189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4456 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4456  PhnA protein-like protein  100 
 
 
192 aa  390  1e-108  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0017  PhnA protein  54.3 
 
 
190 aa  206  2e-52  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2128  PhnA protein  54.21 
 
 
191 aa  203  1e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.900407  normal  0.250576 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2615  PhnA protein-like protein  53.12 
 
 
192 aa  201  5e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04990  hypothetical protein  48.96 
 
 
192 aa  188  4e-47  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2295  PhnA protein-like protein  47.15 
 
 
195 aa  175  3e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1109  PhnA protein  47.92 
 
 
189 aa  172  3.9999999999999995e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1349  putative PhnA protein  46.77 
 
 
192 aa  162  3e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0534452  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1574  putative phosphonoacetate hydrolase PhnA  44.85 
 
 
189 aa  160  8.000000000000001e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.60114  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0107  putative phnA protein  50 
 
 
189 aa  159  2e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1443  PhnA protein  45.16 
 
 
192 aa  157  1e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1309  PhnA protein-like  47.37 
 
 
187 aa  152  2e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.569365  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1421  PhnA protein  47.15 
 
 
187 aa  150  7e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1398  PhnA protein  47.15 
 
 
187 aa  150  7e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1382  PhnA protein  46.84 
 
 
187 aa  150  1e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2956  PhnA protein  46.56 
 
 
187 aa  149  2e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.235  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1581  phnA protein  46.56 
 
 
187 aa  147  9e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2692  PhnA protein  46.56 
 
 
187 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00739311 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2760  PhnA protein  46.56 
 
 
187 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2861  PhnA protein  46.56 
 
 
187 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.118569 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000186  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  41.97 
 
 
185 aa  144  6e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000051475  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05820  hypothetical protein  41.97 
 
 
185 aa  144  7.0000000000000006e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0481  phnA protein  41.97 
 
 
191 aa  136  2e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000775848  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0019  PhnA protein  40.1 
 
 
184 aa  133  1.9999999999999998e-30  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1091  PhnA protein  43.24 
 
 
188 aa  131  6.999999999999999e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.393322 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5171  PhnA protein  39.25 
 
 
187 aa  127  8.000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.310533  hitchhiker  0.00969198 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0626  PhnA protein  37.06 
 
 
188 aa  124  7e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0555496  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0097  hypothetical protein  48.42 
 
 
113 aa  79.7  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0998  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA, putative  40.48 
 
 
124 aa  79.3  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.29749  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1749  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  46.81 
 
 
112 aa  79.3  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.717201  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2068  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  45.71 
 
 
113 aa  77.8  0.00000000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.818906  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0863  PhnA protein  43.7 
 
 
124 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.563096  normal  0.644817 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0801  PhnA protein  48.94 
 
 
113 aa  77.4  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0582  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  47.12 
 
 
112 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2936  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  50.57 
 
 
111 aa  77  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.187672  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01761  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  59.42 
 
 
111 aa  76.6  0.0000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.372611  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2239  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  43.27 
 
 
112 aa  77  0.0000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2498  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  61.19 
 
 
113 aa  75.9  0.0000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00301412  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2595  phnA family protein  45.19 
 
 
112 aa  75.9  0.0000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01560  hypothetical protein  48.42 
 
 
113 aa  75.5  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.325627  normal  0.659368 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0204  hypothetical protein  48.42 
 
 
113 aa  75.5  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.360776  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2917  phnA family protein  45.19 
 
 
112 aa  75.1  0.0000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0686  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  54.12 
 
 
113 aa  75.1  0.0000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.331269  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0718  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  54.12 
 
 
112 aa  74.3  0.0000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1478  PhnA protein  44.23 
 
 
112 aa  73.9  0.000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0958  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  59.7 
 
 
112 aa  74.3  0.000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0565299  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1102  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  59.7 
 
 
112 aa  74.3  0.000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4848  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  47.06 
 
 
130 aa  73.9  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.19815  normal  0.421642 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0717  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  54.12 
 
 
113 aa  73.9  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0125807 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2184  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  61.19 
 
 
112 aa  73.2  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18100  PhnA protein  49.41 
 
 
114 aa  73.6  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4499  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  59.7 
 
 
113 aa  72.4  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.902658 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4761  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  48.24 
 
 
113 aa  72.8  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1081  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  44.23 
 
 
113 aa  72.8  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.406917 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1254  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  61.19 
 
 
79 aa  72  0.000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0192046  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1339  alkylphosphonate uptake protein  41.9 
 
 
114 aa  72  0.000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.319385 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0710  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  44.12 
 
 
115 aa  72  0.000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2938  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  46.88 
 
 
113 aa  71.2  0.000000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3438  hypothetical protein  46.32 
 
 
113 aa  70.9  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.67162  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5080  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  48.24 
 
 
113 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4812  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  48.24 
 
 
120 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.207826  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4654  alkylphosphonate utilization operon protein  48.24 
 
 
120 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4674  alkylphosphonate utilization operon protein  48.24 
 
 
120 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5177  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  48.24 
 
 
113 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5082  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  48.24 
 
 
113 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5051  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  48.24 
 
 
113 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5621  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  48.94 
 
 
137 aa  70.9  0.00000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.914109 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5085  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  48.24 
 
 
113 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4573  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  48.94 
 
 
137 aa  70.9  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1219  hypothetical protein  51.76 
 
 
111 aa  70.9  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00756508  normal  0.430256 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03979  hypothetical protein  44.23 
 
 
111 aa  70.1  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3884  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  44.23 
 
 
111 aa  70.1  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1381  PHNA protein alkylphosphonate uptake  54.41 
 
 
113 aa  69.7  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4635  hypothetical protein  45.19 
 
 
111 aa  70.1  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4662  hypothetical protein  44.23 
 
 
111 aa  70.1  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0570  PhnA protein  41.35 
 
 
112 aa  70.1  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.595887  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4862  PhnA protein  56.72 
 
 
113 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4348  hypothetical protein  44.23 
 
 
111 aa  70.1  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4936  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  38.83 
 
 
113 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0950023  normal  0.423894 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4635  hypothetical protein  45.19 
 
 
111 aa  70.1  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.945579 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0160  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  48.24 
 
 
113 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6554  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  43.53 
 
 
118 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3919  hypothetical protein  44.23 
 
 
111 aa  70.1  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4551  hypothetical protein  45.19 
 
 
111 aa  70.1  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1698  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  45.88 
 
 
112 aa  69.7  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000832125  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4609  hypothetical protein  44.23 
 
 
111 aa  70.1  0.00000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4684  hypothetical protein  45.19 
 
 
111 aa  70.1  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.550863  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4544  hypothetical protein  45.19 
 
 
111 aa  70.1  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03940  hypothetical protein  44.23 
 
 
111 aa  70.1  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3549  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  55.22 
 
 
110 aa  69.3  0.00000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0516  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  45.74 
 
 
113 aa  69.7  0.00000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0919  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  58.21 
 
 
112 aa  69.7  0.00000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7062  PhnA protein  43.53 
 
 
118 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.225206  normal  0.21502 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6268  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  43.53 
 
 
114 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.940336  normal  0.486413 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6473  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  45.83 
 
 
113 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.44165  normal  0.219152 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0311  hypothetical protein  45.19 
 
 
111 aa  68.9  0.00000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0235836 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0411  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  44.68 
 
 
112 aa  68.9  0.00000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0089  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  41.49 
 
 
112 aa  68.9  0.00000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5247  alkylphosphonate uptake protein  43.14 
 
 
131 aa  68.6  0.00000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3129  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  56.72 
 
 
113 aa  68.6  0.00000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>