  0.548087 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1360  50S ribosomal protein L19  58.77 
 
 		 117 aa  124  3e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1835  50S ribosomal protein L19  53.33 
 
 		 145 aa  124  3e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.610841  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>