19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_1886 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_1886  phage head-tail adaptor, putative  100 
 
 		 105 aa  210  5.999999999999999e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.590361  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1619  phage head-tail adaptor, putative  61 
 
 		 109 aa  127  4.0000000000000003e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.171489  normal  0.258469 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1475  phage head-tail adaptor, putative  60 
 
 		 104 aa  123  7e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.514151 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0285  phage head-tail adaptor, putative  48.57 
 
 		 107 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1368  phage head-tail adaptor, putative  44.23 
 
 		 107 aa  98.2  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.504949 
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5449  hypothetical protein  51.55 
 
 		 108 aa  96.7  9e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0869  Bacteriophage head-tail adaptor protein  43.14 
 
 		 103 aa  89  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0406207  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6046  hypothetical protein  46.15 
 
 		 104 aa  84.7  4e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6189  Bacteriophage head-tail adaptor  46.15 
 
 		 106 aa  83.6  9e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.905636  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2482  hypothetical protein  40.82 
 
 		 105 aa  76.6  0.0000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3986  phage head-tail adaptor  41.58 
 
 		 106 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0865  phage head-tail adaptor, putative  35.63 
 
 		 109 aa  60.1  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.913783 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1291  phage head-tail adaptor  33.33 
 
 		 105 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.184704  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1686  phage HK022 GP9-like protein  33.33 
 
 		 108 aa  47  0.00009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.488035 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1775  phage head-tail adaptor, putative  30.39 
 
 		 110 aa  43.9  0.0007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.368112  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4380  phage head-tail adaptor, putative  28.26 
 
 		 110 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2233  phage head-tail adaptor, putative  34.67 
 
 		 112 aa  43.5  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.921733 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1622  phage head-tail adaptor, putative  32.22 
 
 		 109 aa  42  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.400752 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1716  phage head-tail adaptor, putative  23.33 
 
 		 108 aa  40.4  0.009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>