28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_2296 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_2296  C_GCAxxG_C_C family protein  100 
 
 
156 aa  316  7.999999999999999e-86  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01840  C_GCAxxG_C_C family probable redox protein  48.92 
 
 
143 aa  110  5e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0233  C_GCAxxG_C_C family protein  38.32 
 
 
156 aa  75.5  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00763518  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2781  C_GCAxxG_C_C family protein  38.89 
 
 
148 aa  75.5  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1399  C_GCAxxG_C_C family protein  39.25 
 
 
172 aa  74.7  0.0000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0718926  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2556  C_GCAxxG_C_C family protein  32 
 
 
146 aa  73.6  0.000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0747  C_GCAxxG_C_C family protein  38.18 
 
 
327 aa  71.6  0.000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1937  C_GCAxxG_C_C family protein  39.25 
 
 
148 aa  70.9  0.000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2054  hypothetical protein  29.93 
 
 
171 aa  68.9  0.00000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0045  redox family protein  34.31 
 
 
148 aa  67.8  0.00000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000553397  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0477  C_GCAxxG_C_C family protein  36.91 
 
 
156 aa  65.9  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.664237  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_44  redox protein  31.37 
 
 
148 aa  63.9  0.0000000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000630666  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4296  C_GCAxxG_C_C family protein  35.66 
 
 
143 aa  63.9  0.0000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000101878  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0041  C_GCAxxG_C_C family protein  32.04 
 
 
148 aa  62  0.000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000104538  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0465  C_GCAxxG_C_C family protein  30.69 
 
 
146 aa  58.5  0.00000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.00655553 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0460  hypothetical protein  34.29 
 
 
152 aa  55.8  0.0000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3143  C_GCAxxG_C_C family protein  37.33 
 
 
149 aa  52.8  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2420  C_GCAxxG_C_C family protein  34.82 
 
 
149 aa  48.9  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1719  hypothetical protein  28.46 
 
 
121 aa  48.9  0.00003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.408454  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3529  C_GCAxxG_C_C family protein  30.58 
 
 
146 aa  48.1  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0035  C_GCAxxG_C_C family protein  33.61 
 
 
154 aa  48.1  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1812  C_GCAxxG_C_C family protein  31.53 
 
 
152 aa  47.8  0.00005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1447  hypothetical protein  28.46 
 
 
121 aa  47.8  0.00006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.281245  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2965  hypothetical protein  34.55 
 
 
182 aa  47.4  0.00008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1471  C_GCAxxG_C_C family protein  27.88 
 
 
148 aa  45.8  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0479  C_GCAxxG_C_C family protein  29.91 
 
 
153 aa  44.3  0.0006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1769  hypothetical protein  35.37 
 
 
291 aa  43.9  0.0009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.06784  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0224  C_GCAxxG_C_C family protein  32.69 
 
 
161 aa  43.5  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>