47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_3011 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_3011  SNARE associated Golgi protein  100 
 
 
272 aa  536  1e-151  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.140642 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1002  hypothetical protein  36.24 
 
 
230 aa  145  6e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2357  SNARE associated Golgi protein  34.82 
 
 
241 aa  135  8e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.865891  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0873  SNARE associated Golgi protein  29.96 
 
 
236 aa  119  7e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000105314  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0481  hypothetical protein  29.79 
 
 
253 aa  105  1e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000679806  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2985  SNARE associated Golgi protein  34.55 
 
 
254 aa  104  2e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0716748  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1893  hypothetical protein  30.34 
 
 
224 aa  97.4  2e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0149  hypothetical protein  28.04 
 
 
225 aa  95.9  6e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01370  hypothetical protein  34.64 
 
 
277 aa  92.4  6e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.867089  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0150  hypothetical protein  28.02 
 
 
225 aa  92  8e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.113557  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1595  SNARE associated Golgi protein  29.02 
 
 
234 aa  89.4  6e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.734861  hitchhiker  0.00926155 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03520  hypothetical protein  27.49 
 
 
272 aa  87  3e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.130294 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1685  SNARE associated Golgi protein  30.89 
 
 
236 aa  63.9  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2261  SNARE associated Golgi protein  23.81 
 
 
267 aa  61.2  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000842977  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1196  SNARE associated Golgi protein  25.52 
 
 
197 aa  57.4  0.0000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000186388  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1602  hypothetical protein  24.83 
 
 
231 aa  56.2  0.0000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2268  hypothetical protein  32.5 
 
 
211 aa  56.2  0.0000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12210  hypothetical protein  27.98 
 
 
227 aa  53.9  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.992528  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0914  hypothetical protein  22.99 
 
 
203 aa  53.1  0.000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2397  hypothetical protein  28.92 
 
 
238 aa  52.4  0.000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1185  SNARE associated Golgi protein  29.63 
 
 
258 aa  49.3  0.00006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2469  hypothetical protein  23.88 
 
 
236 aa  45.8  0.0008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1727  SNARE associated Golgi protein  22.3 
 
 
189 aa  45.1  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1440  hypothetical protein  23.88 
 
 
236 aa  45.1  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.212634  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1973  hypothetical protein  23.88 
 
 
236 aa  45.1  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01719  predicted inner membrane protein  23.88 
 
 
236 aa  44.7  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1882  SNARE associated Golgi protein  23.88 
 
 
236 aa  44.7  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00131258 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1038  SNARE associated Golgi protein  30.48 
 
 
197 aa  44.3  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0192759  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01707  hypothetical protein  23.88 
 
 
236 aa  44.7  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1294  hypothetical protein  31.43 
 
 
197 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.139623  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1242  hypothetical protein  31.43 
 
 
197 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1058  hypothetical protein  31.43 
 
 
197 aa  43.9  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1217  hypothetical protein  31.43 
 
 
197 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1139  hypothetical protein  31.43 
 
 
197 aa  43.9  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0869557  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0429  SNARE associated Golgi protein  23.96 
 
 
229 aa  43.9  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1038  hypothetical protein  31.43 
 
 
197 aa  43.9  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0857  SNARE associated Golgi protein  29.03 
 
 
197 aa  43.5  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0125734  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1036  hypothetical protein  31.43 
 
 
197 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2761  hypothetical protein  27.49 
 
 
267 aa  43.1  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.281656  normal  0.425828 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1944  SNARE associated Golgi protein  29.44 
 
 
223 aa  43.5  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0795121  normal  0.25437 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1892  SNARE associated Golgi protein-like protein  23.38 
 
 
236 aa  43.1  0.005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.328931  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2340  hypothetical protein  25.83 
 
 
226 aa  43.1  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.290858  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1834  hypothetical protein  23.38 
 
 
236 aa  43.1  0.005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4133  SNARE associated Golgi protein  27.36 
 
 
230 aa  42.7  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.341541 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4151  hypothetical protein  30.48 
 
 
197 aa  42.7  0.007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.191021  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4094  SNARE associated Golgi protein  27.36 
 
 
230 aa  42.7  0.007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1190  hypothetical protein  30.48 
 
 
197 aa  42.7  0.007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0227166  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>