32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_5157 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_5157  phage head-tail adaptor  100 
 
 
104 aa  213  9e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.501903  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0865  phage head-tail adaptor, putative  44.12 
 
 
109 aa  81.6  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.913783 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3392  phage head-tail adaptor  46.15 
 
 
113 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.444321  hitchhiker  0.00000000238294 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1686  phage HK022 GP9-like protein  36.67 
 
 
108 aa  66.2  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.488035 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2233  phage head-tail adaptor, putative  35.78 
 
 
112 aa  62.8  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.921733 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1291  phage head-tail adaptor  37.25 
 
 
105 aa  62  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.184704  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1342  phage head-tail adaptor  41.38 
 
 
113 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.280086 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4110  phage head-tail adaptor, putative  37.5 
 
 
114 aa  60.8  0.000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1652  phage head-tail adaptor  34.91 
 
 
104 aa  58.9  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1775  phage head-tail adaptor, putative  36.17 
 
 
110 aa  57.8  0.00000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.368112  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1716  phage head-tail adaptor, putative  34.09 
 
 
108 aa  56.6  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3870  phage head-tail adaptor  38.67 
 
 
109 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.463779  normal  0.0202673 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2960  hypothetical protein  38.78 
 
 
120 aa  54.3  0.0000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1570  head-tail adaptor  43.68 
 
 
113 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00396333 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3940  phage head-tail adaptor  34.91 
 
 
108 aa  52.8  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0663  phage head-tail adaptor, putative  34.85 
 
 
116 aa  52  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3587  phage head-tail adaptor, putative  34.85 
 
 
116 aa  50.8  0.000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0630  phage head-tail adaptor  28.3 
 
 
109 aa  48.9  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1050  phage head-tail adaptor, putative  29.73 
 
 
109 aa  48.9  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0938384  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2591  phage head-tail adaptor, putative  29 
 
 
107 aa  47.4  0.00007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1622  phage head-tail adaptor, putative  30.85 
 
 
109 aa  47.4  0.00007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.400752 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2589  phage head-tail adaptor  34.69 
 
 
120 aa  47.4  0.00007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.939833  normal  0.722848 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4380  phage head-tail adaptor, putative  30.49 
 
 
110 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1381  phage head-tail adaptor, putative  29.49 
 
 
117 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00078456 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2697  phage head-tail adaptor, putative  27.91 
 
 
117 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1725  hypothetical protein  31.13 
 
 
112 aa  43.5  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0406142  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2626  phage head-tail adaptor, putative  26.67 
 
 
107 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0592  hypothetical protein  25.24 
 
 
112 aa  42  0.003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2019  hypothetical protein  31.78 
 
 
111 aa  42  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0332  hypothetical protein  31.78 
 
 
111 aa  42  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0591  hypothetical protein  25.24 
 
 
112 aa  42  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7147  phage head-tail adaptor  26.17 
 
 
117 aa  40.8  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00871215 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>