48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1464 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_12263  hypothetical protein  49.71 
 
 
853 aa  824    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.167756  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0452  surface antigen (D15)  41.24 
 
 
858 aa  649    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.150297  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1464  surface antigen (D15)  100 
 
 
851 aa  1721    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1223  outer membrane protein  25.69 
 
 
766 aa  254  4.0000000000000004e-66  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.760862  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0980  hypothetical protein  27.22 
 
 
745 aa  244  3.9999999999999997e-63  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3472  surface antigen (D15)  25.66 
 
 
774 aa  236  1.0000000000000001e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.151472 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03805  hypothetical protein  27.38 
 
 
762 aa  230  7e-59  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1674  surface antigen (D15)  24.92 
 
 
810 aa  229  2e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0992  surface antigen (D15)  24.71 
 
 
875 aa  220  7.999999999999999e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.4186  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2726  surface antigen (D15)  24.78 
 
 
806 aa  214  4.9999999999999996e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0735  surface antigen (D15)  24.54 
 
 
767 aa  210  1e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000801153  hitchhiker  0.00000000000164396 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1900  surface antigen (D15)  25.34 
 
 
772 aa  203  9.999999999999999e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1269  surface antigen (D15)  25.89 
 
 
769 aa  189  2e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.743361  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1917  outer membrane protein  24.93 
 
 
809 aa  182  2e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.220726 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6501  surface antigen (D15)  23.36 
 
 
808 aa  174  5.999999999999999e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3196  surface antigen (D15)  24.32 
 
 
811 aa  139  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0537  surface antigen (D15)  23.67 
 
 
722 aa  119  1.9999999999999998e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1648  hypothetical protein  33.05 
 
 
780 aa  118  3.9999999999999997e-25  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0492  surface antigen (D15)  23.15 
 
 
761 aa  113  2.0000000000000002e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG2095  putative lipoprotein  29.32 
 
 
775 aa  110  1e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.544397 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1648  hypothetical protein  22.06 
 
 
725 aa  109  2e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0470  surface antigen (D15)  23.17 
 
 
730 aa  102  3e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2555  surface antigen (D15)  27.27 
 
 
803 aa  95.9  3e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0652  surface antigen (D15)  30.67 
 
 
734 aa  89.4  3e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.496085  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0533  surface antigen (D15)  33.33 
 
 
743 aa  82.4  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.885553  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0176  hypothetical protein  31.16 
 
 
741 aa  78.6  0.0000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1167  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.56 
 
 
758 aa  58.2  0.0000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.190139  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0758  surface antigen (D15)  26.06 
 
 
610 aa  57.8  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.419664  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0173  surface antigen (D15)  31.21 
 
 
673 aa  56.6  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.182212  normal  0.412559 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1136  surface antigen (D15)  26.83 
 
 
564 aa  55.5  0.000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.325603  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0815  surface antigen (D15)  30.91 
 
 
961 aa  53.9  0.00001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0703  surface antigen (D15)  28.82 
 
 
702 aa  52.4  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.528109  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2608  surface antigen (D15)  31.25 
 
 
843 aa  52.8  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2842  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.86 
 
 
770 aa  52  0.00004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17680  surface antigen (D15)  29.81 
 
 
553 aa  51.6  0.00006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4497  surface antigen (D15)  28.67 
 
 
688 aa  48.5  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0537472  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0465  surface antigen (D15)  32.14 
 
 
702 aa  48.1  0.0007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.9475  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0335  surface antigen variable number repeat protein  32.32 
 
 
428 aa  47.8  0.0008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0071  surface antigen (D15)  27.78 
 
 
633 aa  47.4  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.309783  normal  0.034078 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0816  Outer membrane protein  24.77 
 
 
766 aa  46.6  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.468447  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1278  surface antigen (D15)  30.49 
 
 
763 aa  46.2  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0533  surface antigen (D15)  30.37 
 
 
558 aa  46.2  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.478623 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0448  outer membrane protein, OMP85 family  29.09 
 
 
573 aa  45.4  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4827  surface antigen (D15)  29.73 
 
 
670 aa  45.8  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.501728 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1330  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  26.11 
 
 
770 aa  45.8  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1280  surface antigen (D15)  27.12 
 
 
781 aa  45.4  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.359483  normal  0.823842 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0073  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  26.89 
 
 
772 aa  45.8  0.004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00110643  hitchhiker  5.06207e-17 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1855  surface antigen (D15)  25.34 
 
 
799 aa  44.3  0.01  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.8894  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>