28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_2126 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_2126  KAP P-loop domain-containing protein  100 
 
 
945 aa  1848    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1014  P-loop ATPase  30.58 
 
 
315 aa  94  1e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.287262  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1051  KAP P-loop domain-containing protein  28.21 
 
 
672 aa  87  0.000000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0090  hypothetical protein  25.99 
 
 
706 aa  85.5  0.000000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0396414  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0010  KAP P-loop domain-containing protein  27.43 
 
 
728 aa  79.3  0.0000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00154725 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4676  hypothetical protein  31.47 
 
 
736 aa  75.9  0.000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1598  KAP P-loop domain protein  23.64 
 
 
749 aa  73.6  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0229  KAP P-loop domain-containing protein  25.11 
 
 
735 aa  69.7  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.471102  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2922  P-loop ATPase-like protein  23.68 
 
 
715 aa  66.2  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.182539 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5211  KAP P-loop domain-containing protein  22.69 
 
 
419 aa  65.1  0.000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2072  KAP P-loop  21.33 
 
 
997 aa  62.4  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.285295 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0025  KAP family P-loop domain protein  28.19 
 
 
884 aa  61.2  0.00000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.046413 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1639  KAP P-loop domain-containing protein  25.66 
 
 
862 aa  60.8  0.0000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.552489  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4923  hypothetical protein  26.02 
 
 
976 aa  57.8  0.0000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.668191  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3890  KAP P-loop domain protein  21.68 
 
 
706 aa  57.4  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.329172  normal  0.0371093 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0675  KAP P-loop domain-containing protein  21.36 
 
 
513 aa  55.1  0.000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28360  KAP family P-loop domain protein  25.85 
 
 
564 aa  53.5  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.143031 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0561  hypothetical protein  29.29 
 
 
577 aa  52.8  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4815  KAP P-loop domain-containing protein  19.79 
 
 
623 aa  52.8  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.678803  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0128  KAP P-loop domain protein  23.73 
 
 
471 aa  52  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0689933  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3386  hypothetical protein  18.5 
 
 
784 aa  50.1  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.256029  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1445  KAP P-loop domain protein  20.16 
 
 
461 aa  49.7  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.48405  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0472  hypothetical protein  22.58 
 
 
510 aa  47  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3357  KAP P-loop domain-containing protein  22.22 
 
 
463 aa  47  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2930  KAP P-loop domain-containing protein  22.22 
 
 
463 aa  47  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.275131 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1063  KAP P-loop domain-containing protein  18.59 
 
 
467 aa  45.8  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0661  ATPase  22.83 
 
 
615 aa  44.7  0.007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.204839  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0936  KAP P-loop domain protein  17.2 
 
 
647 aa  44.7  0.009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>