More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0455 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_0455  50S ribosomal protein L19  100 
 
 		 119 aa  236  1e-61  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1429  50S ribosomal protein L19  75.42 
 
 		 118 aa  191  3e-48  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0428647  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0680  50S ribosomal protein L19  72.03 
 
 		 118 aa  188  2.9999999999999997e-47  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1034  50S ribosomal protein L19  71.19 
 
 		 118 aa  186  1e-46  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0428583  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0561  50S ribosomal protein L19  71.19 
 
 		 118 aa  180  7e-45  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.418065  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1645  ribosomal protein L19  76.27 
 
 		 118 aa  171  2.9999999999999996e-42  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0814  50S ribosomal protein L19  72.03 
 
 		 118 aa  160  7e-39  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.12275  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0992  50S ribosomal protein L19  72.03 
 
 		 118 aa  160  8.000000000000001e-39  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.656221  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0737  50S ribosomal protein L19  71.19 
 
 		 118 aa  159  1e-38  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.400935  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1292  50S ribosomal protein L19  70.34 
 
 		 118 aa  157  5e-38  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0742  50S ribosomal protein L19  58.88 
 
 		 127 aa  126  8.000000000000001e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4426  50S ribosomal protein L19  58.04 
 
 		 131 aa  126  9.000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0668122  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1800  50S ribosomal protein L19  59.26 
 
 		 115 aa  124  4.0000000000000003e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0132543  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4734  50S ribosomal protein L19  55.36 
 
 		 134 aa  122  1e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5201  50S ribosomal protein L19  55.36 
 
 		 134 aa  122  1e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.952267 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1366  ribosomal protein L19  57.84 
 
 		 114 aa  122  2e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0190  50S ribosomal protein L19  57.43 
 
 		 133 aa  122  2e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2899  50S ribosomal protein L19  55.86 
 
 		 132 aa  122  2e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5273  50S ribosomal protein L19  54.46 
 
 		 130 aa  122  2e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.987122 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0648  50S ribosomal protein L19  57.58 
 
 		 118 aa  121  3e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2219  50S ribosomal protein L19  55.36 
 
 		 115 aa  121  3e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.43443e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2719  50S ribosomal protein L19  53.7 
 
 		 125 aa  121  4e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.877086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2107  50S ribosomal protein L19  55.26 
 
 		 148 aa  120  5e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00250382  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3396  50S ribosomal protein L19  54.46 
 
 		 131 aa  120  5e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.2335 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0638  50S ribosomal protein L19  57.84 
 
 		 145 aa  120  5e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.056681 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0956  50S ribosomal protein L19  54.46 
 
 		 132 aa  120  6e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.456923  normal  0.670119 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2866  50S ribosomal protein L19  59.6 
 
 		 118 aa  120  7e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000321036  hitchhiker  0.000000487764 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0544  50S ribosomal protein L19  52.59 
 
 		 115 aa  120  8e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0000438423  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1022  50S ribosomal protein L19  54.78 
 
 		 116 aa  120  8e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.132061  normal  0.522739 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2663  50S ribosomal protein L19  51.72 
 
 		 129 aa  120  9e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1465  50S ribosomal protein L19  53.91 
 
 		 116 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0559636  normal  0.290226 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1476  ribosomal protein L19  54.78 
 
 		 116 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0735287  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1285  50S ribosomal protein L19  54.78 
 
 		 116 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4256  50S ribosomal protein L19  53.91 
 
 		 116 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1808  50S ribosomal protein L19  58.18 
 
 		 162 aa  119  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0350868  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05311  50S ribosomal protein L19  58.18 
 
 		 162 aa  119  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.105613 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1070  50S ribosomal protein L19  53.91 
 
 		 116 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.199934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0341  50S ribosomal protein L19  53.1 
 
 		 124 aa  119  9.999999999999999e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.164171  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3488  50S ribosomal protein L19  54.55 
 
 		 118 aa  119  9.999999999999999e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5511499999999998e-20 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1093  ribosomal protein L19  50.85 
 
 		 116 aa  119  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000484447  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3426  50S ribosomal protein L19  54.55 
 
 		 118 aa  119  9.999999999999999e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.205181  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1835  50S ribosomal protein L19  56.57 
 
 		 145 aa  118  1.9999999999999998e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.610841  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1907  50S ribosomal protein L19  56.57 
 
 		 145 aa  118  1.9999999999999998e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.371938  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0463  50S ribosomal protein L19  55.45 
 
 		 121 aa  119  1.9999999999999998e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0439  50S ribosomal protein L19  55.45 
 
 		 121 aa  119  1.9999999999999998e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0666  50S ribosomal protein L19  53.57 
 
 		 114 aa  118  1.9999999999999998e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3398  50S ribosomal protein L19  53.91 
 
 		 116 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.976851  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4154  50S ribosomal protein L19  53.04 
 
 		 116 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.237739  normal  0.417935 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1986  ribosomal protein L19  57.14 
 
 		 118 aa  118  3e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0807  50S ribosomal protein L19  53.04 
 
