25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR0591 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009505  BOV_0592  hypothetical protein  100 
 
 
112 aa  233  8e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0591  hypothetical protein  100 
 
 
112 aa  233  8e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1340  hypothetical protein  39.05 
 
 
107 aa  83.6  9e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0268917  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1135  phage head-tail adaptor, putative  33.33 
 
 
111 aa  60.5  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.573897 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3159  phage head-tail adaptor, putative  36.63 
 
 
106 aa  60.5  0.000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.182206  normal  0.0118931 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6053  putative phage tail-head adaptor  34.29 
 
 
111 aa  58.5  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1637  hypothetical protein  28.71 
 
 
108 aa  57  0.00000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1080  phage head-tail adaptor, putative  33.65 
 
 
111 aa  57  0.00000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.130936 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4970  phage head-tail adaptor  32.97 
 
 
117 aa  54.3  0.0000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000866578 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1652  phage head-tail adaptor  30.93 
 
 
104 aa  53.9  0.0000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1063  hypothetical protein  30.48 
 
 
112 aa  53.5  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0767089 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0909  phage head-tail adaptor, putative  28.71 
 
 
105 aa  52.4  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.824958 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0865  phage head-tail adaptor, putative  26.73 
 
 
109 aa  50.8  0.000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.913783 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2896  head-tail adaptor, putative  30.84 
 
 
116 aa  49.7  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.229996 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1814  hypothetical protein  31.18 
 
 
106 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00514089  normal  0.210861 
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4256  phage head-tail adaptor  26.6 
 
 
111 aa  48.5  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1427  phage head-tail adaptor  29.79 
 
 
113 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.157647  normal  0.2809 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2172  hypothetical protein  29.91 
 
 
112 aa  47  0.00009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1701  phage head-tail adaptor  29.55 
 
 
113 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.228407  normal  0.203712 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0630  phage head-tail adaptor  23.36 
 
 
109 aa  43.9  0.0007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1423  phage head-tail adaptor  31.71 
 
 
112 aa  43.1  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.239909 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5157  phage head-tail adaptor  25.24 
 
 
104 aa  42  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.501903  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4468  putative phage head-tail adaptor  21.5 
 
 
137 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000182332 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2596  phage head-tail adaptor, putative  23 
 
 
137 aa  41.6  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0281305 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7147  phage head-tail adaptor  23.58 
 
 
117 aa  40.4  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00871215 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>