28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_4110 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_4110  phage head-tail adaptor, putative  100 
 
 		 114 aa  232  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1342  phage head-tail adaptor  67.26 
 
 		 113 aa  148  3e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.280086 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1570  head-tail adaptor  68.14 
 
 		 113 aa  135  1e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00396333 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1716  phage head-tail adaptor, putative  38.1 
 
 		 108 aa  67.4  0.00000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0865  phage head-tail adaptor, putative  39.33 
 
 		 109 aa  60.8  0.000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.913783 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5157  phage head-tail adaptor  37.5 
 
 		 104 aa  60.8  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.501903  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2233  phage head-tail adaptor, putative  35.65 
 
 		 112 aa  59.7  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.921733 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1652  phage head-tail adaptor  37.78 
 
 		 104 aa  58.5  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1381  phage head-tail adaptor, putative  31.53 
 
 		 117 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00078456 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4380  phage head-tail adaptor, putative  39.77 
 
 		 110 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3587  phage head-tail adaptor, putative  30.28 
 
 		 116 aa  57.4  0.00000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2697  phage head-tail adaptor, putative  29.36 
 
 		 117 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0663  phage head-tail adaptor, putative  30.28 
 
 		 116 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0630  phage head-tail adaptor  34.07 
 
 		 109 aa  54.3  0.0000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1461  phage head-tail adaptor  30.28 
 
 		 109 aa  49.7  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2589  phage head-tail adaptor  31.15 
 
 		 120 aa  49.7  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.939833  normal  0.722848 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2960  hypothetical protein  30.51 
 
 		 120 aa  49.3  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1686  phage HK022 GP9-like protein  32.58 
 
 		 108 aa  48.5  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.488035 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2497  phage head-tail adaptor  35.16 
 
 		 111 aa  47  0.00009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0209227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1775  phage head-tail adaptor, putative  28.72 
 
 		 110 aa  47  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.368112  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4000  phage head-tail adaptor, putative  32.61 
 
 		 114 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1622  phage head-tail adaptor, putative  29.2 
 
 		 109 aa  45.4  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.400752 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0909  phage head-tail adaptor, putative  28 
 
 		 105 aa  44.3  0.0005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.824958 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1050  phage head-tail adaptor, putative  38.6 
 
 		 109 aa  43.9  0.0007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0938384  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3392  phage head-tail adaptor  32.47 
 
 		 113 aa  42.7  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.444321  hitchhiker  0.00000000238294 
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0010  putative phage head-tail adaptor  23.36 
 
 		 113 aa  41.6  0.003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2591  phage head-tail adaptor, putative  38.78 
 
 		 107 aa  40.4  0.009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3870  phage head-tail adaptor  33.82 
 
 		 109 aa  40  0.01  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.463779  normal  0.0202673 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>