26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_3395 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009801  EcE24377A_3395  hypothetical protein  100 
 
 
243 aa  505  9.999999999999999e-143  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3198  hypothetical protein  87.24 
 
 
243 aa  441  1e-123  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4689  hypothetical protein  87.24 
 
 
243 aa  437  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.577557  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4793  hypothetical protein  85.19 
 
 
243 aa  427  1e-119  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.2342 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2132  hypothetical protein  40.43 
 
 
189 aa  164  9e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1077  hypothetical protein  40.17 
 
 
189 aa  161  8.000000000000001e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.371297 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4884  hypothetical protein  39.74 
 
 
189 aa  159  3e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0924  CP4-57 prophage; hypothetical protein  32.91 
 
 
207 aa  116  3.9999999999999997e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00353678  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0768  hypothetical protein  32.48 
 
 
208 aa  107  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4754  transposase  32.16 
 
 
199 aa  101  9e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.570232  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1443  hypothetical protein  34.04 
 
 
215 aa  100  2e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1393  hypothetical protein  38.36 
 
 
203 aa  98.6  8e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1795  hypothetical protein  33.19 
 
 
225 aa  97.4  2e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.527879 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0762  hypothetical protein  39.85 
 
 
209 aa  94.4  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1252  transposase  32.59 
 
 
221 aa  94.4  2e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0590866  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1049  conserved hypothetical protein  30.83 
 
 
208 aa  93.2  3e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1767  hypothetical protein  32.34 
 
 
225 aa  92.8  4e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.834919  normal  0.487109 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3513  transposase  31.76 
 
 
222 aa  92.8  5e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3328  conserved hypothetical protein  29.41 
 
 
208 aa  90.9  1e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1781  hypothetical protein  36.42 
 
 
198 aa  90.5  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0242825  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1691  hypothetical protein  28.82 
 
 
220 aa  83.6  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.669152  normal  0.0131233 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001841  hypothetical protein  33.12 
 
 
220 aa  77.4  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1254  transposase  30.32 
 
 
208 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1718  hypothetical protein  30.06 
 
 
206 aa  68.9  0.00000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0376  transposase  31.88 
 
 
202 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.581845  hitchhiker  0.0000248645 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2954  hypothetical protein  27.01 
 
 
225 aa  56.6  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.399197  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>