15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A4468 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011094  SeSA_A4468  putative phage head-tail adaptor  100 
 
 
137 aa  285  1e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000182332 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2260  putative phage head-tail adaptor  73.44 
 
 
134 aa  201  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.710189  normal  0.0451218 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2263  putative phage head-tail adaptor  72.66 
 
 
134 aa  200  6e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000011427 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2596  phage head-tail adaptor, putative  59.65 
 
 
137 aa  150  4e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0281305 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3874  hypothetical protein  41.44 
 
 
124 aa  94.4  5e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0495687 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0909  phage head-tail adaptor, putative  31 
 
 
105 aa  61.2  0.000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.824958 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1340  hypothetical protein  30.48 
 
 
107 aa  59.3  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0268917  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3800  hypothetical protein  25.23 
 
 
118 aa  48.1  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4088  hypothetical protein  25.23 
 
 
118 aa  48.1  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4000  phage head-tail adaptor, putative  23.36 
 
 
114 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1622  phage head-tail adaptor, putative  28.57 
 
 
109 aa  42.7  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.400752 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1775  phage head-tail adaptor, putative  29.91 
 
 
110 aa  43.1  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.368112  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0591  hypothetical protein  21.5 
 
 
112 aa  42  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0592  hypothetical protein  21.5 
 
 
112 aa  42  0.003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1652  phage head-tail adaptor  26.47 
 
 
104 aa  42  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>