29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_A0026 on replicon NC_010488
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010488  EcSMS35_A0026  conjugal transfer pilus assembly protein TraU  100 
 
 		 330 aa  687    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4296  conjugal transfer pilus assembly protein TraU  63.73 
 
 		 334 aa  410  1e-113  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.973053 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_11  conjugative transfer protein TraU  49.1 
 
 		 334 aa  365  1e-100  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4439  TraU family protein  50.3 
 
 		 337 aa  365  1e-100  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4624  TraU family protein  50.3 
 
 		 337 aa  364  1e-99  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4435  TraU family protein  50.3 
 
 		 337 aa  364  1e-99  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.235263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4381  TraU family protein  50.3 
 
 		 337 aa  363  2e-99  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4532  TraU family protein  50.3 
 
 		 337 aa  363  2e-99  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4505  TraU family protein  49.85 
 
 		 335 aa  357  9.999999999999999e-98  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0031  hypothetical protein  51.61 
 
 		 331 aa  342  4e-93  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.957348  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0023  hypothetical protein  51.6 
 
 		 327 aa  327  1.0000000000000001e-88  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.621919  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5377  TraU family protein  47.43 
 
 		 340 aa  305  7e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.96345 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4174  TraU family protein  42.26 
 
 		 333 aa  283  2.0000000000000002e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.109495 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_4000  TraU family protein  44.24 
 
 		 340 aa  277  2e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4231  hypothetical protein  45.05 
 
 		 328 aa  277  2e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6806  TraU family protein  40.61 
 
 		 343 aa  265  1e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2658  hypothetical protein  40 
 
 		 342 aa  231  1e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.274571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2325  hypothetical protein  39.18 
 
 		 342 aa  231  1e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.133454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1530  TraU family protein  39.61 
 
 		 341 aa  223  4e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.283148  normal  0.998199 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0249  TraU family protein  37.58 
 
 		 340 aa  215  9.999999999999999e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0311  TraU family protein  34.23 
 
 		 340 aa  207  3e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0349  conjugal DNA transfer protein  34.07 
 
 		 353 aa  176  5e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.469049 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3772  TraU family protein  31.91 
 
 		 329 aa  175  9.999999999999999e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6167  sex pilus assembly and synthesis protein TraU  33.13 
 
 		 344 aa  169  8e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0101379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0100  type IV conjugative transfer system protein TraU  36.36 
 
 		 335 aa  168  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.185044 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6232  TraU family protein  31.86 
 
 		 337 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4207  TraU family protein  31.72 
 
 		 359 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00154228  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1096  conjugal transfer protein TraU, putative  23.75 
 
 		 416 aa  104  2e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.952693  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2167  hypothetical protein  43.8 
 
 		 371 aa  103  4e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>