19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_1570 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_1570  head-tail adaptor  100 
 
 		 113 aa  230  5e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00396333 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1342  phage head-tail adaptor  90.27 
 
 		 113 aa  209  1e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.280086 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4110  phage head-tail adaptor, putative  68.14 
 
 		 114 aa  149  8.999999999999999e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5157  phage head-tail adaptor  43.68 
 
 		 104 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.501903  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1652  phage head-tail adaptor  40 
 
 		 104 aa  55.8  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2233  phage head-tail adaptor, putative  35.04 
 
 		 112 aa  55.5  0.0000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.921733 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0865  phage head-tail adaptor, putative  39.76 
 
 		 109 aa  53.1  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.913783 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1716  phage head-tail adaptor, putative  34.83 
 
 		 108 aa  53.5  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0630  phage head-tail adaptor  33.33 
 
 		 109 aa  52.4  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1381  phage head-tail adaptor, putative  27.43 
 
 		 117 aa  52  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00078456 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0663  phage head-tail adaptor, putative  28.18 
 
 		 116 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3587  phage head-tail adaptor, putative  28.18 
 
 		 116 aa  51.2  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2697  phage head-tail adaptor, putative  27.27 
 
 		 117 aa  50.4  0.000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3392  phage head-tail adaptor  37.63 
 
 		 113 aa  43.5  0.0009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.444321  hitchhiker  0.00000000238294 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2960  hypothetical protein  33.33 
 
 		 120 aa  42  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0010  putative phage head-tail adaptor  28.42 
 
 		 113 aa  41.2  0.004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1461  phage head-tail adaptor  30.51 
 
 		 109 aa  41.2  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4380  phage head-tail adaptor, putative  34.78 
 
 		 110 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1050  phage head-tail adaptor, putative  32.5 
 
 		 109 aa  40.4  0.008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0938384  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>