42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1716 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_1716  phage head-tail adaptor, putative  100 
 
 		 108 aa  223  5.0000000000000005e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0630  phage head-tail adaptor  41.67 
 
 		 109 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0865  phage head-tail adaptor, putative  44.83 
 
 		 109 aa  75.5  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.913783 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4380  phage head-tail adaptor, putative  38.18 
 
 		 110 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1486  bacteriophage head-tail adaptor  36.36 
 
 		 127 aa  68.2  0.00000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1461  phage head-tail adaptor  35.19 
 
 		 109 aa  67.8  0.00000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1652  phage head-tail adaptor  34.95 
 
 		 104 aa  67.8  0.00000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4110  phage head-tail adaptor, putative  38.1 
 
 		 114 aa  67.4  0.00000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0010  putative phage head-tail adaptor  29.81 
 
 		 113 aa  61.2  0.000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2066  hypothetical protein  34.91 
 
 		 110 aa  56.2  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.347708  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0909  phage head-tail adaptor, putative  30.61 
 
 		 105 aa  56.6  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.824958 
 
 
-
 
NC_002936  DET1083  head-tail adaptor, putative  32 
 
 		 105 aa  56.6  0.0000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5157  phage head-tail adaptor  34.09 
 
 		 104 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.501903  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3321  phage head-tail adaptor, putative  34.91 
 
 		 111 aa  56.2  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0346563 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1342  phage head-tail adaptor  34.83 
 
 		 113 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.280086 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2697  phage head-tail adaptor, putative  34.15 
 
 		 117 aa  53.9  0.0000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0663  phage head-tail adaptor, putative  34.57 
 
 		 116 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1291  phage head-tail adaptor  34.48 
 
 		 105 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.184704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1582  putative phage head-tail adaptor  33.33 
 
 		 109 aa  53.1  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0128921  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7147  phage head-tail adaptor  26.85 
 
 		 117 aa  52.4  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00871215 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2233  phage head-tail adaptor, putative  32.26 
 
 		 112 aa  51.6  0.000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.921733 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1381  phage head-tail adaptor, putative  31.71 
 
 		 117 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00078456 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1050  phage head-tail adaptor, putative  28.41 
 
 		 109 aa  50.4  0.000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0938384  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0285  phage head-tail adaptor, putative  27.62 
 
 		 107 aa  49.7  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3587  phage head-tail adaptor, putative  34.57 
 
 		 116 aa  50.1  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0869  Bacteriophage head-tail adaptor protein  29.81 
 
 		 103 aa  50.1  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0406207  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3870  phage head-tail adaptor  26.14 
 
 		 109 aa  48.1  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.463779  normal  0.0202673 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1641  hypothetical protein  25.96 
 
 		 110 aa  48.1  0.00004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.857065  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1619  phage head-tail adaptor, putative  32.14 
 
 		 109 aa  48.1  0.00004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.171489  normal  0.258469 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3392  phage head-tail adaptor  27 
 
 		 113 aa  47.8  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.444321  hitchhiker  0.00000000238294 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2591  phage head-tail adaptor, putative  31.82 
 
 		 107 aa  47.8  0.00006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2626  phage head-tail adaptor, putative  31.82 
 
 		 107 aa  47.8  0.00006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1475  phage head-tail adaptor, putative  30.95 
 
 		 104 aa  47.8  0.00006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.514151 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1686  phage HK022 GP9-like protein  26.25 
 
 		 108 aa  47  0.00009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.488035 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1570  head-tail adaptor  34.83 
 
 		 113 aa  47  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00396333 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1775  phage head-tail adaptor, putative  26.67 
 
 		 110 aa  45.1  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.368112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3940  phage head-tail adaptor  32.05 
 
 		 108 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2831  phage head-tail adaptor  33.33 
 
 		 106 aa  43.5  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00173127  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0849  hypothetical protein  26.85 
 
 		 108 aa  43.5  0.001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0998433  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3895  phage head-tail adaptor  30 
 
 		 112 aa  42.4  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0300067 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1454  phage head-tail adaptor, putative  27.18 
 
 		 105 aa  40.8  0.006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.249307  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1886  phage head-tail adaptor, putative  23.33 
 
 		 105 aa  40.4  0.009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.590361  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>