More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0193 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_2263  GTP-binding protein EngA  70.68 
 
 
506 aa  696    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0193  GTP-binding protein EngA  100 
 
 
495 aa  1008    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0062  GTP-binding protein EngA  63.03 
 
 
455 aa  622  1e-177  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1477  GTP-binding protein EngA  61.62 
 
 
454 aa  607  9.999999999999999e-173  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0504  GTP-binding protein EngA  46.72 
 
 
441 aa  436  1e-121  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0192  GTP-binding protein EngA  42.57 
 
 
445 aa  402  1e-111  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1630  small GTP-binding protein  36.51 
 
 
440 aa  317  4e-85  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.52918  hitchhiker  0.00197431 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1406  GTP-binding protein EngA  39.79 
 
 
439 aa  317  4e-85  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0340673  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2131  GTP-binding protein EngA  35.85 
 
 
441 aa  305  1.0000000000000001e-81  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000643599  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3587  small GTP-binding protein  37.35 
 
 
495 aa  302  8.000000000000001e-81  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.748458  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10530  small GTP-binding protein  36.21 
 
 
438 aa  301  2e-80  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3526  GTP-binding protein EngA  37.9 
 
 
494 aa  300  4e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.928011 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1832  GTP-binding protein EngA  37.63 
 
 
445 aa  298  1e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.519459 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6271  GTP-binding protein EngA  37.63 
 
 
445 aa  298  1e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1808  GTP-binding protein EngA  37.63 
 
 
445 aa  298  1e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5109  GTP-binding protein EngA  37.42 
 
 
445 aa  297  2e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.314704  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3381  GTP-binding protein EngA  37.99 
 
 
441 aa  298  2e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000285965  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1701  ribosome-associated GTPase EngA  37.53 
 
 
444 aa  297  3e-79  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0307524  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2108  GTP-binding protein EngA  37.63 
 
 
443 aa  296  4e-79  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000750275  normal  0.342829 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1809  small GTP-binding protein  37.85 
 
 
446 aa  297  4e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000018958  normal  0.445899 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2126  GTP-binding protein EngA  36.62 
 
 
449 aa  296  5e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.127058  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2146  GTP-binding protein EngA  37.42 
 
 
493 aa  296  6e-79  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1160  GTP-binding protein EngA  36.79 
 
 
439 aa  296  6e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0769833  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1746  GTP-binding protein EngA  37.22 
 
 
445 aa  296  7e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1719  GTP-binding protein EngA  37.02 
 
 
445 aa  295  2e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.576586 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1416  GTP-binding protein EngA  36.42 
 
 
446 aa  295  2e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000592606 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1204  GTP-binding protein EngA  35.25 
 
 
442 aa  294  3e-78  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.109244  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1467  GTP-binding protein EngA  37.22 
 
 
445 aa  293  4e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.496612  normal  0.453892 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1075  small GTP-binding protein  37.25 
 
 
438 aa  293  4e-78  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2159  GTP-binding protein EngA  35.48 
 
 
436 aa  293  5e-78  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000018961  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1325  hypothetical protein  36.92 
 
 
441 aa  292  1e-77  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2238  GTP-binding protein EngA  37.02 
 
 
445 aa  291  2e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.746998  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0596  GTP-binding protein EngA  37.94 
 
 
467 aa  291  2e-77  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.115321  hitchhiker  0.00000000000000451977 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0751  GTP-binding protein EngA  35.35 
 
 
440 aa  290  3e-77  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0460  GTP-binding protein EngA  36.72 
 
 
436 aa  290  3e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2155  GTP-binding protein EngA  39.18 
 
 
471 aa  291  3e-77  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.616734  normal  0.133544 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0789  small GTP-binding protein  38.09 
 
 
443 aa  290  5.0000000000000004e-77  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000826073  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1414  GTP-binding protein EngA  35.52 
 
 
436 aa  290  6e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1386  GTP-binding protein EngA  35.52 
 
 
436 aa  290  6e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.844345  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1386  GTP-binding protein EngA  35.52 
 
 
436 aa  290  6e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0845142  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1525  GTP-binding protein EngA  35.52 
 
 
436 aa  290  6e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1559  GTP-binding protein EngA  35.52 
 
 
436 aa  290  6e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0922672  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1667  GTP-binding protein EngA  35.52 
 
 
436 aa  290  6e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000514041  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1598  GTP-binding protein EngA  35.52 
 
 
436 aa  290  6e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000589883 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1631  GTP-binding protein EngA  35.52 
 
 
436 aa  288  1e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2223  GTP-binding protein EngA  36.82 
 
 
445 aa  288  1e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2185  GTP-binding protein EngA  36.82 
 
 
445 aa  288  1e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.880216  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1341  GTP-binding protein EngA  36.82 
 
 
445 aa  288  1e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.380293  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1102  GTP-binding protein EngA  36.82 
 
 
445 aa  288  1e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.90536  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2350  GTP-binding protein EngA  36.82 
 
 
445 aa  288  1e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1227  GTP-binding protein EngA  35.17 
 
