88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_2952 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_2952  hypothetical protein  100 
 
 
253 aa  514  1.0000000000000001e-145  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.588576  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1611  hypothetical protein  49.21 
 
 
256 aa  233  3e-60  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.575841  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09808  hypothetical protein  40.41 
 
 
257 aa  193  2e-48  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3216  oxidoreductase domain protein  40.4 
 
 
252 aa  186  4e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0684452 
 
 
-
 
NC_002950  PG0659  hypothetical protein  39.68 
 
 
270 aa  181  8.000000000000001e-45  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.599675 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6619  hypothetical protein  38.58 
 
 
266 aa  170  2e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3502  NAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase domain protein  38.02 
 
 
267 aa  163  2.0000000000000002e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.458858  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3313  hypothetical protein  37.79 
 
 
259 aa  153  2e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1956  NAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase domain protein  36.65 
 
 
254 aa  150  3e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.717066  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1101  hypothetical protein  23.77 
 
 
292 aa  83.2  0.000000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0725  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  26.42 
 
 
285 aa  82.4  0.000000000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000163067  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3158  hypothetical protein  23.77 
 
 
292 aa  81.6  0.000000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0159  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  26.05 
 
 
343 aa  78.6  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.981834  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1787  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  24.8 
 
 
328 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1267  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  25.38 
 
 
291 aa  76.6  0.0000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2608  hypothetical protein  25.19 
 
 
299 aa  76.6  0.0000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3227  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  29.44 
 
 
293 aa  74.3  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1853  hypothetical protein  25.77 
 
 
294 aa  73.6  0.000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0336  hypothetical cytosolic protein  25.77 
 
 
294 aa  73.2  0.000000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0298  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  24.09 
 
 
306 aa  72.8  0.000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0099  oxidoreductase domain-containing protein  23.66 
 
 
297 aa  72.4  0.000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_705  pyrroline-5-carboxylate reductase  24.69 
 
 
290 aa  71.2  0.00000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000337402  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0239  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  26.79 
 
 
290 aa  71.2  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.223383  normal  0.808086 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3715  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  29.57 
 
 
288 aa  71.6  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0058603 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1788  hypothetical protein  29.81 
 
 
281 aa  71.6  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.21472  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0801  pyrroline-5-carboxylate reductase, putative  24.8 
 
 
285 aa  69.3  0.00000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000364861  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1455  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  23.88 
 
 
285 aa  65.9  0.0000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.657681  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4572  hypothetical protein  25.83 
 
 
290 aa  65.9  0.0000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.775043 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3016  hypothetical protein  25.36 
 
 
297 aa  65.5  0.0000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.77776 
 
 
-
 
NC_003296  RS01781  hypothetical protein  24.88 
 
 
294 aa  65.1  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4488  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  24.49 
 
 
303 aa  64.7  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2448  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  23.75 
 
 
309 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1550  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  23.38 
 
 
285 aa  64.3  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1317  hypothetical protein  22.69 
 
 
295 aa  63.9  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2173  hypothetical protein  23.36 
 
 
281 aa  63.9  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0680513  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0367  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  24.18 
 
 
289 aa  63.9  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.288045  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1883  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  25.77 
 
 
296 aa  62.8  0.000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0100  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  25.95 
 
 
298 aa  62  0.000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.982227  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1982  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  27.55 
 
 
282 aa  61.2  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0819  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  23.37 
 
 
309 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.876561 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0808  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  21.84 
 
 
309 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.7461  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2907  hypothetical protein  25.1 
 
 
284 aa  57.8  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0911  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  22.14 
 
 
309 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1098  hypothetical protein  25.56 
 
 
264 aa  57.8  0.0000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000199077  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0140  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  22.97 
 
 
307 aa  57.8  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.14549  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0631  Domain of unknown function DUF2520  24.62 
 
 
319 aa  57.8  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2408  hypothetical protein  22.82 
 
 
284 aa  57.8  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0684106  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1022  hypothetical protein  25.56 
 
 
264 aa  57.8  0.0000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000881326  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2097  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  24.82 
 
 
327 aa  57  0.0000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4050  hypothetical protein  23.66 
 
 
309 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3050  hypothetical protein  24.41 
 
 
284 aa  55.8  0.0000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3475  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  23.5 
 
 
293 aa  54.7  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.128821  normal  0.109237 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4547  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  23.5 
 
 
293 aa  54.7  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1878  hypothetical protein  24.42 
 
 
289 aa  53.5  0.000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0949  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  21.46 
 
 
309 aa  53.1  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.522704  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0470  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  21.46 
 
 
309 aa  53.1  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0574  hypothetical protein  24.37 
 
 
260 aa  53.1  0.000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0428  oxidoreductase domain-containing protein  26.73 
 
 
296 aa  52.4  0.000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0459  hypothetical protein  27.01 
 
 
272 aa  51.6  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8384  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  24.76 
 
 
295 aa  52  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.841409  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3719  hypothetical protein  20.57 
 
 
315 aa  50.4  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.562569 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5365  NAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase-like protein  23.51 
 
 
315 aa  49.7  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.937795  hitchhiker  0.00190793 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1643  hypothetical protein  23.11 
 
 
256 aa  48.9  0.00008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.639478  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0634  Putative oxidoreductase/dehydrogenase, Rossmann- like domain protein  22.84 
 
 
344 aa  48.5  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.165538  normal  0.317687 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1523  hypothetical protein  24.44 
 
 
332 aa  48.1  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0111992  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4763  NAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase-like protein  23.18 
 
 
313 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4849  NAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase domain-containing protein  23.18 
 
 
313 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.300668  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5149  NAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase domain-containing protein  23.18 
 
 
313 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0752  hypothetical protein  28 
 
 
378 aa  46.6  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2885  hypothetical protein  21.96 
 
 
296 aa  47.4  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2586  hypothetical protein  28 
 
 
378 aa  46.6  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.328461  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3082  putative NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  28 
 
 
378 aa  46.6  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3027  putative NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  28 
 
 
378 aa  47  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.764976  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2027  putative NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  28 
 
 
378 aa  46.6  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2157  hypothetical protein  28 
 
 
378 aa  46.6  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.32562  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0210  hypothetical protein  21.69 
 
 
312 aa  46.6  0.0004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.163931 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12870  hypothetical protein  22.31 
 
 
301 aa  46.2  0.0005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.0057272  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9161  putative cytoplasmic protein  23.12 
 
 
296 aa  46.2  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0154  NAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase domain protein  23.35 
 
 
292 aa  45.4  0.0008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000106629  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3372  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  21.57 
 
 
271 aa  45.1  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.403288  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0322  hypothetical protein  24.29 
 
 
297 aa  45.4  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0091  putative cytoplasmic protein  23.32 
 
 
308 aa  44.3  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6076  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  27.11 
 
 
317 aa  43.5  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.143744 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4284  hypothetical protein  25.37 
 
 
314 aa  43.9  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.396799 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0716  pantoate/beta-alanine ligase  24.65 
 
 
618 aa  43.5  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.34765 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0556  hypothetical protein  21.3 
 
 
358 aa  43.1  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3427  putative cytoplasmic protein  22.4 
 
 
296 aa  43.1  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3364  oxidoreductase domain protein  30.43 
 
 
366 aa  42  0.01  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.310163  normal  0.0342924 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>