 		 116 aa  117  3.9999999999999996e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  unclonable  0.000000000000011018  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0971  50S ribosomal protein L19  53.57 
 
 		 113 aa  117  3.9999999999999996e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000149666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1221  50S ribosomal protein L19  57.14 
 
 		 115 aa  117  3.9999999999999996e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000033527  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1234  50S ribosomal protein L19  57.14 
 
 		 115 aa  117  3.9999999999999996e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000814658  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39530  50S ribosomal protein L19  53.91 
 
 		 116 aa  117  4.9999999999999996e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0334012  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1031  ribosomal protein L19  53.85 
 
 		 124 aa  117  4.9999999999999996e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.980143  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3445  50S ribosomal protein L19  51.85 
 
 		 166 aa  117  4.9999999999999996e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.549139  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0946  50S ribosomal protein L19  55.56 
 
 		 145 aa  117  4.9999999999999996e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1422  ribosomal protein L19  52.63 
 
 		 130 aa  117  6e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.420592  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2852  ribosomal protein L19  56.48 
 
 		 114 aa  117  6e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.151423  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3758  50S ribosomal protein L19  55.56 
 
 		 118 aa  117  6e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000121347  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1144  50S ribosomal protein L19  50.86 
 
 		 115 aa  117  6e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000366814  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2473  ribosomal protein L19  56.48 
 
 		 114 aa  117  6e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1149  50S ribosomal protein L19  53.45 
 
 		 128 aa  117  7e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000797714  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1413  ribosomal protein L19  55.56 
 
 		 119 aa  117  7e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000153602  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0849  ribosomal protein L19  53.98 
 
 		 117 aa  117  7.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1300  50S ribosomal protein L19  52.17 
 
 		 116 aa  116  7.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000348159  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1377  50S ribosomal protein L19  53.91 
 
 		 116 aa  116  7.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.134338  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1325  50S ribosomal protein L19  52.17 
 
 		 116 aa  116  7.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000150512  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16000  50S ribosomal protein L19  53.91 
 
 		 116 aa  116  7.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000973438  normal  0.502722 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0945  50S ribosomal protein L19  53.98 
 
 		 114 aa  116  7.999999999999999e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000423852  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0549  50S ribosomal protein L19  53.1 
 
 		 115 aa  116  9e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  8.959370000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1632  50S ribosomal protein L19  53.1 
 
 		 115 aa  116  9e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000000160789  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3755  50S ribosomal protein L19  55.56 
 
 		 183 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.649636  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2455  50S ribosomal protein L19  56.57 
 
 		 119 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0707667  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4078  50S ribosomal protein L19  56.57 
 
 		 184 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0225  50S ribosomal protein L19  54.13 
 
 		 131 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0069305 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3101  50S ribosomal protein L19  51.35 
 
 		 177 aa  115  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.255374  normal  0.735203 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0972  50S ribosomal protein L19  50.94 
 
 		 128 aa  115  1.9999999999999998e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000207565  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2492  50S ribosomal protein L19  51.3 
 
 		 114 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000053876  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0217  50S ribosomal protein L19  55.56 
 
 		 131 aa  114  3e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.196922 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0395  50S ribosomal protein L19  53.64 
 
 		 114 aa  115  3e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0364  50S ribosomal protein L19  53.51 
 
 		 127 aa  115  3e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.152901  normal  0.548087 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0661  50S ribosomal protein L19  50.45 
 
 		 115 aa  114  3e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00126623  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0242  50S ribosomal protein L19  51.75 
 
 		 129 aa  114  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0087  50S ribosomal protein L19  55.45 
 
 		 146 aa  114  3.9999999999999997e-25  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0349  50S ribosomal protein L19  51.75 
 
 		 131 aa  114  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.181621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0506  50S ribosomal protein L19  51.75 
 
 		 131 aa  114  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0120  50S ribosomal protein L19  56.73 
 
 		 124 aa  114  5e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.332554 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2510  ribosomal protein L19  55.67 
 
 		 140 aa  114  5e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5090  50S ribosomal protein L19  56.57 
 
 		 120 aa  114  6e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.0000000000000290678  normal  0.249753 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3582  50S ribosomal protein L19  53.21 
 
 		 126 aa  114  6.9999999999999995e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.514496  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1201  50S ribosomal protein L19  52.63 
 
 		 115 aa  113  7.999999999999999e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000297862  normal  0.163388 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0475  50S ribosomal protein L19  54.55 
 
 		 156 aa  113  8.999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4210  50S ribosomal protein L19  52.53 
 
 		 180 aa  113  8.999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.425838  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3882  50S ribosomal protein L19  55 
 
 		 114 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000143455  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2376  50S ribosomal protein L19  52.68 
 
 		 126 aa  112  1.0000000000000001e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.488088 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2783  50S ribosomal protein L19  53.21 
 
 		 126 aa  112  1.0000000000000001e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.101505  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3853  50S ribosomal protein L19  55 
 
 		 114 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.655990000000001e-63 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3978  50S ribosomal protein L19  55 
 
 		 114 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000147607  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3938  50S ribosomal protein L19  55 
 
 		 114 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000138289  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>