32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1213 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_1213  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 277 aa  558  1e-158  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.576594 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0614  Tetratricopeptide domain protein  55.76 
 
 		 271 aa  306  3e-82  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00924993 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1630  TPR repeat-containing protein  40.29 
 
 		 279 aa  211  2e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.374072  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0439  Tetratricopeptide domain protein  39.34 
 
 		 272 aa  187  1e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2369  TPR repeat-containing protein  26.23 
 
 		 271 aa  76.3  0.0000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.551588 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0269  TPR repeat-containing protein  24.51 
 
 		 267 aa  75.9  0.0000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.583908 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3645  TPR repeat-containing protein  25.19 
 
 		 266 aa  70.9  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3216  TPR repeat-containing protein  30.09 
 
 		 643 aa  50.8  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000674385  hitchhiker  0.00000466075 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0495  TPR repeat-containing protein  32.74 
 
 		 592 aa  50.1  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.31548  hitchhiker  0.000811281 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0712  tetratricopeptide TPR_2  30.68 
 
 		 677 aa  49.7  0.00006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4141  TPR repeat-containing protein  27.57 
 
 		 637 aa  47  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  27.34 
 
 		 808 aa  47  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  28.16 
 
 		 1486 aa  47  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  28.11 
 
 		 639 aa  46.6  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0892  TPR repeat-containing protein  27.57 
 
 		 636 aa  46.6  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.647896  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0702  TPR repeat-containing protein  32.03 
 
 		 667 aa  46.6  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.274193  normal  0.091435 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1987  TPR repeat-containing protein  31.51 
 
 		 934 aa  46.2  0.0006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0465352  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  28.09 
 
 		 612 aa  45.8  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1809  TPR repeat-containing protein  28.83 
 
 		 524 aa  45.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.229581 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0987  TPR repeat-containing protein  28.09 
 
 		 611 aa  44.3  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384547  normal  0.0740288 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1813  hypothetical protein  31.07 
 
 		 210 aa  44.3  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0447  TPR domain-containing protein  27.78 
 
 		 992 aa  44.7  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000620141  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1028  TPR repeat-containing protein  27.57 
 
 		 635 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608823  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  27.57 
 
 		 635 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1987  TPR domain-containing protein  31.11 
 
 		 864 aa  43.9  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.944233  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19131  hypothetical protein  25.5 
 
 		 936 aa  43.9  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.105709 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1432  TPR domain-containing protein  28.44 
 
 		 573 aa  43.9  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3611  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  28.81 
 
 		 263 aa  43.5  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.253083 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1226  hypothetical protein  31.88 
 
 		 243 aa  42.7  0.006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2549  hypothetical protein  25.35 
 
 		 577 aa  42.7  0.006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0443  TPR repeat-containing protein  20.81 
 
 		 193 aa  42.7  0.006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.383508  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2405  hypothetical protein  25.35 
 
 		 577 aa  42  0.01  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>