27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4704 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4704  hypothetical protein  100 
 
 
122 aa  249  1e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1960  hypothetical protein  62.28 
 
 
120 aa  149  2e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6095  hypothetical protein  57.38 
 
 
129 aa  147  3e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1109  hypothetical protein  61.4 
 
 
126 aa  140  6e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.464875  normal  0.713161 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3522  hypothetical protein  58.62 
 
 
124 aa  140  8e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1426  hypothetical protein  54.46 
 
 
142 aa  134  4e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.515265  normal  0.103099 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1049  hypothetical protein  53.98 
 
 
120 aa  130  6e-30  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5353  hypothetical protein  52.46 
 
 
122 aa  128  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2780  hypothetical protein  54.13 
 
 
113 aa  124  6e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1020  hypothetical protein  50.88 
 
 
120 aa  123  1e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1235  hypothetical protein  50 
 
 
120 aa  122  2e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.78083  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0462  hypothetical protein  49.54 
 
 
139 aa  117  4.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.110741 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1532  hypothetical protein  52.34 
 
 
113 aa  113  8.999999999999998e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4173  hypothetical protein  42.28 
 
 
128 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00000992156  hitchhiker  0.000000307929 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0591  hypothetical protein  46.53 
 
 
129 aa  106  1e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5314  hypothetical protein  44.55 
 
 
128 aa  99  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0514922 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1217  hypothetical protein  37.93 
 
 
124 aa  90.1  8e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.510827  normal  0.279745 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1789  hypothetical protein  36.21 
 
 
129 aa  73.2  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0197071  hitchhiker  0.00126206 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2321  hypothetical protein  35.78 
 
 
111 aa  69.7  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26260  hypothetical protein  33.64 
 
 
118 aa  68.2  0.00000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.95274  normal  0.0471393 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1025  hypothetical protein  30.28 
 
 
114 aa  61.6  0.000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1701  hypothetical protein  34.02 
 
 
120 aa  56.6  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3121  hypothetical protein  36.51 
 
 
206 aa  49.3  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.144848  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2338  hypothetical protein  33.33 
 
 
109 aa  48.5  0.00003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09788  hypothetical protein  30.2 
 
 
151 aa  44.7  0.0004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.130728  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2284  hypothetical protein  31.88 
 
 
131 aa  43.5  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1973  hypothetical protein  33.33 
 
 
190 aa  40.8  0.006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.046319  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>