More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJJ81176_0737 on replicon NC_008787
Organism: Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008787  CJJ81176_0737  50S ribosomal protein L19  100 
 
 
118 aa  234  3e-61  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.400935  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0814  50S ribosomal protein L19  99.15 
 
 
118 aa  232  1.0000000000000001e-60  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.12275  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1292  50S ribosomal protein L19  99.15 
 
 
118 aa  232  1.0000000000000001e-60  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1034  50S ribosomal protein L19  84.75 
 
 
118 aa  206  9e-53  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0428583  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0561  50S ribosomal protein L19  83.05 
 
 
118 aa  199  9.999999999999999e-51  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.418065  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0992  50S ribosomal protein L19  95.76 
 
 
118 aa  199  9.999999999999999e-51  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.656221  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0680  50S ribosomal protein L19  77.12 
 
 
118 aa  192  1e-48  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1429  50S ribosomal protein L19  76.27 
 
 
118 aa  189  1e-47  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0428647  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0455  50S ribosomal protein L19  71.19 
 
 
119 aa  183  7e-46  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1645  ribosomal protein L19  74.58 
 
 
118 aa  172  1.9999999999999998e-42  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0742  50S ribosomal protein L19  56.64 
 
 
127 aa  136  8.999999999999999e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4426  50S ribosomal protein L19  58.04 
 
 
131 aa  135  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0668122  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3445  50S ribosomal protein L19  54.39 
 
 
166 aa  132  1.9999999999999998e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.549139  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0648  50S ribosomal protein L19  54.46 
 
 
118 aa  131  3e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2899  50S ribosomal protein L19  57.66 
 
 
132 aa  131  3e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0956  50S ribosomal protein L19  55.36 
 
 
132 aa  131  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.456923  normal  0.670119 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4210  50S ribosomal protein L19  55.26 
 
 
180 aa  130  6e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.425838  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0341  50S ribosomal protein L19  53.98 
 
 
124 aa  130  7.999999999999999e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.164171  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0638  50S ribosomal protein L19  53.51 
 
 
145 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.056681 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5273  50S ribosomal protein L19  55.36 
 
 
130 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.987122 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2663  50S ribosomal protein L19  54.39 
 
 
129 aa  129  1.0000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2719  50S ribosomal protein L19  55.36 
 
 
125 aa  129  1.0000000000000001e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.877086  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2107  50S ribosomal protein L19  54.39 
 
 
148 aa  129  1.0000000000000001e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00250382  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5201  50S ribosomal protein L19  54.46 
 
 
134 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.952267 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4734  50S ribosomal protein L19  54.46 
 
 
134 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4078  50S ribosomal protein L19  55.26 
 
 
184 aa  128  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3396  50S ribosomal protein L19  54.46 
 
 
131 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.2335 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3755  50S ribosomal protein L19  54.39 
 
 
183 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.649636  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2866  50S ribosomal protein L19  54.46 
 
 
118 aa  128  3e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000321036  hitchhiker  0.000000487764 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3101  50S ribosomal protein L19  54.39 
 
 
177 aa  127  5.0000000000000004e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.255374  normal  0.735203 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3488  50S ribosomal protein L19  54.46 
 
 
118 aa  126  9.000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5511499999999998e-20 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3426  50S ribosomal protein L19  54.46 
 
 
118 aa  126  9.000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.205181  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0217  50S ribosomal protein L19  55.75 
 
 
131 aa  125  2.0000000000000002e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.196922 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1422  ribosomal protein L19  52.14 
 
 
130 aa  124  3e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.420592  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2510  ribosomal protein L19  50.88 
 
 
140 aa  125  3e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0807  50S ribosomal protein L19  53.91 
 
 
116 aa  124  6e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  unclonable  0.000000000000011018  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1325  50S ribosomal protein L19  55.65 
 
 
116 aa  124  6e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000150512  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1300  50S ribosomal protein L19  55.65 
 
 
116 aa  124  6e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000348159  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0666  50S ribosomal protein L19  55.45 
 
 
114 aa  123  9e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1413  ribosomal protein L19  53.04 
 
 
119 aa  122  1e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000153602  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1149  50S ribosomal protein L19  54.39 
 
 
128 aa  123  1e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000797714  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1907  50S ribosomal protein L19  51.72 
 
 
145 aa  122  2e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.371938  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0463  50S ribosomal protein L19  52.73 
 
 
121 aa  122  2e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0439  50S ribosomal protein L19  52.73 
 
 
121 aa  122  2e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1031  ribosomal protein L19  53.91 
 
 
124 aa  122  2e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.980143  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1835  50S ribosomal protein L19  51.72 
 
 
145 aa  122  2e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.610841  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2150  50S ribosomal protein L19  51.28 
 
 
124 aa  122  2e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.109584  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1022  50S ribosomal protein L19  53.04 
 
 
116 aa  121  3e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.132061  normal  0.522739 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1465  50S ribosomal protein L19  51.3 
 
 
116 aa  120  4e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0559636  normal  0.290226 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1024  50S ribosomal protein L19  53.15 
 
