38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0909 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0909  phage head-tail adaptor, putative  100 
 
 		 105 aa  207  3e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.824958 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3159  phage head-tail adaptor, putative  40.2 
 
 		 106 aa  66.2  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.182206  normal  0.0118931 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1340  hypothetical protein  35.64 
 
 		 107 aa  64.7  0.0000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0268917  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1652  phage head-tail adaptor  38.61 
 
 		 104 aa  63.2  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4468  putative phage head-tail adaptor  31 
 
 		 137 aa  61.2  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000182332 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1701  phage head-tail adaptor  38.95 
 
 		 113 aa  61.2  0.000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.228407  normal  0.203712 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1427  phage head-tail adaptor  37.89 
 
 		 113 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.157647  normal  0.2809 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2260  putative phage head-tail adaptor  29.29 
 
 		 134 aa  59.7  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.710189  normal  0.0451218 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2263  putative phage head-tail adaptor  28.28 
 
 		 134 aa  58.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000011427 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4970  phage head-tail adaptor  34.65 
 
 		 117 aa  57  0.00000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000866578 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0865  phage head-tail adaptor, putative  36 
 
 		 109 aa  56.6  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.913783 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1716  phage head-tail adaptor, putative  30.61 
 
 		 108 aa  56.6  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4088  hypothetical protein  31.13 
 
 		 118 aa  55.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3800  hypothetical protein  31.13 
 
 		 118 aa  55.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4380  phage head-tail adaptor, putative  33.67 
 
 		 110 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0592  hypothetical protein  28.71 
 
 		 112 aa  52.4  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0591  hypothetical protein  28.71 
 
 		 112 aa  52.4  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1461  phage head-tail adaptor  29.81 
 
 		 109 aa  51.2  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1423  phage head-tail adaptor  38.64 
 
 		 112 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.239909 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0630  phage head-tail adaptor  26.92 
 
 		 109 aa  48.5  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4000  phage head-tail adaptor, putative  28.57 
 
 		 114 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1083  head-tail adaptor, putative  27.62 
 
 		 105 aa  48.1  0.00004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2233  phage head-tail adaptor, putative  32.69 
 
 		 112 aa  45.8  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.921733 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2019  hypothetical protein  28.04 
 
 		 111 aa  45.8  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3587  phage head-tail adaptor, putative  30.49 
 
 		 116 aa  45.1  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4110  phage head-tail adaptor, putative  28 
 
 		 114 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1725  hypothetical protein  27.36 
 
 		 112 aa  44.7  0.0005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0406142  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1756  phage head-tail adaptor, putative  32.63 
 
 		 118 aa  44.3  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.781431 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0332  hypothetical protein  27.1 
 
 		 111 aa  44.3  0.0006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1637  hypothetical protein  32.99 
 
 		 108 aa  44.3  0.0006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2596  phage head-tail adaptor, putative  23 
 
 		 137 aa  42.4  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0281305 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1381  phage head-tail adaptor, putative  28.92 
 
 		 117 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00078456 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2482  hypothetical protein  28.16 
 
 		 105 aa  41.2  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1641  hypothetical protein  31.63 
 
 		 110 aa  41.2  0.005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.857065  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3940  phage head-tail adaptor  33.82 
 
 		 108 aa  40.8  0.006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4256  phage head-tail adaptor  27.96 
 
 		 111 aa  40.4  0.008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1135  phage head-tail adaptor, putative  28.3 
 
 		 111 aa  40  0.01  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.573897 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1686  phage HK022 GP9-like protein  28.12 
 
 		 108 aa  40  0.01  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.488035 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>