30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_1340 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_1340  hypothetical protein  100 
 
 		 107 aa  215  1e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0268917  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0591  hypothetical protein  39.05 
 
 		 112 aa  83.6  9e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0592  hypothetical protein  39.05 
 
 		 112 aa  83.6  9e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1981  hypothetical protein  38.71 
 
 		 109 aa  65.5  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.50206 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0909  phage head-tail adaptor, putative  35.64 
 
 		 105 aa  64.7  0.0000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.824958 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3467  Phage head-tail adaptor, putative  34.91 
 
 		 106 aa  64.7  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0252975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1814  hypothetical protein  36.7 
 
 		 106 aa  63.9  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00514089  normal  0.210861 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2107  phage head-tail adaptor  37.04 
 
 		 106 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000913965  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4468  putative phage head-tail adaptor  30.48 
 
 		 137 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000182332 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2596  phage head-tail adaptor, putative  27.62 
 
 		 137 aa  55.8  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0281305 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1427  phage head-tail adaptor  38.2 
 
 		 113 aa  53.5  0.0000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.157647  normal  0.2809 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4970  phage head-tail adaptor  34.74 
 
 		 117 aa  53.5  0.0000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000866578 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1080  phage head-tail adaptor, putative  32.38 
 
 		 111 aa  53.5  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.130936 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3159  phage head-tail adaptor, putative  34.65 
 
 		 106 aa  53.1  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.182206  normal  0.0118931 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1423  phage head-tail adaptor  36.36 
 
 		 112 aa  51.6  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.239909 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6053  putative phage tail-head adaptor  34.58 
 
 		 111 aa  51.2  0.000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1701  phage head-tail adaptor  37.08 
 
 		 113 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.228407  normal  0.203712 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1135  phage head-tail adaptor, putative  32.71 
 
 		 111 aa  50.1  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.573897 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2260  putative phage head-tail adaptor  28.85 
 
 		 134 aa  48.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.710189  normal  0.0451218 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1622  phage head-tail adaptor, putative  27.36 
 
 		 109 aa  48.1  0.00004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.400752 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2263  putative phage head-tail adaptor  27.88 
 
 		 134 aa  48.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000011427 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3800  hypothetical protein  27.78 
 
 		 118 aa  44.7  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4088  hypothetical protein  27.78 
 
 		 118 aa  44.7  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1775  phage head-tail adaptor, putative  25.96 
 
 		 110 aa  43.1  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.368112  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1652  phage head-tail adaptor  29.81 
 
 		 104 aa  42.4  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4256  phage head-tail adaptor  22.92 
 
 		 111 aa  42.4  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2172  hypothetical protein  28.3 
 
 		 112 aa  42  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0865  phage head-tail adaptor, putative  30.69 
 
 		 109 aa  41.6  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.913783 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4380  phage head-tail adaptor, putative  31.46 
 
 		 110 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1637  hypothetical protein  27.45 
 
 		 108 aa  40.8  0.006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>