19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_1110 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_1110  putative signal peptide protein  100 
 
 		 167 aa  332  1e-90  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1190  putative signal peptide protein  99.4 
 
 		 167 aa  330  6e-90  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.672558  normal  0.403432 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1443  putative signal peptide protein  69.82 
 
 		 172 aa  231  3e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3153  putative signal peptide protein  61.82 
 
 		 179 aa  196  1.0000000000000001e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5001  putative signal peptide protein  60.93 
 
 		 167 aa  188  2.9999999999999997e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1633  putative signal peptide protein  54.82 
 
 		 168 aa  167  9e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2980  putative signal peptide protein  52.12 
 
 		 180 aa  158  3e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1808  putative signal peptide protein  52.9 
 
 		 170 aa  140  6e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000025679 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2779  putative signal peptide protein  48.7 
 
 		 172 aa  136  2e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.881976  normal  0.0394345 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3582  putative signal peptide protein  50.68 
 
 		 163 aa  107  8.000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2061  putative signal peptide protein  40.65 
 
 		 157 aa  100  9e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00788966  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2075  putative signal peptide protein  46.58 
 
 		 171 aa  95.1  4e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.865285 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1259  putative signal peptide protein  39.24 
 
 		 170 aa  94.7  5e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.852163  normal  0.617391 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1087  conserved hypothetical signal peptide protein  39.62 
 
 		 174 aa  87  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1180  putative signal peptide protein  39.62 
 
 		 174 aa  86.7  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2056  putative signal peptide protein  37.57 
 
 		 188 aa  82.4  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3649  hypothetical protein  29.53 
 
 		 161 aa  48.5  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.197087  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2502  hypothetical protein  30 
 
 		 154 aa  47.4  0.00009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3762  hypothetical protein  29.86 
 
 		 148 aa  41.6  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.118214 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>