47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0865 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_0865  phage head-tail adaptor, putative  100 
 
 
109 aa  225  1e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.913783 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1652  phage head-tail adaptor  52.38 
 
 
104 aa  102  2e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1291  phage head-tail adaptor  41.58 
 
 
105 aa  85.5  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.184704  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4380  phage head-tail adaptor, putative  41.9 
 
 
110 aa  84.7  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5157  phage head-tail adaptor  44.12 
 
 
104 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.501903  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1716  phage head-tail adaptor, putative  44.83 
 
 
108 aa  75.5  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3392  phage head-tail adaptor  40.38 
 
 
113 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.444321  hitchhiker  0.00000000238294 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2233  phage head-tail adaptor, putative  36.94 
 
 
112 aa  70.1  0.000000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.921733 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0630  phage head-tail adaptor  34.58 
 
 
109 aa  68.2  0.00000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1775  phage head-tail adaptor, putative  35.24 
 
 
110 aa  68.2  0.00000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.368112  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1686  phage HK022 GP9-like protein  36.67 
 
 
108 aa  63.5  0.0000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.488035 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1622  phage head-tail adaptor, putative  32.38 
 
 
109 aa  61.6  0.000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.400752 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4110  phage head-tail adaptor, putative  39.33 
 
 
114 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2591  phage head-tail adaptor, putative  37.97 
 
 
107 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1886  phage head-tail adaptor, putative  35.63 
 
 
105 aa  60.1  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.590361  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1619  phage head-tail adaptor, putative  34.65 
 
 
109 aa  58.2  0.00000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.171489  normal  0.258469 
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4256  phage head-tail adaptor  32.69 
 
 
111 aa  58.2  0.00000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0909  phage head-tail adaptor, putative  36 
 
 
105 aa  56.6  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.824958 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2626  phage head-tail adaptor, putative  30 
 
 
107 aa  54.3  0.0000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1475  phage head-tail adaptor, putative  32.35 
 
 
104 aa  54.3  0.0000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.514151 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7147  phage head-tail adaptor  25.93 
 
 
117 aa  52.8  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00871215 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1427  phage head-tail adaptor  32.53 
 
 
113 aa  52  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.157647  normal  0.2809 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1050  phage head-tail adaptor, putative  37.88 
 
 
109 aa  51.2  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0938384  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3800  hypothetical protein  29.73 
 
 
118 aa  50.8  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4088  hypothetical protein  29.73 
 
 
118 aa  50.8  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1701  phage head-tail adaptor  32.97 
 
 
113 aa  50.4  0.000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.228407  normal  0.203712 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0592  hypothetical protein  26.73 
 
 
112 aa  50.8  0.000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0591  hypothetical protein  26.73 
 
 
112 aa  50.8  0.000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3870  phage head-tail adaptor  30.39 
 
 
109 aa  49.7  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.463779  normal  0.0202673 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1368  phage head-tail adaptor, putative  29 
 
 
107 aa  48.5  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.504949 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0285  phage head-tail adaptor, putative  30 
 
 
107 aa  48.1  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1570  head-tail adaptor  39.76 
 
 
113 aa  47  0.00009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00396333 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3940  phage head-tail adaptor  28.04 
 
 
108 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1342  phage head-tail adaptor  34.94 
 
 
113 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.280086 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1423  phage head-tail adaptor  35.23 
 
 
112 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.239909 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1461  phage head-tail adaptor  29.91 
 
 
109 aa  45.8  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3587  phage head-tail adaptor, putative  26.85 
 
 
116 aa  45.1  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1381  phage head-tail adaptor, putative  26.61 
 
 
117 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00078456 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0653  Phage head-tail adaptor, putative  34.86 
 
 
116 aa  45.4  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.305971  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1486  bacteriophage head-tail adaptor  29.36 
 
 
127 aa  43.1  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0332  hypothetical protein  27.88 
 
 
111 aa  42.7  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0663  phage head-tail adaptor, putative  26.85 
 
 
116 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2019  hypothetical protein  27.88 
 
 
111 aa  42.4  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6189  Bacteriophage head-tail adaptor  31.68 
 
 
106 aa  42.4  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.905636  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3159  phage head-tail adaptor, putative  28.16 
 
 
106 aa  42.7  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.182206  normal  0.0118931 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1340  hypothetical protein  30.69 
 
 
107 aa  41.6  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0268917  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2107  phage head-tail adaptor  33.33 
 
 
106 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000913965  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>