24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_1622 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_1622  phage head-tail adaptor, putative  100 
 
 
109 aa  218  3e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.400752 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1775  phage head-tail adaptor, putative  80.37 
 
 
110 aa  175  1e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.368112  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1686  phage HK022 GP9-like protein  42.2 
 
 
108 aa  82.4  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.488035 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1050  phage head-tail adaptor, putative  37.96 
 
 
109 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0938384  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3870  phage head-tail adaptor  36.17 
 
 
109 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.463779  normal  0.0202673 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0865  phage head-tail adaptor, putative  32.38 
 
 
109 aa  61.6  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.913783 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3800  hypothetical protein  31.58 
 
 
118 aa  58.5  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4088  hypothetical protein  31.58 
 
 
118 aa  58.5  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3392  phage head-tail adaptor  30.91 
 
 
113 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.444321  hitchhiker  0.00000000238294 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2626  phage head-tail adaptor, putative  32.26 
 
 
107 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1652  phage head-tail adaptor  33.33 
 
 
104 aa  52.8  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2591  phage head-tail adaptor, putative  31.18 
 
 
107 aa  52.4  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2233  phage head-tail adaptor, putative  28.32 
 
 
112 aa  49.7  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.921733 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1340  hypothetical protein  27.36 
 
 
107 aa  48.1  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0268917  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5157  phage head-tail adaptor  30.85 
 
 
104 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.501903  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3940  phage head-tail adaptor  29.25 
 
 
108 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4380  phage head-tail adaptor, putative  24.77 
 
 
110 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0630  phage head-tail adaptor  29.47 
 
 
109 aa  46.2  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4110  phage head-tail adaptor, putative  29.2 
 
 
114 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4468  putative phage head-tail adaptor  28.57 
 
 
137 aa  42.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000182332 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6189  Bacteriophage head-tail adaptor  26.92 
 
 
106 aa  43.1  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.905636  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4000  phage head-tail adaptor, putative  23.85 
 
 
114 aa  42  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1886  phage head-tail adaptor, putative  32.22 
 
 
105 aa  42  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.590361  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1291  phage head-tail adaptor  23.08 
 
 
105 aa  40.4  0.009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.184704  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>