More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_1393 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010644  Emin_1393  ribosomal protein S13  100 
 
 		 124 aa  246  7e-65  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0892  30S ribosomal protein S13  58.06 
 
 		 122 aa  152  2e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000337976  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2594  30S ribosomal protein S13  58.06 
 
 		 126 aa  152  2e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0246557  normal  0.889591 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2882  30S ribosomal protein S13  58.06 
 
 		 126 aa  151  2.9999999999999998e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.617187  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0725  30S ribosomal protein S13  58.87 
 
 		 122 aa  150  5.9999999999999996e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.848573  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0250  ribosomal protein S13  57.26 
 
 		 123 aa  149  1e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000527618  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1499  30S ribosomal protein S13  59.68 
 
 		 123 aa  148  2e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1579  30S ribosomal protein S13  59.68 
 
 		 124 aa  145  1.0000000000000001e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00743687  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1843  30S ribosomal protein S13  57.26 
 
 		 126 aa  145  2.0000000000000003e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.911295 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2307  30S ribosomal protein S13  56.45 
 
 		 122 aa  145  2.0000000000000003e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00023627  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0240  30S ribosomal protein S13  57.26 
 
 		 123 aa  145  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.696841  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0447  30S ribosomal protein S13  56.45 
 
 		 123 aa  144  3e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.219651  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0703  30S ribosomal protein S13  61.29 
 
 		 122 aa  144  3e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000885174  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1370  ribosomal protein S13  60.48 
 
 		 122 aa  143  6e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0625987  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2686  30S ribosomal protein S13  58.06 
 
 		 122 aa  142  1e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000961805  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0650  30S ribosomal protein S13  58.06 
 
 		 122 aa  142  2e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.221495  hitchhiker  0.00000484055 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2434  30S ribosomal protein S13  59.68 
 
 		 123 aa  141  2e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2929  30S ribosomal protein S13  55.65 
 
 		 123 aa  142  2e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141788  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0784  30S ribosomal protein S13  56.45 
 
 		 122 aa  142  2e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0056634  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01420  ribosomal protein S13  62.5 
 
 		 122 aa  141  3e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000243035  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1005  30S ribosomal protein S13  54.84 
 
 		 124 aa  141  3e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000000343576  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0740  ribosomal protein S13  53.28 
 
 		 124 aa  140  6e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0220  SSU ribosomal protein S13P  56.56 
 
 		 121 aa  140  8e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.953183 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0311  ribosomal protein S13  54.03 
 
 		 123 aa  139  9e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.860174  normal  0.358609 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2042  30S ribosomal protein S13  57.26 
 
 		 128 aa  138  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.643752  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1935  30S ribosomal protein S13  58.97 
 
 		 127 aa  138  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.610956 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1089  30S ribosomal protein S13  58.06 
 
 		 122 aa  138  1.9999999999999998e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0717686  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1922  30S ribosomal protein S13  57.26 
 
 		 128 aa  138  3e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1957  30S ribosomal protein S13  57.26 
 
 		 128 aa  138  3e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2657  30S ribosomal protein S13  58.06 
 
 		 124 aa  137  3.9999999999999997e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3304  30S ribosomal protein S13  55.65 
 
 		 122 aa  137  3.9999999999999997e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0001925 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0957  30S ribosomal protein S13  55.65 
 
 		 122 aa  137  3.9999999999999997e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.787526  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2942  30S ribosomal protein S13  58.06 
 
 		 125 aa  137  3.9999999999999997e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0382376  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0275  30S ribosomal protein S13  56.45 
 
 		 125 aa  137  3.9999999999999997e-32  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1158  ribosomal protein S13  54.03 
 
 		 125 aa  137  6e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000034359  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3115  30S ribosomal protein S13  57.26 
 
 		 126 aa  137  6e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3982  30S ribosomal protein S13  57.26 
 
 		 127 aa  136  7.999999999999999e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0746926  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2628  30S ribosomal protein S13  56.45 
 
 		 126 aa  136  8.999999999999999e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4937  30S ribosomal protein S13  52.8 
 
 		 127 aa  135  1e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000115792  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2807  ribosomal protein S13  54.03 
 
 		 122 aa  135  1e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000334253  hitchhiker  0.00000000478637 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0866  ribosomal protein S13  54.84 
 
 		 126 aa  135  2e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.336367  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1731  30S ribosomal protein S13  55.65 
 
 		 125 aa  135  2e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16920  SSU ribosomal protein S13P  56.45 
 
 		 122 aa  135  2e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2131  30S ribosomal protein S13  54.84 
 
 		 122 aa  135  2e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0523363  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0590  30S ribosomal protein S13  54.84 
 
 		 126 aa  134  3.0000000000000003e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.635023  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3642  30S ribosomal protein S13  52.42 
 
 		 122 aa  133  8e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000195969  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2834  30S ribosomal protein S13  54.84 
 
 		 122 aa  133  9e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.161157  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0652  ribosomal protein S13  54.03 
 
 		 124 aa  132  9.999999999999999e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3970  ribosomal protein S13  53.23 
 
 		 121 aa  132  9.999999999999999e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0796  30S ribosomal protein S13  51.61 
 
 		 122 aa  132  1.9999999999999998e-30  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  decreased coverage  0.0000812257  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1639  ribosomal protein S13  53.23 
 