 
121 aa  121  4e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.688153  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2050  50S ribosomal protein L19  55.86 
 
 
115 aa  120  4e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000005578  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4256  50S ribosomal protein L19  51.3 
 
 
116 aa  120  4e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1070  50S ribosomal protein L19  51.3 
 
 
116 aa  120  4e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.199934  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3758  50S ribosomal protein L19  53.57 
 
 
118 aa  121  4e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000121347  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4154  50S ribosomal protein L19  51.3 
 
 
116 aa  121  4e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.237739  normal  0.417935 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1093  ribosomal protein L19  50 
 
 
116 aa  121  4e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000484447  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1476  ribosomal protein L19  53.04 
 
 
116 aa  120  5e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0735287  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1285  50S ribosomal protein L19  53.04 
 
 
116 aa  120  5e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.329  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1632  50S ribosomal protein L19  51.33 
 
 
115 aa  120  5e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000000160789  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0549  50S ribosomal protein L19  51.33 
 
 
115 aa  120  5e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  8.959370000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0971  50S ribosomal protein L19  54.55 
 
 
113 aa  120  5e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000149666  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0946  50S ribosomal protein L19  50.86 
 
 
145 aa  120  5e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2492  50S ribosomal protein L19  58 
 
 
114 aa  120  6e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000053876  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0348  ribosomal protein L19  53.15 
 
 
121 aa  120  7e-27  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1800  50S ribosomal protein L19  58.59 
 
 
115 aa  120  8e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0132543  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39530  50S ribosomal protein L19  52.17 
 
 
116 aa  119  9.999999999999999e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0334012  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0739  ribosomal protein L19  55.56 
 
 
141 aa  119  9.999999999999999e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000570973 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0661  50S ribosomal protein L19  53.1 
 
 
115 aa  119  9.999999999999999e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00126623  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5090  50S ribosomal protein L19  58.59 
 
 
120 aa  119  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.0000000000000290678  normal  0.249753 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1986  ribosomal protein L19  50.44 
 
 
118 aa  119  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0087  50S ribosomal protein L19  50.88 
 
 
146 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2257  50S ribosomal protein L19  51.3 
 
 
115 aa  119  1.9999999999999998e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00054587  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1377  50S ribosomal protein L19  52.17 
 
 
116 aa  118  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.134338  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16000  50S ribosomal protein L19  52.17 
 
 
116 aa  118  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000973438  normal  0.502722 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3398  50S ribosomal protein L19  51.3 
 
 
116 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.976851  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1557  50S ribosomal protein L19  56.12 
 
 
121 aa  119  1.9999999999999998e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.940156  normal  0.0562207 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3419  ribosomal protein L19  59.18 
 
 
116 aa  118  3e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.30141  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3882  50S ribosomal protein L19  51.3 
 
 
114 aa  118  3e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000143455  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3938  50S ribosomal protein L19  51.3 
 
 
114 aa  118  3e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000138289  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3691  50S ribosomal protein L19  51.3 
 
 
114 aa  118  3e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000105797  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3581  50S ribosomal protein L19  51.3 
 
 
114 aa  118  3e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.43871e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3599  50S ribosomal protein L19  51.3 
 
 
114 aa  118  3e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000284782  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2219  50S ribosomal protein L19  50.91 
 
 
115 aa  118  3e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.43443e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3887  50S ribosomal protein L19  51.3 
 
 
114 aa  118  3e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000863076  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3978  50S ribosomal protein L19  51.3 
 
 
114 aa  118  3e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000147607  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1221  50S ribosomal protein L19  57.29 
 
 
115 aa  118  3e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000033527  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0364  50S ribosomal protein L19  50 
 
 
127 aa  118  3e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.152901  normal  0.548087 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1305  50S ribosomal protein L19  51.3 
 
 
114 aa  118  3e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000891936  unclonable  6.6564e-26 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1234  50S ribosomal protein L19  57.29 
 
 
115 aa  118  3e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000814658  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3853  50S ribosomal protein L19  51.3 
 
 
114 aa  118  3e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.655990000000001e-63 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3663  50S ribosomal protein L19  56 
 
 
114 aa  118  3.9999999999999996e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000597471  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0225  50S ribosomal protein L19  50.89 
 
 
131 aa  117  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0069305 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0972  50S ribosomal protein L19  54 
 
 
128 aa  118  3.9999999999999996e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000207565  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2536  ribosomal protein L19  58.16 
 
 
118 aa  117  3.9999999999999996e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.123548  normal  0.284207 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3884  50S ribosomal protein L19  55.75 
 
 
126 aa  117  3.9999999999999996e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0241892  normal  0.932135 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0765  50S ribosomal protein L19  51.38 
 
 
114 aa  117  3.9999999999999996e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000038778  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2455  50S ribosomal protein L19  50.89 
 
 
119 aa  117  4.9999999999999996e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0707667  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1188  50S ribosomal protein L19  50 
 
 
163 aa  117  6e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.186255  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0349  50S ribosomal protein L19  50 
 
 
131 aa  117  6e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.181621  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0506  50S ribosomal protein L19  50 
 
 
131 aa  117  6e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>