26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_1561 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011661  Dtur_1561  hypothetical protein  100 
 
 		 369 aa  753    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2532  Peptide chain release factor 1 (eRF1)-like protein  24.54 
 
 		 405 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.023153  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0601  hypothetical protein  23.95 
 
 		 388 aa  108  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.427399  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4458  hypothetical protein  21.23 
 
 		 417 aa  90.9  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.555238  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3445  hypothetical protein  22.44 
 
 		 380 aa  85.5  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.119967  normal  0.631026 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4439  hypothetical protein  21.23 
 
 		 417 aa  85.9  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.580463  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4445  hypothetical protein  21.21 
 
 		 418 aa  84.3  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1222  hypothetical protein  20.89 
 
 		 354 aa  61.6  0.00000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000273501  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1077  peptide chain release factor 1  24.56 
 
 		 406 aa  59.7  0.00000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2897  hypothetical protein  22.9 
 
 		 378 aa  58.9  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.200479 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0519  peptide chain release factor 1  25.26 
 
 		 410 aa  57.4  0.0000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0170  peptide chain release factor 1  21.21 
 
 		 416 aa  53.9  0.000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.579625  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1417  peptide chain release factor 1  21.52 
 
 		 419 aa  52.4  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80337  transcriptional release factor (ERF1)  21.21 
 
 		 436 aa  51.6  0.00002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.565887  normal  0.0934364 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_49593  predicted protein  20.27 
 
 		 442 aa  50.8  0.00004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0646612 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3609  hypothetical protein  22.67 
 
 		 393 aa  50.4  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0518753  normal  0.506408 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1331  hypothetical protein  21.45 
 
 		 390 aa  50.1  0.00006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.252381  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1738  peptide chain release factor 1  22.05 
 
 		 414 aa  49.7  0.00008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3174  eRF1 domain 2 protein  21.4 
 
 		 419 aa  49.7  0.00009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08853  ERF1_PODAN Eukaryotic peptide chain release factor subunit 1 (ERF1) (Eukaryotic release factor 1)Eukaryotic polypeptide releasing factor ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8NJX9]  20.76 
 
 		 435 aa  48.9  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0359  peptide chain release factor 1  19.76 
 
 		 413 aa  47  0.0005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3138  eRF1 domain 2 protein  20.15 
 
 		 358 aa  46.6  0.0007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0803  eRF1 domain 2 protein  25.38 
 
 		 362 aa  45.1  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.327122  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0918  hypothetical protein  20.98 
 
 		 391 aa  43.1  0.007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00435551  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1818  peptide chain release factor 1  27.21 
 
 		 385 aa  43.1  0.008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0364142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4586  hypothetical protein  20.05 
 
 		 391 aa  43.1  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.48591  normal  0.0398541 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>