 		 126 aa  132  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.43506  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04230  SSU ribosomal protein S13P  53.78 
 
 		 126 aa  132  1.9999999999999998e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.305446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29480  SSU ribosomal protein S13P  54.03 
 
 		 124 aa  131  1.9999999999999998e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0570342  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0136  30S ribosomal protein S13  54.84 
 
 		 121 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000207382  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2036  30S ribosomal protein S13  50.81 
 
 		 122 aa  132  1.9999999999999998e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.818597  normal  0.51135 
 
 
-
 
NC_002936  DET0499  30S ribosomal protein S13  51.64 
 
 		 129 aa  131  3e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000323492  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0266  30S ribosomal protein S13  56.41 
 
 		 116 aa  131  3e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0730  30S ribosomal protein S13  54.24 
 
 		 127 aa  131  3e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000175069  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2989  30S ribosomal protein S13  50.81 
 
 		 122 aa  131  3e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.183417 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2688  30S ribosomal protein S13  53.23 
 
 		 121 aa  131  3e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2373  30S ribosomal protein S13  53.23 
 
 		 121 aa  131  3e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.768244  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2234  30S ribosomal protein S13  51.61 
 
 		 122 aa  130  5e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0232268  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0869  30S ribosomal protein S13  50.81 
 
 		 122 aa  130  6e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000182214  hitchhiker  0.00600411 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2194  30S ribosomal protein S13  51.61 
 
 		 122 aa  130  6.999999999999999e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.122574  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1720  30S ribosomal protein S13  53.33 
 
 		 124 aa  130  6.999999999999999e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124945  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2752  30S ribosomal protein S13  55.65 
 
 		 123 aa  130  7.999999999999999e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2042  30S ribosomal protein S13  53.23 
 
 		 123 aa  130  7.999999999999999e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00070968  hitchhiker  0.000175358 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0338  ribosomal protein S13  54.03 
 
 		 121 aa  130  7.999999999999999e-30  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3672  30S ribosomal protein S13  50 
 
 		 122 aa  130  7.999999999999999e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1251  30S ribosomal protein S13  52 
 
 		 127 aa  130  7.999999999999999e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00631403  normal  0.17118 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0476  30S ribosomal protein S13  51.64 
 
 		 129 aa  130  9e-30  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000389275  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_441  ribosomal protein S13  51.64 
 
 		 129 aa  129  9e-30  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000306085  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0423  ribosomal protein S13  53.23 
 
 		 125 aa  129  1.0000000000000001e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0092  30S ribosomal protein S13  52.03 
 
 		 121 aa  129  1.0000000000000001e-29  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0157087  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0626  ribosomal protein S13  52.42 
 
 		 125 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1742  30S ribosomal protein S13  56.1 
 
 		 122 aa  129  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0498579  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20620  SSU ribosomal protein S13P  50 
 
 		 123 aa  128  2.0000000000000002e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.114743  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1764  30S ribosomal protein S13  52.03 
 
 		 121 aa  129  2.0000000000000002e-29  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1170  30S ribosomal protein S13  53.23 
 
 		 124 aa  128  2.0000000000000002e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.716485  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1636  30S ribosomal protein S13  50.81 
 
 		 122 aa  128  2.0000000000000002e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0556196  normal  0.0187712 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1579  30S ribosomal protein S13  52.03 
 
 		 121 aa  129  2.0000000000000002e-29  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0672  30S ribosomal protein S13  55.65 
 
 		 121 aa  128  2.0000000000000002e-29  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1945  30S ribosomal protein S13  52.03 
 
 		 121 aa  129  2.0000000000000002e-29  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.260742  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0611  ribosomal protein S13  52.42 
 
 		 124 aa  128  2.0000000000000002e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0713  30S ribosomal protein S13  51.61 
 
 		 126 aa  129  2.0000000000000002e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.237056 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01420  SSU ribosomal protein S13P  50 
 
 		 122 aa  128  3e-29  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.15354  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0135  30S ribosomal protein S13  52.42 
 
 		 121 aa  128  3e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000270668  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0130  30S ribosomal protein S13  52.42 
 
 		 121 aa  128  3e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  5.1035300000000006e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0128  30S ribosomal protein S13  52.42 
 
 		 121 aa  128  3e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000380498  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0978  30S ribosomal protein S13  51.72 
 
 		 122 aa  128  3e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.24534  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0511  30S ribosomal protein S13  52.46 
 
 		 125 aa  128  3e-29  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0156  30S ribosomal protein S13  52.42 
 
 		 121 aa  128  3e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000111603  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0135  30S ribosomal protein S13  52.42 
 
 		 121 aa  128  3e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000525555  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0148  30S ribosomal protein S13  52.42 
 
 		 121 aa  128  3e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.03785e-60 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0135  30S ribosomal protein S13  51.61 
 
 		 121 aa  127  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000332211  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0129  30S ribosomal protein S13  51.61 
 
 		 121 aa  127  4.0000000000000003e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000082296  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1139  30S ribosomal protein S13  50.81 
 
 		 124 aa  127  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.732173  normal  0.382275 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3162  30S ribosomal protein S13  50 
 
 		 122 aa  127  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.548712  normal  0.297498 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0166  30S ribosomal protein S13  51.61 
 
 		 121 aa  127  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000872047  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1127  30S ribosomal protein S13  50.81 
 
 		 124 aa  127  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.121764  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>