26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1108 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_1108  endo-1,4-beta-xylanase-like protein  100 
 
 
258 aa  518  1e-146  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.591273 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0631  hypothetical protein  50.24 
 
 
256 aa  206  4e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0593  hypothetical protein  42.36 
 
 
335 aa  168  9e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000608871  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2611  hypothetical protein  19.92 
 
 
236 aa  60.5  0.00000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.340696  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2297  hypothetical protein  19.25 
 
 
236 aa  59.7  0.00000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0098  hypothetical protein  24.06 
 
 
239 aa  58.9  0.00000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.51381  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2905  hypothetical protein  29.23 
 
 
265 aa  57.4  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0767  hypothetical protein  29.25 
 
 
231 aa  55.8  0.0000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0758  hypothetical protein  30.15 
 
 
281 aa  55.5  0.0000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0543513  normal  0.305002 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0749  hypothetical protein  29.25 
 
 
231 aa  55.1  0.000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2663  hypothetical protein  31.61 
 
 
293 aa  55.1  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0705071 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3237  hypothetical protein  23.66 
 
 
215 aa  52.4  0.000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0141  putative dynein heavy chain  26.02 
 
 
370 aa  51.6  0.00001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000369337  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0079  hypothetical protein  32.43 
 
 
281 aa  51.2  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00271867  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1074  hypothetical protein  26.73 
 
 
227 aa  50.1  0.00004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0066  hypothetical protein  24.66 
 
 
384 aa  49.3  0.00006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0761  hypothetical protein  29.75 
 
 
271 aa  47.8  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0717  hypothetical protein  18.82 
 
 
418 aa  47.4  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3184  hypothetical protein  29.3 
 
 
380 aa  45.8  0.0007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3509  hypothetical protein  28.19 
 
 
380 aa  44.7  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00457294 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1249  hypothetical protein  25.76 
 
 
315 aa  44.7  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4738  hypothetical protein  20.33 
 
 
247 aa  43.9  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000151307  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5055  hypothetical protein  23.02 
 
 
247 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.252391  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3541  hypothetical protein  25.56 
 
 
262 aa  43.1  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.509616 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0104  hypothetical protein  22.43 
 
 
386 aa  43.1  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0466  hypothetical protein  24.11 
 
 
251 aa  42.4  0.007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>