40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1652 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_1652  phage head-tail adaptor  100 
 
 
104 aa  213  5.9999999999999996e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0865  phage head-tail adaptor, putative  52.38 
 
 
109 aa  102  2e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.913783 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4380  phage head-tail adaptor, putative  51.32 
 
 
110 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0630  phage head-tail adaptor  38.61 
 
 
109 aa  77.4  0.00000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3392  phage head-tail adaptor  35.92 
 
 
113 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.444321  hitchhiker  0.00000000238294 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1716  phage head-tail adaptor, putative  34.95 
 
 
108 aa  67.8  0.00000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0909  phage head-tail adaptor, putative  38.61 
 
 
105 aa  63.2  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.824958 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2591  phage head-tail adaptor, putative  33.66 
 
 
107 aa  62  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1461  phage head-tail adaptor  35.79 
 
 
109 aa  61.2  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3800  hypothetical protein  34.86 
 
 
118 aa  60.5  0.000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4088  hypothetical protein  34.86 
 
 
118 aa  60.5  0.000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1291  phage head-tail adaptor  38.24 
 
 
105 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.184704  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5157  phage head-tail adaptor  34.91 
 
 
104 aa  58.9  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.501903  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4110  phage head-tail adaptor, putative  37.78 
 
 
114 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2626  phage head-tail adaptor, putative  29.7 
 
 
107 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0592  hypothetical protein  30.93 
 
 
112 aa  53.9  0.0000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0591  hypothetical protein  30.93 
 
 
112 aa  53.9  0.0000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3587  phage head-tail adaptor, putative  27.06 
 
 
116 aa  53.5  0.0000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1622  phage head-tail adaptor, putative  33.33 
 
 
109 aa  52.8  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.400752 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2960  hypothetical protein  35.78 
 
 
120 aa  52.8  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2233  phage head-tail adaptor, putative  34.26 
 
 
112 aa  51.2  0.000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.921733 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2589  phage head-tail adaptor  33.33 
 
 
120 aa  50.4  0.000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.939833  normal  0.722848 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1381  phage head-tail adaptor, putative  27.91 
 
 
117 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00078456 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3159  phage head-tail adaptor, putative  31.73 
 
 
106 aa  48.5  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.182206  normal  0.0118931 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3940  phage head-tail adaptor  32.08 
 
 
108 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1570  head-tail adaptor  40 
 
 
113 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00396333 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0663  phage head-tail adaptor, putative  27.06 
 
 
116 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1775  phage head-tail adaptor, putative  32.38 
 
 
110 aa  47.4  0.00006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.368112  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7147  phage head-tail adaptor  26.61 
 
 
117 aa  47.4  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00871215 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1686  phage HK022 GP9-like protein  34.62 
 
 
108 aa  46.6  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.488035 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1342  phage head-tail adaptor  36.67 
 
 
113 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.280086 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2697  phage head-tail adaptor, putative  26.74 
 
 
117 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1050  phage head-tail adaptor, putative  27.45 
 
 
109 aa  44.3  0.0006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0938384  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4000  phage head-tail adaptor, putative  27.78 
 
 
114 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0653  Phage head-tail adaptor, putative  37.5 
 
 
116 aa  43.5  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.305971  n/a   
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4256  phage head-tail adaptor  29.25 
 
 
111 aa  43.5  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1340  hypothetical protein  29.81 
 
 
107 aa  42.4  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0268917  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4468  putative phage head-tail adaptor  26.47 
 
 
137 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000182332 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1080  phage head-tail adaptor, putative  28.71 
 
 
111 aa  41.6  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.130936 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2896  head-tail adaptor, putative  33 
 
 
116 aa  40.8  0.006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.229996 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>