76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECD_03759 on replicon CP001509
Organism: Escherichia coli BL21(DE3)



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03759  predicted transporter  100 
 
 		 421 aa  848    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.403502  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4101  major facilitator transporter  100 
 
 		 421 aa  848    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4112  major facilitator superfamily MFS_1  99.76 
 
 		 421 aa  844    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03708  hypothetical protein  100 
 
 		 421 aa  848    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.450457  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4397  major facilitator transporter  99.52 
 
 		 421 aa  846    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5320  transporter, major facilitator family  99.52 
 
 		 421 aa  845    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.581076  normal  0.378409 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4142  major facilitator transporter  100 
 
 		 421 aa  848    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.810342 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4259  major facilitator transporter  100 
 
 		 421 aa  848    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3580  major facilitator transporter  77.43 
 
 		 421 aa  628  1e-179  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.177538 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0425  major facilitator family protein  38.7 
 
 		 428 aa  270  5e-71  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.950932  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0068  major facilitator superfamily MFS_1  37.99 
 
 		 419 aa  258  9e-68  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.774441  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2823  major facilitator transporter  56.06 
 
 		 207 aa  235  1.0000000000000001e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.138199 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4860  major facilitator family protein CglT  33.09 
 
 		 422 aa  233  5e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.997387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3509  major facilitator transporter  41.95 
 
 		 214 aa  171  3e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.36765  normal  0.167547 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2463  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 427 aa  153  5e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2903  major facilitator family transporter  26.63 
 
 		 425 aa  150  3e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.173652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2836  major facilitator transporter  26.24 
 
 		 448 aa  149  6e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.647755  normal  0.917959 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4031  major facilitator family transporter  26.11 
 
 		 425 aa  149  8e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.80085  normal  0.402393 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2914  major facilitator family transporter  26.37 
 
 		 425 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00716941  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02619  predicted transporter  25.85 
 
 		 425 aa  147  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3076  major facilitator family transporter  26.11 
 
 		 425 aa  147  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00169056  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0938  major facilitator transporter  25.85 
 
 		 425 aa  147  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.90207  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02582  hypothetical protein  25.85 
 
 		 425 aa  147  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0914  major facilitator superfamily MFS_1  25.85 
 
 		 425 aa  147  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.385609  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2061  major facilitator family protein  27.09 
 
 		 417 aa  147  5e-34  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0338  MFS transporter  25.18 
 
 		 427 aa  144  2e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0543879  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1836  major facilitator superfamily MFS_1  27.93 
 
 		 438 aa  133  6e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1991  major facilitator superfamily MFS_1  25.48 
 
 		 440 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.359868 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2908  major facilitator transporter  25.24 
 
 		 423 aa  127  5e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0278927 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07155  hypothetical protein  27.49 
 
 		 428 aa  124  2e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3299  major facilitator transporter  26.93 
 
 		 433 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1586  major facilitator superfamily permease  22.22 
 
 		 461 aa  67.8  0.0000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000240166  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0138  hypothetical protein  24.07 
 
 		 483 aa  66.2  0.000000001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1773  major facilitator superfamily MFS_1  23.37 
 
 		 441 aa  57.4  0.0000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2474  hypothetical protein  22.65 
 
 		 455 aa  56.2  0.000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1367  major facilitator superfamily MFS_1  22.46 
 
 		 446 aa  55.1  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1683  hypothetical protein  36.25 
 
 		 82 aa  55.1  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2623  hypothetical protein  22.65 
 
 		 455 aa  55.8  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0137  hypothetical protein  28.51 
 
 		 497 aa  53.9  0.000005  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3268  sn-glycerol-3-phosphate transporter  21.38 
 
 		 446 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4175  regulatory protein UhpC  23.68 
 
 		 439 aa  51.2  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4032  regulatory protein UhpC  24.81 
 
 		 439 aa  51.2  0.00004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.47751 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5097  regulatory protein UhpC  24.44 
 
 		 439 aa  50.1  0.00008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.113676 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0032  regulatory protein UhpC  24.44 
 
 		 439 aa  50.1  0.00008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03493  hypothetical protein  24.44 
 
 		 439 aa  50.1  0.00008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3880  regulatory protein UhpC  24.44 
 
 		 439 aa  50.1  0.00008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0036  phosphoglycerate transporter  24.44 
 
 		 439 aa  50.1  0.00008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03551  membrane protein regulates uhpT expression  24.44 
 
 		 439 aa  50.1  0.00008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4177  regulatory protein UhpC  23.48 
 
 		 442 aa  49.7  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4252  regulatory protein UhpC  23.68 
 
 		 439 aa  49.7  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3998  regulatory protein UhpC  23.48 
 
 		 442 aa  49.7  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4119  regulatory protein UhpC  23.48 
 
 		 442 aa  49.7  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0207  major facilitator superfamily MFS_1  23.24 
 
 		 506 aa  49.7  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4069  regulatory protein UhpC  23.58 
 
 		 442 aa  48.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4014  regulatory protein UhpC  23.58 
 
 		 442 aa  48.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2142  major facilitator superfamily transporter  22.96 
 
 		 432 aa  48.1  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.697064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_94723  MFS family transporter: glycerol-3-phosphate  23.79 
 
 		 424 aa  47.4  0.0005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.000449836 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0300  nitrite extrusion protein  25.62 
 
 		 895 aa  47.4  0.0005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.129473  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2890  nitrite transporter  25.52 
 
 		 912 aa  46.2  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2231  major facilitator superfamily MFS_1  24.21 
 
 		 443 aa  46.6  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.495487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0511  glycerol 3-phosphate transporter  22.15 
 
 		 481 aa  46.2  0.001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000061877  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3925  major facilitator transporter  24.7 
 
 		 445 aa  46.2  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.362735 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2594  major facilitator transporter  28.65 
 
 		 460 aa  45.4  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.640218  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1254  general substrate transporter  22.55 
 
 		 449 aa  45.4  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3128  major facilitator transporter  24.7 
 
 		 435 aa  44.7  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2870  glycerol-3-phosphate transporter  22.87 
 
 		 445 aa  44.7  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4453  major facilitator transporter  25 
 
 		 402 aa  44.7  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.271765  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2355  major facilitator superfamily MFS_1  25.6 
 
 		 385 aa  44.3  0.004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4105  major facilitator family transporter  29.1 
 
 		 479 aa  44.3  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3862  major facilitator transporter  27.86 
 
 		 453 aa  44.3  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3298  sn-glycerol-3-phosphate transporter  21.4 
 
 		 457 aa  43.5  0.007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4149  sn-glycerol-3-phosphate transporter  21.69 
 
 		 449 aa  43.5  0.007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000087639  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0206  sugar phosphate antiporter  25.63 
 
 		 459 aa  43.5  0.007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0212  sugar phosphate antiporter  25.63 
 
 		 459 aa  43.5  0.007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69130  sn-glycerol-3-phosphate transporter  21.5 
 
 		 448 aa  43.5  0.008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1681  hypothetical protein  32.56 
 
 		 103 aa  43.1  0.009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>