 
436 aa  288  1e-76  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.718862  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0066  GTP-binding protein EngA  36.82 
 
 
445 aa  288  1e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.225046  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2134  GTP-binding protein EngA  36.86 
 
 
458 aa  288  2e-76  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0583205  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1830  GTP-binding protein EngA  36.82 
 
 
460 aa  287  2e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0644  GTP-binding protein EngA  34.81 
 
 
455 aa  287  2e-76  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.768693  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0598  GTP-binding protein EngA  36.44 
 
 
469 aa  287  2.9999999999999996e-76  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.428629 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2292  GTP-binding protein EngA  39.07 
 
 
465 aa  286  5e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0406895  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1177  GTP-binding protein  34.49 
 
 
441 aa  286  5.999999999999999e-76  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1224  ribosome-associated GTPase EngA  38.71 
 
 
447 aa  286  5.999999999999999e-76  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2632  small GTP-binding protein  37.3 
 
 
434 aa  286  8e-76  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1395  GTP-binding protein EngA  34.36 
 
 
441 aa  286  9e-76  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01071  GTP-binding protein EngA  36.45 
 
 
498 aa  285  1.0000000000000001e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1322  small GTP-binding protein domain-containing protein  36.86 
 
 
438 aa  285  1.0000000000000001e-75  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.270933 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2204  GTP-binding protein EngA  39.07 
 
 
465 aa  285  1.0000000000000001e-75  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.199328  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2537  GTP-binding protein EngA  36.49 
 
 
445 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0358302  hitchhiker  0.0000595621 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1598  GTP-binding protein EngA  36.62 
 
 
445 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0111864  normal  0.122269 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1654  GTP-binding protein EngA  38.62 
 
 
465 aa  284  3.0000000000000004e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004345  GTP-binding protein EngA  36.06 
 
 
498 aa  284  3.0000000000000004e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2028  GTP-binding protein EngA  34.61 
 
 
455 aa  283  4.0000000000000003e-75  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.89204  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2008  GTP-binding protein EngA  35.32 
 
 
438 aa  283  5.000000000000001e-75  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1726  GTP-binding protein EngA  35.32 
 
 
438 aa  283  5.000000000000001e-75  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.138722  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1983  GTP-binding protein EngA  34.27 
 
 
439 aa  282  8.000000000000001e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4633  GTP-binding protein EngA  37.02 
 
 
511 aa  282  8.000000000000001e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3492  small GTP-binding protein  35.67 
 
 
473 aa  281  1e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.166224 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2045  GTP-binding protein EngA  34.68 
 
 
464 aa  281  1e-74  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1428  GTP-binding protein EngA  33.88 
 
 
436 aa  281  2e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3106  GTP-binding protein EngA  36.2 
 
 
479 aa  281  2e-74  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.564911 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3785  GTP-binding protein EngA  34.09 
 
 
436 aa  281  2e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0456792  normal  0.0699486 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2314  GTP-binding protein EngA  35.22 
 
 
439 aa  280  3e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1172  small GTP-binding protein  37.6 
 
 
438 aa  280  3e-74  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1131  GTP-binding protein EngA  35.85 
 
 
473 aa  280  5e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2102  GTP-binding protein EngA  35.28 
 
 
447 aa  280  6e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0508209  normal  0.0433282 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3149  GTP-binding protein EngA  34.96 
 
 
441 aa  279  8e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.421281  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2203  ribosome-associated GTPase EngA  35.88 
 
 
567 aa  279  1e-73  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2225  GTP-binding protein EngA  35.99 
 
 
438 aa  278  1e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1043  GTP-binding protein EngA  34.58 
 
 
436 aa  278  1e-73  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.617691  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2082  GTP-binding protein EngA  35.92 
 
 
447 aa  278  1e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.543675  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1155  GTP-binding protein EngA  35.5 
 
 
447 aa  278  2e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.487635  normal  0.554707 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3776  GTP-binding protein EngA  36.6 
 
 
456 aa  278  2e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0350234  normal  0.961635 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1614  GTP-binding protein EngA  34.81 
 
 
499 aa  277  3e-73  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00106208 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1287  GTP-binding protein EngA  33.74 
 
 
454 aa  276  4e-73  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.720297  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1727  GTP-binding protein EngA  35.63 
 
 
448 aa  276  6e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1219  GTP-binding protein EngA  35.8 
 
 
447 aa  276  7e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0055991  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2981  GTP-binding protein EngA  33.6 
 
 
443 aa  276  7e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1063  GTP-binding protein EngA  35.09 
 
 
447 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3751  GTP-binding protein EngA  35.21 
 
 
449 aa  274  2.0000000000000002e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1726  GTP-binding protein EngA  33.2 
 
 
456 aa  274  2.0000000000000002e-72  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1937  GTP-binding protein EngA  37.12 
 
 
449 aa  275  2.0000000000000002e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1609  GTP-binding protein EngA  37.12 
 
 
449 aa  275  2.0000000000000002e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0528486 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04431  GTP-binding protein EngA  33.4 
 
 
456 aa  275  2.0000000000000002e-72  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0422674  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>