21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_6189 on replicon NC_011988
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011988  Avi_6189  Bacteriophage head-tail adaptor  100 
 
 		 106 aa  214  4e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.905636  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1886  phage head-tail adaptor, putative  46.15 
 
 		 105 aa  83.6  9e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.590361  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1619  phage head-tail adaptor, putative  37.14 
 
 		 109 aa  66.2  0.0000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.171489  normal  0.258469 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2482  hypothetical protein  36.63 
 
 		 105 aa  64.3  0.0000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1475  phage head-tail adaptor, putative  36.19 
 
 		 104 aa  60.8  0.000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.514151 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0285  phage head-tail adaptor, putative  35.58 
 
 		 107 aa  60.1  0.000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3800  hypothetical protein  34.69 
 
 		 118 aa  52.8  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4088  hypothetical protein  34.69 
 
 		 118 aa  52.8  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3986  phage head-tail adaptor  34.31 
 
 		 106 aa  51.6  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5449  hypothetical protein  32.99 
 
 		 108 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1368  phage head-tail adaptor, putative  31.78 
 
 		 107 aa  48.9  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.504949 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1686  phage HK022 GP9-like protein  34.09 
 
 		 108 aa  47.4  0.00007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.488035 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1775  phage head-tail adaptor, putative  29.52 
 
 		 110 aa  47  0.00008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.368112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6046  hypothetical protein  36.04 
 
 		 104 aa  46.6  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2591  phage head-tail adaptor, putative  28.24 
 
 		 107 aa  45.1  0.0004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2233  phage head-tail adaptor, putative  34.44 
 
 		 112 aa  43.9  0.0007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.921733 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0869  Bacteriophage head-tail adaptor protein  32.11 
 
 		 103 aa  43.9  0.0008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0406207  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6246  bacteriophage head-tail adaptor  29.63 
 
 		 105 aa  43.9  0.0008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00138963  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1622  phage head-tail adaptor, putative  26.92 
 
 		 109 aa  43.1  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.400752 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0865  phage head-tail adaptor, putative  31.68 
 
 		 109 aa  42.4  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.913783 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4000  phage head-tail adaptor, putative  28.57 
 
 		 114 aa  42  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>